Protein–RNA interactions for Protein: P0DME0

SETSIP, Protein SETSIP, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETSIPP0DME0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
SETSIPP0DME0 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SETSIPP0DME0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SETSIPP0DME0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms