Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
GOLGA6CA6NDK9 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GOLGA6CA6NDK9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms