Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 OSW5YMR148W 447 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 ARF3YOR094W 552 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 ETR1YBR026C 1143 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 TIP1YBR067C 633 nt7.39□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 MIG1YGL035C 1515 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 RUB1YDR139C 234 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 ICT1YLR099C 1185 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 SFH1YLR321C 1281 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 RPC19YNL113W 429 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YOR029WYOR029W 336 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 MCA1YOR197W 1299 nt7.38□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 PFS2YNL317W 1398 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 SOL2YCR073W-A 948 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 ARG82YDR173C 1068 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 SWM1YDR260C 513 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 MXR1YER042W 555 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 RPF1YHR088W 888 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 NMA1YLR328W 1206 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 DDR48YMR173W 1293 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YBR116CYBR116C 528 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 GFA1YKL104C 2154 nt7.37□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 EFM1YHL039W 1758 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 AIM10YER087W 1731 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 MET17YLR303W 1335 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 KTR6YPL053C 1341 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 ASP1YDR321W 1146 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 TYS1YGR185C 1185 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YJR141WYJR141W 1044 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YKL023WYKL023W 834 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YKL031WYKL031W 414 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 CPT1YNL130C 1182 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 SPS19YNL202W 879 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YNL320WYNL320W 855 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 UIP4YPL186C 915 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 MRPL37YBR268W 318 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 DUN1YDL101C 1542 nt7.36□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 FYV1YDR024W 486 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 NUP42YDR192C 1293 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YER165C-AYER165C-A 357 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 COS12YGL263W 1143 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 LDS1YAL018C 978 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 ILM1YJR118C 612 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YLR101CYLR101C 396 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 SNO4YMR322C 714 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 MIX23YBL107C 591 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 IAH1YOR126C 717 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 PNT1YOR266W 1272 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 HSP33YOR391C 714 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 HSP32YPL280W 714 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 POL30YBR088C 777 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 LAP2YNL045W 2016 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 PHO3YBR092C 1404 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.35□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YNL247WYNL247W 2304 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 HSV2YGR223C 1347 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 SRY1YKL218C 981 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 COS9YKL219W 1224 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YBL077WYBL077W 432 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 RRG9YNL213C 645 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 IRC13YOR235W 315 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 IML3YBR107C 738 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 YCL049CYCL049C 939 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 SLT2YHR030C 1455 nt7.34□□□□□ -1.23
TY1A-BRQ12217 EHT1YBR177C 1356 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 CRN1YLR429W 1956 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 NPL4YBR170C 1743 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 NOP8YOL144W 1455 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 HSP42YDR171W 1128 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YDR467CYDR467C 327 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 RPL22BYFL034C-A 369 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 NPA3YJR072C 1158 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YJU2YKL095W 837 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 EMC3YKL207W 762 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 BET3YKR068C 582 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 GSP1YLR293C 660 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 CDC73YLR418C 1182 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 RNA1YMR235C 1224 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 PUP1YOR157C 786 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 ATP4YPL078C 735 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 GIP2YER054C 1647 nt7.33□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 AFG2YLR397C 2343 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 SLM3YDL033C 1254 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 NPY1YGL067W 1155 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 GLG2YJL137C 1143 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 LOT5YKL183W 921 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 SPC3YLR066W 555 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 FYV12YOR183W 390 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 PLP2YOR281C 861 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 SUV3YPL029W 2214 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 AAT1YKL106W 1356 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 ERG8YMR220W 1356 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 TMA64YDR117C 1698 nt7.32□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 TRM11YOL124C 1302 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YGR293CYGR293C 462 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 PUT1YLR142W 1431 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YMR082CYMR082C 357 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 TOA1YOR194C 861 nt7.31□□□□□ -1.24
TY1A-BRQ12217 YBR300CYBR300C 498 nt7.31□□□□□ -1.24
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