Protein–RNA interactions for Protein: Q12491

TY2B-B, Transposon Ty2-B Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,770 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2B-BQ12491 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt7.52□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 RPL7BYPL198W 735 nt7.52□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 REI1YBR267W 1182 nt7.52□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 ARF2YDL137W 546 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 RGS2YOR107W 930 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 SAC6YDR129C 1929 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 NQM1YGR043C 1002 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 DCS2YOR173W 1062 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 MRI1YPR118W 1236 nt7.51□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 CIA2YHR122W 696 nt7.5□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 NHP6BYBR089C-A 300 nt7.5□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 YFL042CYFL042C 2025 nt7.49□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 RFC2YJR068W 1062 nt7.49□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 POP3YNL282W 588 nt7.49□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 BRF1YGR246C 1791 nt7.49□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 CEF1YMR213W 1773 nt7.49□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 SNT2YGL131C 4212 nt7.49□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 HIR2YOR038C 2628 nt7.48□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 ELC1YPL046C 300 nt7.48□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 HPF1YOL155C 2904 nt7.47□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 CHO1YER026C 831 nt7.47□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 ISU2YOR226C 471 nt7.47□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 MSB3YNL293W 1902 nt7.46□□□□□ -1.21
TY2B-BQ12491 MNN4YKL201C 3537 nt7.46□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 CLN1YMR199W 1641 nt7.46□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 BIM1YER016W 1035 nt7.46□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 SPR6YER115C 576 nt7.46□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt7.46□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt7.46□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt7.46□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 SUT1YGL162W 900 nt7.46□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 MTW1YAL034W-A 870 nt7.46□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 SSH4YKL124W 1740 nt7.45□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt7.45□□□□□ -1.22
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TY2B-BQ12491 PDC1YLR044C 1692 nt7.45□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 CTS1YLR286C 1689 nt7.45□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 YFL034WYFL034W 3222 nt7.45□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 CTR2YHR175W 570 nt7.44□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 YPL199CYPL199C 723 nt7.44□□□□□ -1.22
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TY2B-BQ12491 URE2YNL229C 1065 nt7.43□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 AIF1YNR074C 1137 nt7.43□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 GMC1YDR506C 1827 nt7.43□□□□□ -1.22
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TY2B-BQ12491 HOR7YMR251W-A 180 nt7.43□□□□□ -1.22
TY2B-BQ12491 MRPL15YLR312W-A 762 nt7.42□□□□□ -1.22
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TY2B-BQ12491 ATG26YLR189C 3597 nt7.41□□□□□ -1.22
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TY2B-BQ12491 YGR066CYGR066C 879 nt7.41□□□□□ -1.22
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TY2B-BQ12491 SAP30YMR263W 606 nt7.41□□□□□ -1.22
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TY2B-BQ12491 UMP1YBR173C 447 nt7.41□□□□□ -1.22
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TY2B-BQ12491 KTR5YNL029C 1569 nt7.38□□□□□ -1.23
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TY2B-BQ12491 YGP1YNL160W 1065 nt7.36□□□□□ -1.23
TY2B-BQ12491 TIP41YPR040W 1071 nt7.36□□□□□ -1.23
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TY2B-BQ12491 THI5YFL058W 1023 nt7.35□□□□□ -1.23
TY2B-BQ12491 THI12YNL332W 1023 nt7.35□□□□□ -1.23
TY2B-BQ12491 YJR124CYJR124C 1347 nt7.35□□□□□ -1.23
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TY2B-BQ12491 ALD3YMR169C 1521 nt7.34□□□□□ -1.23
TY2B-BQ12491 ALD2YMR170C 1521 nt7.34□□□□□ -1.23
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TY2B-BQ12491 ADE3YGR204W 2841 nt7.34□□□□□ -1.23
TY2B-BQ12491 YPL278CYPL278C 303 nt7.33□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 EDC3YEL015W 1656 nt7.33□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 TRS23YDR246W 660 nt7.32□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 YGL088WYGL088W 366 nt7.32□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 GPA1YHR005C 1419 nt7.31□□□□□ -1.24
TY2B-BQ12491 GSP2YOR185C 663 nt7.31□□□□□ -1.24
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