Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hacd3Q8K2C9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hacd3Q8K2C9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hacd3Q8K2C9 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms