Protein–RNA interactions for Protein: Q12267

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, yeastyeast

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMC4Q12267 YJL152WYJL152W 360 nt19.5■□□□□ 0.71
SMC4Q12267 IMP2'YIL154C 1041 nt19.49■□□□□ 0.71
SMC4Q12267 SPP1YPL138C 1062 nt19.42■□□□□ 0.7
SMC4Q12267 ALF1YNL148C 765 nt19.42■□□□□ 0.7
SMC4Q12267 MRPL8YJL063C 717 nt19.36■□□□□ 0.69
SMC4Q12267 SUF2tP(AGG)C 72 nt19.33■□□□□ 0.68
SMC4Q12267 SUF10tP(AGG)N 72 nt19.33■□□□□ 0.68
SMC4Q12267 IDH1YNL037C 1083 nt19.25■□□□□ 0.67
SMC4Q12267 ERV46YAL042W 1248 nt19.24■□□□□ 0.67
SMC4Q12267 YDR433WYDR433W 441 nt19.23■□□□□ 0.67
SMC4Q12267 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt19.22■□□□□ 0.67
SMC4Q12267 YEL076CYEL076C 651 nt19.22■□□□□ 0.67
SMC4Q12267 YLR464WYLR464W 651 nt19.22■□□□□ 0.67
SMC4Q12267 UBX6YJL048C 1191 nt19.19■□□□□ 0.66
SMC4Q12267 ADO1YJR105W 1023 nt19.15■□□□□ 0.66
SMC4Q12267 RTG1YOL067C 534 nt19.15■□□□□ 0.66
SMC4Q12267 YDR095CYDR095C 411 nt19.14■□□□□ 0.65
SMC4Q12267 TIR4YOR009W 1464 nt19.13■□□□□ 0.65
SMC4Q12267 MXR2YCL033C 507 nt19.12■□□□□ 0.65
SMC4Q12267 SIS1YNL007C 1059 nt19.11■□□□□ 0.65
SMC4Q12267 YPS1YLR120C 1710 nt19.11■□□□□ 0.65
SMC4Q12267 GBP2YCL011C 1284 nt19.03■□□□□ 0.64
SMC4Q12267 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt18.99■□□□□ 0.63
SMC4Q12267 YKR040CYKR040C 504 nt18.93■□□□□ 0.62
SMC4Q12267 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt18.82■□□□□ 0.6
SMC4Q12267 ART5YGR068C 1761 nt18.77■□□□□ 0.59
SMC4Q12267 YMR057CYMR057C 372 nt18.74■□□□□ 0.59
SMC4Q12267 RPP2AYOL039W 321 nt18.73■□□□□ 0.59
SMC4Q12267 HUA1YGR268C 597 nt18.7■□□□□ 0.58
SMC4Q12267 CAC2YML102W 1407 nt18.68■□□□□ 0.58
SMC4Q12267 TCD2YKL027W 1344 nt18.67■□□□□ 0.58
SMC4Q12267 PTH1YHR189W 573 nt18.66■□□□□ 0.58
SMC4Q12267 GFD2YCL036W 1701 nt18.65■□□□□ 0.58
SMC4Q12267 YDR094WYDR094W 336 nt18.62■□□□□ 0.57
SMC4Q12267 PTP1YDL230W 1008 nt18.59■□□□□ 0.57
SMC4Q12267 RTS2YOR077W 699 nt18.57■□□□□ 0.56
SMC4Q12267 FRD1YEL047C 1413 nt18.54■□□□□ 0.56
SMC4Q12267 PET9YBL030C 957 nt18.52■□□□□ 0.56
SMC4Q12267 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt18.48■□□□□ 0.55
SMC4Q12267 DED1YOR204W 1815 nt18.47■□□□□ 0.55
SMC4Q12267 MEP2YNL142W 1500 nt18.42■□□□□ 0.54
SMC4Q12267 RRD1YIL153W 1182 nt18.41■□□□□ 0.54
SMC4Q12267 DCW1YKL046C 1350 nt18.35■□□□□ 0.53
SMC4Q12267 YCL042WYCL042W 360 nt18.35■□□□□ 0.53
SMC4Q12267 FPS1YLL043W 2010 nt18.33■□□□□ 0.52
SMC4Q12267 YKL030WYKL030W 606 nt18.29■□□□□ 0.52
SMC4Q12267 YLR235CYLR235C 399 nt18.27■□□□□ 0.52
SMC4Q12267 SOR2YDL246C 1074 nt18.26■□□□□ 0.51
SMC4Q12267 SOR1YJR159W 1074 nt18.26■□□□□ 0.51
SMC4Q12267 LCB1YMR296C 1677 nt18.26■□□□□ 0.51
SMC4Q12267 FMT1YBL013W 1206 nt18.25■□□□□ 0.51
SMC4Q12267 PAU16YKL224C 372 nt18.17■□□□□ 0.5
SMC4Q12267 SBA1YKL117W 651 nt18.1■□□□□ 0.49
SMC4Q12267 CWP1YKL096W 720 nt18.09■□□□□ 0.49
SMC4Q12267 IRC15YPL017C 1500 nt18.09■□□□□ 0.49
SMC4Q12267 CUE1YMR264W 612 nt18.08■□□□□ 0.49
SMC4Q12267 EMI2YDR516C 1503 nt18.04■□□□□ 0.48
SMC4Q12267 PRE6YOL038W 765 nt18.04■□□□□ 0.48
SMC4Q12267 SPT5YML010W 3192 nt18.01■□□□□ 0.47
SMC4Q12267 ADH2YMR303C 1047 nt17.98■□□□□ 0.47
SMC4Q12267 TIM23YNR017W 669 nt17.96■□□□□ 0.47
SMC4Q12267 YDL221WYDL221W 552 nt17.95■□□□□ 0.46
SMC4Q12267 DIC1YLR348C 897 nt17.95■□□□□ 0.46
SMC4Q12267 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt17.92■□□□□ 0.46
SMC4Q12267 FMP52YER004W 696 nt17.9■□□□□ 0.46
SMC4Q12267 YIL100WYIL100W 354 nt17.9■□□□□ 0.46
SMC4Q12267 GIS3YLR094C 1509 nt17.89■□□□□ 0.45
SMC4Q12267 YFR018CYFR018C 1092 nt17.87■□□□□ 0.45
SMC4Q12267 YLR179CYLR179C 606 nt17.86■□□□□ 0.45
SMC4Q12267 RRT5YFR032C 870 nt17.82■□□□□ 0.44
SMC4Q12267 SNF6YHL025W 999 nt17.75■□□□□ 0.43
SMC4Q12267 YMR090WYMR090W 684 nt17.68■□□□□ 0.42
SMC4Q12267 YPR064WYPR064W 420 nt17.68■□□□□ 0.42
SMC4Q12267 PCM1YEL058W 1674 nt17.66■□□□□ 0.42
SMC4Q12267 WSC2YNL283C 1512 nt17.62■□□□□ 0.41
SMC4Q12267 SCC4YER147C 1875 nt17.59■□□□□ 0.41
SMC4Q12267 YFL066CYFL066C 1179 nt17.57■□□□□ 0.4
SMC4Q12267 TAD3YLR316C 969 nt17.57■□□□□ 0.4
SMC4Q12267 SDH1YKL148C 1923 nt17.55■□□□□ 0.4
SMC4Q12267 PEX25YPL112C 1185 nt17.53■□□□□ 0.4
SMC4Q12267 YIH1YCR059C 777 nt17.51■□□□□ 0.39
SMC4Q12267 RNQ1YCL028W 1218 nt17.51■□□□□ 0.39
SMC4Q12267 AHT1YHR093W 549 nt17.44■□□□□ 0.38
SMC4Q12267 NAT4YMR069W 858 nt17.43■□□□□ 0.38
SMC4Q12267 YLL053CYLL053C 459 nt17.39■□□□□ 0.38
SMC4Q12267 YSC84YHR016C 1407 nt17.38■□□□□ 0.37
SMC4Q12267 YNL115CYNL115C 1935 nt17.36■□□□□ 0.37
SMC4Q12267 BIO4YNR057C 714 nt17.36■□□□□ 0.37
SMC4Q12267 YBR220CYBR220C 1683 nt17.35■□□□□ 0.37
SMC4Q12267 YNL195CYNL195C 786 nt17.35■□□□□ 0.37
SMC4Q12267 GLK1YCL040W 1503 nt17.35■□□□□ 0.37
SMC4Q12267 SSA4YER103W 1929 nt17.3■□□□□ 0.36
SMC4Q12267 FTR1YER145C 1215 nt17.3■□□□□ 0.36
SMC4Q12267 BDH1YAL060W 1149 nt17.29■□□□□ 0.36
SMC4Q12267 YSP3YOR003W 1437 nt17.28■□□□□ 0.36
SMC4Q12267 RRT12YCR045C 1476 nt17.26■□□□□ 0.35
SMC4Q12267 YLR415CYLR415C 339 nt17.25■□□□□ 0.35
SMC4Q12267 GAL1YBR020W 1587 nt17.25■□□□□ 0.35
SMC4Q12267 TRM5YHR070W 1500 nt17.24■□□□□ 0.35
SMC4Q12267 SIM1YIL123W 1431 nt17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.9 ms