Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT8

CCDC84, Coiled-coil domain-containing protein 84, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC84Q86UT8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
CCDC84Q86UT8 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCDC84Q86UT8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCDC84Q86UT8 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms