Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GOLGA6L4A6NEF3 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
GOLGA6L4A6NEF3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 944.2 ms