Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAP3Q96FM1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGAP3Q96FM1 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms