Protein–RNA interactions for Protein: Q96PR1

KCNC2, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC2Q96PR1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNC2Q96PR1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNC2Q96PR1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
KCNC2Q96PR1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms