Protein–RNA interactions for Protein: P40447

NIT1, Putative nitrilase-like protein NIT1, yeastyeast

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIT1P40447 YLH47YPR125W 1365 nt6.78□□□□□ -1.32
NIT1P40447 FRT1YOR324C 1809 nt6.78□□□□□ -1.32
NIT1P40447 CNE1YAL058W 1509 nt6.77□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YMR155WYMR155W 1644 nt6.77□□□□□ -1.33
NIT1P40447 CHA1YCL064C 1083 nt6.77□□□□□ -1.33
NIT1P40447 SPT3YDR392W 1014 nt6.77□□□□□ -1.33
NIT1P40447 SCEIQ0160 708 nt6.77□□□□□ -1.33
NIT1P40447 BAG7YOR134W 1230 nt6.77□□□□□ -1.33
NIT1P40447 CBS1YDL069C 690 nt6.76□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YDR161WYDR161W 1164 nt6.76□□□□□ -1.33
NIT1P40447 RRP17YDR412W 708 nt6.76□□□□□ -1.33
NIT1P40447 HHY1YEL059W 309 nt6.76□□□□□ -1.33
NIT1P40447 NTG1YAL015C 1200 nt6.76□□□□□ -1.33
NIT1P40447 TAP42YMR028W 1101 nt6.76□□□□□ -1.33
NIT1P40447 IZH4YOL101C 939 nt6.76□□□□□ -1.33
NIT1P40447 ALG5YPL227C 1005 nt6.76□□□□□ -1.33
NIT1P40447 NCE102YPR149W 522 nt6.76□□□□□ -1.33
NIT1P40447 ADE13YLR359W 1449 nt6.76□□□□□ -1.33
NIT1P40447 TEA1YOR337W 2280 nt6.75□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YPL245WYPL245W 1365 nt6.75□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt6.75□□□□□ -1.33
NIT1P40447 ENT5YDR153C 1236 nt6.75□□□□□ -1.33
NIT1P40447 PAN6YIL145C 930 nt6.75□□□□□ -1.33
NIT1P40447 ISY1YJR050W 708 nt6.75□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YKL031WYKL031W 414 nt6.75□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt6.75□□□□□ -1.33
NIT1P40447 GLN1YPR035W 1113 nt6.75□□□□□ -1.33
NIT1P40447 GPB2YAL056W 2643 nt6.74□□□□□ -1.33
NIT1P40447 RTT103YDR289C 1230 nt6.74□□□□□ -1.33
NIT1P40447 SUF5tG(CCC)O 72 nt6.74□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YGR066CYGR066C 879 nt6.74□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YJR115WYJR115W 510 nt6.74□□□□□ -1.33
NIT1P40447 ERG3YLR056W 1098 nt6.74□□□□□ -1.33
NIT1P40447 LST8YNL006W 912 nt6.74□□□□□ -1.33
NIT1P40447 ARR3YPR201W 1215 nt6.74□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YBR144CYBR144C 315 nt6.74□□□□□ -1.33
NIT1P40447 PYC2YBR218C 3543 nt6.74□□□□□ -1.33
NIT1P40447 HSM3YBR272C 1443 nt6.74□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YML133CYML133C 4125 nt6.74□□□□□ -1.33
NIT1P40447 KNH1YDL049C 807 nt6.73□□□□□ -1.33
NIT1P40447 TCA17YEL048C 459 nt6.73□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YGL072CYGL072C 360 nt6.73□□□□□ -1.33
NIT1P40447 BCY1YIL033C 1251 nt6.73□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YKR073CYKR073C 321 nt6.73□□□□□ -1.33
NIT1P40447 SSO1YPL232W 873 nt6.73□□□□□ -1.33
NIT1P40447 POP4YBR257W 840 nt6.73□□□□□ -1.33
NIT1P40447 SAS4YDR181C 1446 nt6.73□□□□□ -1.33
NIT1P40447 UTR2YEL040W 1404 nt6.73□□□□□ -1.33
NIT1P40447 KAR1YNL188W 1302 nt6.73□□□□□ -1.33
NIT1P40447 TOS2YGR221C 1869 nt6.73□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YTP1YNL237W 1380 nt6.72□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YCR006CYCR006C 474 nt6.72□□□□□ -1.33
NIT1P40447 GTO1YGR154C 1071 nt6.72□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YHR070C-AYHR070C-A 411 nt6.72□□□□□ -1.33
NIT1P40447 tX(XXX)DtX(XXX)D 100 nt6.72□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YOL024WYOL024W 519 nt6.72□□□□□ -1.33
NIT1P40447 YPL068CYPL068C 882 nt6.72□□□□□ -1.33
NIT1P40447 POB3YML069W 1659 nt6.71□□□□□ -1.33
NIT1P40447 COG7YGL005C 840 nt6.71□□□□□ -1.34
NIT1P40447 PHB1YGR132C 864 nt6.71□□□□□ -1.34
NIT1P40447 OKP1YGR179C 1221 nt6.71□□□□□ -1.34
NIT1P40447 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt6.71□□□□□ -1.34
NIT1P40447 MRPL13YKR006C 795 nt6.71□□□□□ -1.34
NIT1P40447 GTR1YML121W 933 nt6.71□□□□□ -1.34
NIT1P40447 END3YNL084C 1050 nt6.71□□□□□ -1.34
NIT1P40447 YNL190WYNL190W 615 nt6.71□□□□□ -1.34
NIT1P40447 PMT2YAL023C 2280 nt6.71□□□□□ -1.34
NIT1P40447 ATG4YNL223W 1485 nt6.71□□□□□ -1.34
NIT1P40447 DDC1YPL194W 1839 nt6.71□□□□□ -1.34
NIT1P40447 GIR2YDR152W 798 nt6.7□□□□□ -1.34
NIT1P40447 RPN9YDR427W 1182 nt6.7□□□□□ -1.34
NIT1P40447 YMR144WYMR144W 1029 nt6.7□□□□□ -1.34
NIT1P40447 SSP2YOR242C 1116 nt6.7□□□□□ -1.34
NIT1P40447 YBR089WYBR089W 600 nt6.7□□□□□ -1.34
NIT1P40447 YCL041CYCL041C 495 nt6.7□□□□□ -1.34
NIT1P40447 MMR1YLR190W 1476 nt6.7□□□□□ -1.34
NIT1P40447 VMS1YDR049W 1899 nt6.7□□□□□ -1.34
NIT1P40447 FET3YMR058W 1911 nt6.7□□□□□ -1.34
NIT1P40447 MKC7YDR144C 1791 nt6.69□□□□□ -1.34
NIT1P40447 HXT17YNR072W 1695 nt6.69□□□□□ -1.34
NIT1P40447 ARH1YDR376W 1482 nt6.69□□□□□ -1.34
NIT1P40447 snR57snR57 88 nt6.69□□□□□ -1.34
NIT1P40447 UPS3YDR185C 540 nt6.69□□□□□ -1.34
NIT1P40447 ERJ5YFR041C 888 nt6.69□□□□□ -1.34
NIT1P40447 RRP4YHR069C 1080 nt6.69□□□□□ -1.34
NIT1P40447 SEC28YIL076W 891 nt6.69□□□□□ -1.34
NIT1P40447 PCD1YLR151C 1023 nt6.69□□□□□ -1.34
NIT1P40447 YLR194CYLR194C 765 nt6.69□□□□□ -1.34
NIT1P40447 YET2YMR040W 483 nt6.69□□□□□ -1.34
NIT1P40447 YMR181CYMR181C 465 nt6.69□□□□□ -1.34
NIT1P40447 EMW1YNL313C 2715 nt6.68□□□□□ -1.34
NIT1P40447 YDR541CYDR541C 1035 nt6.68□□□□□ -1.34
NIT1P40447 tR(ACG)DtR(ACG)D 73 nt6.68□□□□□ -1.34
NIT1P40447 tR(ACG)EtR(ACG)E 73 nt6.68□□□□□ -1.34
NIT1P40447 tR(ACG)KtR(ACG)K 73 nt6.68□□□□□ -1.34
NIT1P40447 tR(ACG)LtR(ACG)L 73 nt6.68□□□□□ -1.34
NIT1P40447 tR(ACG)OtR(ACG)O 73 nt6.68□□□□□ -1.34
NIT1P40447 SFC1YJR095W 969 nt6.68□□□□□ -1.34
NIT1P40447 YKR075CYKR075C 924 nt6.68□□□□□ -1.34
NIT1P40447 TVP38YKR088C 1014 nt6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 40.3 ms