Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SPIRE1Q08AE8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
SPIRE1Q08AE8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SPIRE1Q08AE8 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms