Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PPP4R4Q6NUP7 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PPP4R4Q6NUP7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PPP4R4Q6NUP7 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms