Protein–RNA interactions for Protein: F8W1W9

NPIPB9, Nuclear pore complex-interacting protein family member B9, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPB9F8W1W9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
NPIPB9F8W1W9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NPIPB9F8W1W9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NPIPB9F8W1W9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms