Protein–RNA interactions for Protein: P02381

VAR1, Ribosomal protein VAR1, mitochondrial, yeast

Predictions only

Length 398 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
VAR1	P02381	RPR2	YIR015W	435 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	SRY1	YKL218C	981 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	QRI5	YLR204W	336 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	PXA1	YPL147W	2613 nt		4.42	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	ATH1	YPR026W	3636 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	YEH1	YLL012W	1722 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	YTA6	YPL074W	2265 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	DOT5	YIL010W	648 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	GCV3	YAL044C	513 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	YPR160C-A	YPR160C-A	285 nt		4.41	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	GPR1	YDL035C	2886 nt		4.4	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	SSK22	YCR073C	3996 nt		4.4	□□□□□ -1.7
VAR1	P02381	IDP1	YDL066W	1287 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YDR053W	YDR053W	396 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	SIP2	YGL208W	1248 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	KSS1	YGR040W	1107 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	LYS12	YIL094C	1116 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	POR2	YIL114C	846 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	PDC1	YLR044C	1692 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YRF1-4	YLR466W	4149 nt		4.4	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	ENT2	YLR206W	1842 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	APE3	YBR286W	1614 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	ATG7	YHR171W	1893 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	SMF2	YHR050W	1650 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	FUM1	YPL262W	1467 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	APL6	YGR261C	2430 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YDL057W	YDL057W	987 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	ASK1	YKL052C	879 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	STM1	YLR150W	822 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	BLM10	YFL007W	6432 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	SKS1	YPL026C	1509 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	RPT2	YDL007W	1314 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	BUD9	YGR041W	1644 nt		4.39	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	NRD1	YNL251C	1728 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	GRS1	YBR121C	2004 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YDR109C	YDR109C	2148 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	SCS2	YER120W	735 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	GRE1	YPL223C	507 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	MRPS5	YBR251W	924 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	PRI2	YKL045W	1587 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	VHS2	YIL135C	1311 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	MSC7	YHR039C	1935 nt		4.38	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YLR157W-E	YLR157W-E	165 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	MRPL15	YLR312W-A	762 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	HLJ1	YMR161W	675 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YNL097W-A	YNL097W-A	156 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	UBC11	YOR339C	471 nt		4.37	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	HSF1	YGL073W	2502 nt		4.36	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YDL121C	YDL121C	450 nt		4.36	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YER010C	YER010C	705 nt		4.36	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YLR184W	YLR184W	348 nt		4.36	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YML012C-A	YML012C-A	378 nt		4.36	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	RHO2	YNL090W	579 nt		4.36	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	ADE12	YNL220W	1302 nt		4.36	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	FET3	YMR058W	1911 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	UGX2	YDL169C	672 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	SEC20	YDR498C	1152 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	ZRT1	YGL255W	1131 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YLR317W	YLR317W	435 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YLR346C	YLR346C	306 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	GFD1	YMR255W	567 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	MTQ1	YNL063W	945 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YBR126W-A	YBR126W-A	207 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	ARN1	YHL040C	1884 nt		4.35	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	PHO90	YJL198W	2646 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	FYV1	YDR024W	486 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	HOR7	YMR251W-A	180 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	IDP3	YNL009W	1263 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YBR144C	YBR144C	315 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	DBF2	YGR092W	1719 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	CPS1	YJL172W	1731 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	YML082W	YML082W	1950 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	FAA3	YIL009W	2085 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	QDR3	YBR043C	2070 nt		4.34	□□□□□ -1.71
VAR1	P02381	AMD1	YML035C	2433 nt		4.33	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	GAS3	YMR215W	1575 nt		4.33	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	YKR073C	YKR073C	321 nt		4.33	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	MLC2	YPR188C	492 nt		4.33	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	SFI1	YLL003W	2841 nt		4.33	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	HPC2	YBR215W	1878 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	DAL81	YIR023W	2913 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	GLE1	YDL207W	1617 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	LUC7	YDL087C	786 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	MOG1	YJR074W	657 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	IMD1	YAR073W	1212 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	DOM34	YNL001W	1161 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	MBP1	YDL056W	2502 nt		4.32	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	HPF1	YOL155C	2904 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	ATO3	YDR384C	828 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	GAL83	YER027C	1254 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	APS3	YJL024C	585 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	YKL031W	YKL031W	414 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	GYP1	YOR070C	1914 nt		4.31	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	GLT1	YDL171C	6438 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	YDL114W	YDL114W	927 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	SFC1	YJR095W	969 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	RBD2	YPL246C	789 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	BAP2	YBR068C	1830 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	PCA1	YBR295W	3651 nt		4.3	□□□□□ -1.72
VAR1	P02381	PAP1	YKR002W	1707 nt		4.29	□□□□□ -1.72

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