Protein–RNA interactions for Protein: Q12377

RPN6, 26S proteasome regulatory subunit RPN6, yeastyeast

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPN6Q12377 RKM5YLR137W 1104 nt11.9□□□□□ -0.5
RPN6Q12377 SDH1YKL148C 1923 nt11.85□□□□□ -0.51
RPN6Q12377 ART5YGR068C 1761 nt11.8□□□□□ -0.52
RPN6Q12377 IRC15YPL017C 1500 nt11.8□□□□□ -0.52
RPN6Q12377 GFD2YCL036W 1701 nt11.79□□□□□ -0.52
RPN6Q12377 PET9YBL030C 957 nt11.74□□□□□ -0.53
RPN6Q12377 SCC4YER147C 1875 nt11.74□□□□□ -0.53
RPN6Q12377 GIS3YLR094C 1509 nt11.72□□□□□ -0.53
RPN6Q12377 YCH1YGR203W 447 nt11.7□□□□□ -0.54
RPN6Q12377 PAC11YDR488C 1602 nt11.7□□□□□ -0.54
RPN6Q12377 TIR4YOR009W 1464 nt11.7□□□□□ -0.54
RPN6Q12377 YOL037CYOL037C 354 nt11.69□□□□□ -0.54
RPN6Q12377 RTS2YOR077W 699 nt11.66□□□□□ -0.54
RPN6Q12377 NPL3YDR432W 1245 nt11.63□□□□□ -0.55
RPN6Q12377 YOR139CYOR139C 393 nt11.59□□□□□ -0.55
RPN6Q12377 YMR057CYMR057C 372 nt11.58□□□□□ -0.56
RPN6Q12377 CUE1YMR264W 612 nt11.58□□□□□ -0.56
RPN6Q12377 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.57□□□□□ -0.56
RPN6Q12377 SEC11YIR022W 504 nt11.54□□□□□ -0.56
RPN6Q12377 YJL152WYJL152W 360 nt11.52□□□□□ -0.57
RPN6Q12377 PCH2YBR186W 1695 nt11.5□□□□□ -0.57
RPN6Q12377 FPS1YLL043W 2010 nt11.49□□□□□ -0.57
RPN6Q12377 YSC84YHR016C 1407 nt11.47□□□□□ -0.57
RPN6Q12377 GUT2YIL155C 1950 nt11.45□□□□□ -0.58
RPN6Q12377 YIL100WYIL100W 354 nt11.43□□□□□ -0.58
RPN6Q12377 YLR281CYLR281C 468 nt11.42□□□□□ -0.58
RPN6Q12377 WHI5YOR083W 888 nt11.42□□□□□ -0.58
RPN6Q12377 YHL050CYHL050C 2094 nt11.42□□□□□ -0.58
RPN6Q12377 YLR236CYLR236C 324 nt11.41□□□□□ -0.58
RPN6Q12377 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.41□□□□□ -0.58
RPN6Q12377 NVJ2YPR091C 2313 nt11.41□□□□□ -0.58
RPN6Q12377 YNL195CYNL195C 786 nt11.37□□□□□ -0.59
RPN6Q12377 RRT12YCR045C 1476 nt11.37□□□□□ -0.59
RPN6Q12377 PIB2YGL023C 1908 nt11.27□□□□□ -0.6
RPN6Q12377 IDH1YNL037C 1083 nt11.26□□□□□ -0.61
RPN6Q12377 RTF1YGL244W 1677 nt11.22□□□□□ -0.61
RPN6Q12377 PUS2YGL063W 1113 nt11.2□□□□□ -0.62
RPN6Q12377 IMP2'YIL154C 1041 nt11.2□□□□□ -0.62
RPN6Q12377 GBP2YCL011C 1284 nt11.2□□□□□ -0.62
RPN6Q12377 RRD1YIL153W 1182 nt11.18□□□□□ -0.62
RPN6Q12377 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.17□□□□□ -0.62
RPN6Q12377 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.17□□□□□ -0.62
RPN6Q12377 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.17□□□□□ -0.62
RPN6Q12377 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.17□□□□□ -0.62
RPN6Q12377 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.17□□□□□ -0.62
RPN6Q12377 BOP3YNL042W 1191 nt11.17□□□□□ -0.62
RPN6Q12377 DSK2YMR276W 1122 nt11.16□□□□□ -0.62
