Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 AC012370.2-204ENST00000601940 1320 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 AC010422.1-201ENST00000414548 543 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
ATXN8OSP0DMR3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 AC108359.1-201ENST00000616451 1211 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 AC108673.2-201ENST00000608909 565 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN8OSP0DMR3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 C20orf85-201ENST00000371168 803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN8OSP0DMR3 ZCCHC6-203ENST00000375948 958 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms