Protein–RNA interactions for Protein: A6NFA1

TRABD2B, Metalloprotease TIKI2, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABD2BA6NFA1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRABD2BA6NFA1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TRABD2BA6NFA1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TRABD2BA6NFA1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.7 ms