Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWS0

PHF6, PHD finger protein 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF6Q8IWS0 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.059e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 AP001347.1-203ENST00000448463 780 ntTSL 214.48□□□□□ -0.099e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 TSC2-206ENST00000439117 5073 ntTSL 1 (best)14.14□□□□□ -0.159e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.159e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 TSC2-216ENST00000497886 3248 ntTSL 213□□□□□ -0.339e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 AP001347.1-201ENST00000428809 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.929e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 AP001347.1-202ENST00000432621 1084 ntTSL 1 (best)8.74□□□□□ -1.019e-9■■■■■ 52.5
PHF6Q8IWS0 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.074e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-222ENST00000451607 1007 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.574e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-203ENST00000416952 799 ntTSL 211.36□□□□□ -0.594e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-216ENST00000443799 897 ntTSL 510.74□□□□□ -0.694e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-214ENST00000436656 822 ntTSL 310.74□□□□□ -0.694e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-224ENST00000454068 688 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.774e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-210ENST00000431268 1698 ntTSL 29.65□□□□□ -0.864e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-226ENST00000455838 632 ntTSL 29.15□□□□□ -0.944e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-219ENST00000449289 542 ntTSL 3 BASIC9.15□□□□□ -0.944e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-220ENST00000449589 712 ntTSL 39.15□□□□□ -0.944e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-211ENST00000432536 959 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.994e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-227ENST00000456293 583 ntTSL 37.89□□□□□ -1.154e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-228ENST00000456812 723 ntTSL 37.47□□□□□ -1.214e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-204ENST00000421068 1060 ntTSL 26.97□□□□□ -1.294e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-229ENST00000458220 469 ntTSL 26.66□□□□□ -1.344e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.344e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-201ENST00000412059 979 ntTSL 56.36□□□□□ -1.394e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-206ENST00000422183 745 ntTSL 26.05□□□□□ -1.444e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-215ENST00000442067 1114 ntTSL 25.79□□□□□ -1.484e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.524e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.594e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-205ENST00000422008 497 ntTSL 34.64□□□□□ -1.674e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.714e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 GAS5-213ENST00000436285 772 ntTSL 23.48□□□□□ -1.854e-37■■■■■ 51.8
PHF6Q8IWS0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.861e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-207ENST00000566037 1032 ntTSL 226.61■■□□□ 1.851e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.441e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 TRAF4-215ENST00000584944 825 ntTSL 215.48■□□□□ 0.071e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC15.35■□□□□ 0.051e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-203ENST00000563376 697 ntTSL 315.21■□□□□ 0.031e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-208ENST00000566044 3829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.481e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-202ENST00000323584 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.661e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 SRP14-AS1-201ENST00000504245 2317 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.711e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-217ENST00000570047 797 ntTSL 310.25□□□□□ -0.771e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-214ENST00000567402 1617 ntTSL 1 (best)10.02□□□□□ -0.811e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC9.64□□□□□ -0.871e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-201ENST00000299167 5464 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 PHKB-206ENST00000565424 828 ntTSL 36.81□□□□□ -1.321e-7■■■■■ 51
PHF6Q8IWS0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.33e-7■■■■■ 50.9
PHF6Q8IWS0 ASMTL-AS1-202ENST00000420411 697 ntTSL 1 (best)11.48□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 50.9
PHF6Q8IWS0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.194e-8■■■■■ 50.6
PHF6Q8IWS0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.112e-6■■■■■ 50.5
PHF6Q8IWS0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.112e-6■■■■■ 50.5
PHF6Q8IWS0 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.012e-6■■■■■ 50.5
PHF6Q8IWS0 PXMP2-202ENST00000428960 762 ntTSL 320.41■□□□□ 0.862e-6■■■■■ 50.5
PHF6Q8IWS0 PXMP2-204ENST00000539093 516 ntTSL 319.33■□□□□ 0.682e-6■■■■■ 50.5
PHF6Q8IWS0 FOXK2-211ENST00000575578 571 ntTSL 216.03■□□□□ 0.161e-6■■■■■ 48.9
PHF6Q8IWS0 MAEA-212ENST00000509531 1001 ntTSL 1 (best)21.62■■□□□ 1.052e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.892e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.822e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 SPPL2B-201ENST00000585725 583 ntTSL 318.96■□□□□ 0.632e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-203ENST00000502558 570 ntTSL 218.46■□□□□ 0.552e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.472e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.22e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 316■□□□□ 0.152e-6■■■■■ 48.5
PHF6Q8IWS0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.054e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.54e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GRB10-212ENST00000439044 733 ntTSL 523.53■■□□□ 1.364e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.154e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.014e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.974e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 AHNAK-207ENST00000531324 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 320.43■□□□□ 0.864e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 AHNAK-208ENST00000533365 584 ntAPPRIS ALT2 TSL 520.23■□□□□ 0.834e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.824e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.754e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.654e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.534e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.344e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.294e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 GNB2-210ENST00000451587 887 ntTSL 516.64■□□□□ 0.254e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.124e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 AHNAK-204ENST00000528508 568 ntAPPRIS ALT2 TSL 415.78■□□□□ 0.124e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 ZNF518B-205ENST00000515072 2623 ntTSL 1 (best)15.24■□□□□ 0.034e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 AHNAK-206ENST00000530285 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.85□□□□□ -0.034e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 ANP32B-201ENST00000339399 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.144e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 ZNF518B-204ENST00000507515 527 ntTSL 414.11□□□□□ -0.154e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 ZNF518B-203ENST00000503068 4196 ntTSL 1 (best)10.51□□□□□ -0.734e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 ZNF518B-202ENST00000500268 4145 ntTSL 1 (best)7.9□□□□□ -1.144e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.554e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 AHNAK-202ENST00000378024 18787 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.624e-8■■■■■ 48.4
PHF6Q8IWS0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.194e-7■■■■■ 48.2
PHF6Q8IWS0 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.014e-7■■■■■ 48.2
PHF6Q8IWS0 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.34e-7■■■■■ 48.2
PHF6Q8IWS0 APBA2-202ENST00000411764 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.574e-7■■■■■ 48.2
PHF6Q8IWS0 APBA2-204ENST00000558259 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.654e-7■■■■■ 48.2
PHF6Q8IWS0 MVD-204ENST00000562741 217 ntTSL 225.29■■□□□ 1.644e-6■■■■■ 46.4
PHF6Q8IWS0 MVD-210ENST00000565610 507 ntTSL 322.37■■□□□ 1.174e-6■■■■■ 46.4
PHF6Q8IWS0 MVD-214ENST00000567064 758 ntTSL 320.5■□□□□ 0.874e-6■■■■■ 46.4
PHF6Q8IWS0 MVD-208ENST00000563785 888 ntTSL 219.57■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 46.4
PHF6Q8IWS0 MVD-207ENST00000563463 543 ntTSL 319.52■□□□□ 0.724e-6■■■■■ 46.4
PHF6Q8IWS0 MVD-217ENST00000569177 870 ntTSL 519.45■□□□□ 0.74e-6■■■■■ 46.4
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