Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH17

APOBEC3B, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3BQ9UH17 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
APOBEC3BQ9UH17 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APOBEC3BQ9UH17 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms