Protein–RNA interactions for Protein: Q12074

SPE3, Spermidine synthase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SPE3Q12074 RPL7AYGL076C 735 nt5.84□□□□□ -1.47
SPE3Q12074 APS3YJL024C 585 nt5.84□□□□□ -1.47
SPE3Q12074 RPL7BYPL198W 735 nt5.84□□□□□ -1.47
SPE3Q12074 SSO1YPL232W 873 nt5.84□□□□□ -1.47
SPE3Q12074 SET5YHR207C 1581 nt5.84□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 PKC1YBL105C 3456 nt5.83□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YEL020CYEL020C 1683 nt5.83□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YEA6YEL006W 1008 nt5.83□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 HSX1tR(CCU)J 72 nt5.83□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YKL151CYKL151C 1014 nt5.83□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 CSG2YBR036C 1233 nt5.83□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 PDB1YBR221C 1101 nt5.83□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 EIS1YMR031C 2532 nt5.83□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 PRO3YER023W 861 nt5.82□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 COX17YLL009C 210 nt5.82□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 DAL82YNL314W 768 nt5.82□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 KTR3YBR205W 1215 nt5.82□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YBR230W-AYBR230W-A 201 nt5.82□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YML082WYML082W 1950 nt5.82□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 TIM54YJL054W 1437 nt5.82□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 HOS1YPR068C 1413 nt5.82□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 ACC1YNR016C 6702 nt5.81□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 ADK2YER170W 678 nt5.81□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 SNZ3YFL059W 897 nt5.81□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YHR140WYHR140W 720 nt5.81□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YLR118CYLR118C 684 nt5.81□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 HCR1YLR192C 798 nt5.81□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 SNZ2YNL333W 897 nt5.81□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 MLC2YPR188C 492 nt5.81□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 ORC5YNL261W 1440 nt5.81□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 MID1YNL291C 1647 nt5.81□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 VPS70YJR126C 2436 nt5.8□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 MKK2YPL140C 1521 nt5.8□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 FET3YMR058W 1911 nt5.8□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YCR097W-AYCR097W-A 267 nt5.8□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YGR176WYGR176W 348 nt5.8□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YNL108CYNL108C 813 nt5.8□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 ERI1YPL096C-A 207 nt5.8□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 PRP46YPL151C 1356 nt5.8□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 ATP1YBL099W 1638 nt5.79□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 IDP1YDL066W 1287 nt5.79□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YGR182CYGR182C 354 nt5.79□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YLR283WYLR283W 945 nt5.79□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 PIN2YOR104W 849 nt5.79□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 NHP6BYBR089C-A 300 nt5.79□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YCL041CYCL041C 495 nt5.79□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 HSP104YLL026W 2727 nt5.79□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YEH1YLL012W 1722 nt5.79□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 SSK22YCR073C 3996 nt5.79□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 FHL1YPR104C 2811 nt5.79□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 SEC20YDR498C 1152 nt5.78□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 PEX32YBR168W 1242 nt5.78□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 SMF2YHR050W 1650 nt5.78□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 YAP1801YHR161C 1914 nt5.78□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 SFB3YHR098C 2790 nt5.78□□□□□ -1.48
SPE3Q12074 TRP1YDR007W 675 nt5.77□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 ATO3YDR384C 828 nt5.77□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 YLL059CYLL059C 507 nt5.77□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 SEC17YBL050W 879 nt5.77□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 YOL131WYOL131W 327 nt5.77□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 TNA1YGR260W 1605 nt5.77□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 FOB1YDR110W 1701 nt5.77□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 CLB1YGR108W 1416 nt5.76□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 PYC1YGL062W 3537 nt5.76□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 TKL1YPR074C 2043 nt5.76□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 CDC10YCR002C 969 nt5.76□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 SLO1YER180C-A 258 nt5.76□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 tR(ACG)JtR(ACG)J 73 nt5.76□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 ARP1YHR129C 1155 nt5.76□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 VTH1YIL173W 4650 nt5.76□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 VTH2YJL222W 4650 nt5.76□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 MHR1YDR296W 681 nt5.75□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 YJR115WYJR115W 510 nt5.75□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 RHO4YKR055W 876 nt5.75□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 YLR194CYLR194C 765 nt5.75□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt5.75□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 RTT106YNL206C 1368 nt5.75□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 NOP2YNL061W 1857 nt5.75□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 RRP45YDR280W 918 nt5.74□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 CAD1YDR423C 1230 nt5.74□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 HAL1YPR005C 885 nt5.74□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 RCK1YGL158W 1539 nt5.74□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 RBA50YDR527W 1320 nt5.74□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 GUA1YMR217W 1578 nt5.73□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 COX26YDR119W-A 201 nt5.73□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 RPT6YGL048C 1218 nt5.73□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 PRM10YJL108C 1152 nt5.73□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 TFS1YLR178C 660 nt5.73□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 GFD1YMR255W 567 nt5.73□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 CHO1YER026C 831 nt5.72□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 YGL194C-AYGL194C-A 243 nt5.72□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 YLR317WYLR317W 435 nt5.72□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 SCT1YBL011W 2280 nt5.72□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 STE13YOR219C 2796 nt5.72□□□□□ -1.49
SPE3Q12074 YIR007WYIR007W 2295 nt5.71□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 PEX7YDR142C 1128 nt5.71□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 YKL223WYKL223W 333 nt5.71□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 ODC2YOR222W 924 nt5.71□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 GEX1YCL073C 1848 nt5.71□□□□□ -1.5
SPE3Q12074 EPS1YIL005W 2106 nt5.71□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 38.4 ms