RPN6Q12377 TCD2YKL027W 1344 nt11.12□□□□□ -0.63
RPN6Q12377 DED1YOR204W 1815 nt11.11□□□□□ -0.63
RPN6Q12377 NCP1YHR042W 2076 nt11.1□□□□□ -0.63
RPN6Q12377 FMP52YER004W 696 nt11.1□□□□□ -0.63
RPN6Q12377 YJL225CYJL225C 5277 nt11.06□□□□□ -0.64
RPN6Q12377 YPR011CYPR011C 981 nt11.06□□□□□ -0.64
RPN6Q12377 PTK1YKL198C 1989 nt11.05□□□□□ -0.64
RPN6Q12377 YDR433WYDR433W 441 nt11.04□□□□□ -0.64
RPN6Q12377 FMT1YBL013W 1206 nt11.02□□□□□ -0.65
RPN6Q12377 LCB1YMR296C 1677 nt11.01□□□□□ -0.65
RPN6Q12377 FMP45YDL222C 930 nt11.01□□□□□ -0.65
RPN6Q12377 PCM1YEL058W 1674 nt11□□□□□ -0.65
RPN6Q12377 ERV46YAL042W 1248 nt10.98□□□□□ -0.65
RPN6Q12377 MXR2YCL033C 507 nt10.98□□□□□ -0.65
RPN6Q12377 LPX1YOR084W 1164 nt10.94□□□□□ -0.66
RPN6Q12377 SOR2YDL246C 1074 nt10.93□□□□□ -0.66
RPN6Q12377 SOR1YJR159W 1074 nt10.93□□□□□ -0.66
RPN6Q12377 CWP1YKL096W 720 nt10.93□□□□□ -0.66
RPN6Q12377 ADH2YMR303C 1047 nt10.93□□□□□ -0.66
RPN6Q12377 SIM1YIL123W 1431 nt10.92□□□□□ -0.66
RPN6Q12377 YKR040CYKR040C 504 nt10.91□□□□□ -0.66
RPN6Q12377 SNF6YHL025W 999 nt10.9□□□□□ -0.66
RPN6Q12377 YCL042WYCL042W 360 nt10.88□□□□□ -0.67
RPN6Q12377 BIO4YNR057C 714 nt10.85□□□□□ -0.67
RPN6Q12377 FRD1YEL047C 1413 nt10.84□□□□□ -0.67
RPN6Q12377 YFL054CYFL054C 1941 nt10.82□□□□□ -0.68
RPN6Q12377 LYS4YDR234W 2082 nt10.81□□□□□ -0.68
RPN6Q12377 YIH1YCR059C 777 nt10.77□□□□□ -0.69
RPN6Q12377 SPT8YLR055C 1809 nt10.76□□□□□ -0.69
RPN6Q12377 RNQ1YCL028W 1218 nt10.74□□□□□ -0.69
RPN6Q12377 ERF2YLR246W 1080 nt10.72□□□□□ -0.69
RPN6Q12377 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.71□□□□□ -0.69
RPN6Q12377 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.71□□□□□ -0.69
RPN6Q12377 YLL053CYLL053C 459 nt10.7□□□□□ -0.7
RPN6Q12377 CRR1YLR213C 1269 nt10.69□□□□□ -0.7
RPN6Q12377 BOR1YNL275W 1731 nt10.67□□□□□ -0.7
RPN6Q12377 DIC1YLR348C 897 nt10.66□□□□□ -0.7
RPN6Q12377 FTR1YER145C 1215 nt10.62□□□□□ -0.71
RPN6Q12377 ATF2YGR177C 1608 nt10.61□□□□□ -0.71
RPN6Q12377 SPP1YPL138C 1062 nt10.6□□□□□ -0.71
RPN6Q12377 MOT3YMR070W 1473 nt10.6□□□□□ -0.71
RPN6Q12377 SWE1YJL187C 2460 nt10.59□□□□□ -0.71
RPN6Q12377 YFL067WYFL067W 528 nt10.59□□□□□ -0.71
RPN6Q12377 HEM12YDR047W 1089 nt10.58□□□□□ -0.72
RPN6Q12377 GAL1YBR020W 1587 nt10.57□□□□□ -0.72
RPN6Q12377 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt10.56□□□□□ -0.72
RPN6Q12377 TRM5YHR070W 1500 nt10.56□□□□□ -0.72
RPN6Q12377 PTH1YHR189W 573 nt10.55□□□□□ -0.72
RPN6Q12377 YLR235CYLR235C 399 nt10.55□□□□□ -0.72
RPN6Q12377 MIC10YCL057C-A 294 nt10.55□□□□□ -0.72
RPN6Q12377 UME6YDR207C 2511 nt10.55□□□□□ -0.72
RPN6Q12377 SNG1YGR197C 1644 nt10.54□□□□□ -0.72
RPN6Q12377 DDR2YOL052C-A 186 nt10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 133 ms