Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
APBA1Q02410 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
APBA1Q02410 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
APBA1Q02410 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms