Protein–RNA interactions for Protein: P61026

RAB10, Ras-related protein Rab-10, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB10P61026 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB10P61026 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB10P61026 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB10P61026 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB10P61026 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB10P61026 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB10P61026 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB10P61026 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB10P61026 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB10P61026 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB10P61026 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB10P61026 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB10P61026 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB10P61026 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB10P61026 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB10P61026 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB10P61026 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB10P61026 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB10P61026 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB10P61026 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB10P61026 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB10P61026 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB10P61026 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB10P61026 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB10P61026 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB10P61026 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB10P61026 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB10P61026 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB10P61026 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB10P61026 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB10P61026 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB10P61026 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB10P61026 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB10P61026 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB10P61026 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB10P61026 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB10P61026 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB10P61026 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB10P61026 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB10P61026 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB10P61026 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB10P61026 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB10P61026 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB10P61026 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB10P61026 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB10P61026 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB10P61026 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB10P61026 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB10P61026 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB10P61026 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB10P61026 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAB10P61026 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB10P61026 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB10P61026 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB10P61026 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB10P61026 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB10P61026 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB10P61026 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB10P61026 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB10P61026 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB10P61026 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB10P61026 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB10P61026 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB10P61026 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB10P61026 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB10P61026 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB10P61026 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB10P61026 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB10P61026 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB10P61026 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB10P61026 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB10P61026 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB10P61026 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB10P61026 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB10P61026 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB10P61026 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB10P61026 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB10P61026 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB10P61026 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB10P61026 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB10P61026 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB10P61026 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB10P61026 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB10P61026 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB10P61026 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB10P61026 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB10P61026 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms