Protein–RNA interactions for Protein: P0CX15

YRF1-7, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 7, yeastyeast

Predictions only

Length 1,859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-7P0CX15 SWI3YJL176C 2478 nt6.12□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 FAP1YNL023C 2898 nt6.12□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 ATR1YML116W 1629 nt6.11□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 MRM2YGL136C 963 nt6.11□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 MSB3YNL293W 1902 nt6.11□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 snR19snR19 568 nt6.11□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 MAG2YLR427W 2013 nt6.11□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 SAC6YDR129C 1929 nt6.1□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 RFC2YJR068W 1062 nt6.1□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 MTW1YAL034W-A 870 nt6.1□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 FOX2YKR009C 2703 nt6.1□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 SPR6YER115C 576 nt6.09□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 SUP56tL(CAA)A 82 nt6.09□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 SUP53tL(CAA)C 82 nt6.09□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt6.09□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt6.09□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 SUP54tL(CAA)G2 82 nt6.09□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt6.09□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt6.09□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt6.09□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt6.09□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt6.09□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 CIA2YHR122W 696 nt6.09□□□□□ -1.43
YRF1-7P0CX15 BUD9YGR041W 1644 nt6.08□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 CLN1YMR199W 1641 nt6.08□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 CEF1YMR213W 1773 nt6.08□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 CTR2YHR175W 570 nt6.08□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 YLR364C-AYLR364C-A 123 nt6.07□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 AVT4YNL101W 2142 nt6.07□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 HIR2YOR038C 2628 nt6.07□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 VTS1YOR359W 1572 nt6.07□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 IWR1YDL115C 1062 nt6.07□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 HOR7YMR251W-A 180 nt6.07□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 AIF1YNR074C 1137 nt6.07□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 ICY2YPL250C 411 nt6.06□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 HPF1YOL155C 2904 nt6.06□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 GMC1YDR506C 1827 nt6.06□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 ZUO1YGR285C 1302 nt6.05□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 RPA49YNL248C 1248 nt6.05□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 ISU2YOR226C 471 nt6.05□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 EDC3YEL015W 1656 nt6.05□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 YOL075CYOL075C 3885 nt6.05□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 PDC1YLR044C 1692 nt6.05□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt6.05□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt6.05□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt6.05□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 ELC1YPL046C 300 nt6.05□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt6.05□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt6.05□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 RFU1YLR073C 603 nt6.04□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt6.04□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 SAP30YMR263W 606 nt6.04□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 ACO1YLR304C 2337 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 MRPL15YLR312W-A 762 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 RGS2YOR107W 930 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 UMP1YBR173C 447 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 ALD3YMR169C 1521 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 ALD2YMR170C 1521 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 ESC8YOL017W 2145 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 CTS1YLR286C 1689 nt6.03□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 ARF2YDL137W 546 nt6.02□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 XPT1YJR133W 630 nt6.02□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 NPT1YOR209C 1290 nt6.02□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 YPL199CYPL199C 723 nt6.02□□□□□ -1.44
YRF1-7P0CX15 SSH4YKL124W 1740 nt6.02□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 RCK1YGL158W 1539 nt6.02□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 NQM1YGR043C 1002 nt6.02□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 DCS2YOR173W 1062 nt6.02□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 KTR5YNL029C 1569 nt6.02□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 ECM30YLR436C 3825 nt6.01□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 YPL278CYPL278C 303 nt6.01□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 YJR124CYJR124C 1347 nt6.01□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 TOS2YGR221C 1869 nt6□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 RTC1YOL138C 4026 nt6□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 GRS1YBR121C 2004 nt5.99□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 AIR2YDL175C 1035 nt5.99□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 UBC8YEL012W 657 nt5.99□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 URE2YNL229C 1065 nt5.99□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 RPT2YDL007W 1314 nt5.99□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 CMK2YOL016C 1344 nt5.99□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 NMD5YJR132W 3147 nt5.99□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 MNN4YKL201C 3537 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 SLZ1YNL196C 897 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 DAK1YML070W 1755 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 YDL012CYDL012C 324 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 BUD16YEL029C 939 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 YGR066CYGR066C 879 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 YGP1YNL160W 1065 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 STE50YCL032W 1041 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 NOP58YOR310C 1536 nt5.98□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 ADE3YGR204W 2841 nt5.97□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 ABF1YKL112W 2196 nt5.97□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 NTE1YML059C 5040 nt5.97□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 TUB3YML124C 1338 nt5.97□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 AMA1YGR225W 1782 nt5.96□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 TRS23YDR246W 660 nt5.96□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 PIC2YER053C 903 nt5.96□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 MPM1YJL066C 759 nt5.96□□□□□ -1.45
YRF1-7P0CX15 RAT1YOR048C 3021 nt5.96□□□□□ -1.46
YRF1-7P0CX15 FUM1YPL262W 1467 nt5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 48.7 ms