Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL603841.1-201ENST00000430516 664 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 LST1-205ENST00000376089 680 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 LST1-206ENST00000376090 689 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 LST1-208ENST00000376093 648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 LST1-209ENST00000376096 565 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 LST1-210ENST00000376099 610 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 LST1-212ENST00000396101 459 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 LST1-214ENST00000418507 726 ntTSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 LST1-217ENST00000438075 764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC11.25□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 C1orf132-204ENST00000637970 1170 ntTSL 5 BASIC11.24□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL109935.1-201ENST00000413249 473 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 STK33P1-201ENST00000423835 1218 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
KRTAP9-4Q9BYQ2 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
KRTAP9-4Q9BYQ2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC022148.2-201ENST00000586176 560 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093783.1-201ENST00000612976 329 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-4Q9BYQ2 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
KRTAP9-4Q9BYQ2 HIKESHI-201ENST00000278483 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-4Q9BYQ2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-4Q9BYQ2 TCEAL4-213ENST00000613326 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093227.1-201ENST00000588040 1360 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLK13-207ENST00000596955 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
KRTAP9-4Q9BYQ2 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-4Q9BYQ2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355306.2-209ENST00000437803 357 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010387.1-201ENST00000507526 487 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
KRTAP9-4Q9BYQ2 SVBP-202ENST00000372522 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090739.1-201ENST00000522190 708 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC11.01□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL160408.1-203ENST00000453568 631 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005954.1-201ENST00000591962 337 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01670-203ENST00000624859 977 ntTSL 3 BASIC11□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 Z97985.1-201ENST00000332270 946 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC02407-202ENST00000553247 1083 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC115989.2-201ENST00000578640 563 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL137246.1-201ENST00000607072 977 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRTM1-201ENST00000273286 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009269.5-201ENST00000557800 755 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPATA45-201ENST00000332912 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL139280.1-201ENST00000436340 463 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC010978.1-202ENST00000427050 893 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL079304.1-201ENST00000554595 828 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND2P25-201ENST00000449028 610 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 ARAF-202ENST00000377039 1271 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTND1P31-201ENST00000449206 961 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092067.1-201ENST00000592929 488 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR10R2-202ENST00000641067 1132 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL4-201ENST00000231449 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 LRRIQ3-202ENST00000370909 793 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC093581.1-204ENST00000442606 390 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 IL4-204ENST00000622422 717 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
KRTAP9-4Q9BYQ2 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms