Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SMARCA5O60264 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
SMARCA5O60264 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMARCA5O60264 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMARCA5O60264 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms