Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC51

SERBP1, Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1Q8NC51 TOMM40-204ENST00000589253 207 ntTSL 311.42□□□□□ -0.586e-9■■■■■ 133.4
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SERBP1Q8NC51 SH3GLB1-203ENST00000535010 6227 ntTSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.793e-10■■■■■ 127.8
SERBP1Q8NC51 SH3GLB1-205ENST00000616170 6456 ntTSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.873e-10■■■■■ 127.8
SERBP1Q8NC51 PTOV1-206ENST00000596095 734 ntTSL 311.7□□□□□ -0.544e-23■■■■■ 124.2
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SERBP1Q8NC51 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.342e-6■■■■■ 120.7
SERBP1Q8NC51 CDYL-201ENST00000328908 3419 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.82e-6■■■■■ 120.7
SERBP1Q8NC51 CDYL-208ENST00000483019 773 ntTSL 29.9□□□□□ -0.822e-6■■■■■ 120.7
SERBP1Q8NC51 CDYL-204ENST00000440139 690 ntTSL 38.07□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 120.7
SERBP1Q8NC51 CDYL-209ENST00000491864 614 ntTSL 57.45□□□□□ -1.222e-6■■■■■ 120.7
SERBP1Q8NC51 USP7-219ENST00000569230 569 ntTSL 55.41□□□□□ -1.541e-6■■■■■ 115.1
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SERBP1Q8NC51 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.71e-7■■■■■ 114.4
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SERBP1Q8NC51 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.031e-7■■■■■ 114.4
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SERBP1Q8NC51 ZFHX3-203ENST00000397992 13841 ntTSL 1 (best) BASIC9.6□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 114.4
SERBP1Q8NC51 ZFHX3-201ENST00000268489 16064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.941e-7■■■■■ 114.4
SERBP1Q8NC51 ZFHX3-207ENST00000641206 16414 ntAPPRIS P1 BASIC7.88□□□□□ -1.151e-7■■■■■ 114.4
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SERBP1Q8NC51 NUTM2B-AS1-204ENST00000483080 864 ntTSL 216.39■□□□□ 0.212e-10■■■■■ 111.6
SERBP1Q8NC51 NUTM2B-AS1-207ENST00000495430 829 ntTSL 515.85■□□□□ 0.132e-10■■■■■ 111.6
SERBP1Q8NC51 NUTM2B-AS1-208ENST00000496359 581 ntTSL 313.97□□□□□ -0.172e-10■■■■■ 111.6
SERBP1Q8NC51 NUTM2B-AS1-206ENST00000488805 463 ntTSL 312.8□□□□□ -0.362e-10■■■■■ 111.6
SERBP1Q8NC51 DDIT4-202ENST00000471240 521 ntTSL 220.65■□□□□ 0.91e-12■■■■■ 109.6
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SERBP1Q8NC51 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 222.07■■□□□ 1.121e-6■■■■■ 100.6
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SERBP1Q8NC51 ISYNA1-209ENST00000582287 696 ntTSL 1 (best)18.11■□□□□ 0.491e-6■■■■■ 100.6
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SERBP1Q8NC51 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 217.64■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 100.6
SERBP1Q8NC51 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 514.17□□□□□ -0.141e-6■■■■■ 100.6
SERBP1Q8NC51 ISYNA1-207ENST00000581672 793 ntTSL 29.99□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 100.6
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SERBP1Q8NC51 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.535e-19■■■■■ 98.8
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SERBP1Q8NC51 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.062e-6■■■■■ 95.3
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SERBP1Q8NC51 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.872e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.772e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 LTBR-205ENST00000535739 928 ntTSL 519.43■□□□□ 0.72e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 ALDH16A1-205ENST00000594549 681 ntTSL 219.29■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.662e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 ALDH16A1-208ENST00000600265 819 ntTSL 318.98■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 COTL1-204ENST00000564662 713 ntTSL 218.93■□□□□ 0.622e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 TOM1-205ENST00000424387 2211 ntTSL 518.39■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.532e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 MARS-223ENST00000551431 559 ntTSL 418.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 MARS-217ENST00000549074 532 ntTSL 418.24■□□□□ 0.512e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 MARS-202ENST00000447721 1328 ntTSL 218.11■□□□□ 0.492e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 MARS-221ENST00000550449 739 ntTSL 317.79■□□□□ 0.442e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.412e-6■■■■■ 95.3
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SERBP1Q8NC51 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 LTBR-210ENST00000542830 539 ntTSL 416.78■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 95.3
SERBP1Q8NC51 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 95.3
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