Protein–RNA interactions for Protein: P17787

CHRNB2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB2P17787 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CHRNB2P17787 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CHRNB2P17787 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CHRNB2P17787 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms