Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RABGEF1Q9UJ41 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
RABGEF1Q9UJ41 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RABGEF1Q9UJ41 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
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