Protein–RNA interactions for Protein: Q08923

CTI6, Histone deacetylase complex subunit CTI6, yeastyeast

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTI6Q08923 CCT6YDR188W 1641 nt15.21■□□□□ 0.02
CTI6Q08923 SPT5YML010W 3192 nt15.13■□□□□ 0.01
CTI6Q08923 ADO1YJR105W 1023 nt15.1■□□□□ 0.01
CTI6Q08923 UBX6YJL048C 1191 nt15.09■□□□□ 0.01
CTI6Q08923 LPX1YOR084W 1164 nt15.08■□□□□ 0
CTI6Q08923 SPP1YPL138C 1062 nt15.08■□□□□ 0
CTI6Q08923 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt15.07■□□□□ 0
CTI6Q08923 YEL076CYEL076C 651 nt15.07■□□□□ 0
CTI6Q08923 YLR464WYLR464W 651 nt15.07■□□□□ 0
CTI6Q08923 ERV46YAL042W 1248 nt15.05■□□□□ -0
CTI6Q08923 RTG1YOL067C 534 nt15.03■□□□□ -0
CTI6Q08923 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.95□□□□□ -0.02
CTI6Q08923 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.95□□□□□ -0.02
CTI6Q08923 SIS1YNL007C 1059 nt14.95□□□□□ -0.02
CTI6Q08923 YJL152WYJL152W 360 nt14.92□□□□□ -0.02
CTI6Q08923 IDH1YNL037C 1083 nt14.88□□□□□ -0.03
CTI6Q08923 ALF1YNL148C 765 nt14.87□□□□□ -0.03
CTI6Q08923 YKR040CYKR040C 504 nt14.85□□□□□ -0.03
CTI6Q08923 YDR433WYDR433W 441 nt14.82□□□□□ -0.04
CTI6Q08923 YPS1YLR120C 1710 nt14.76□□□□□ -0.05
CTI6Q08923 YDR095CYDR095C 411 nt14.76□□□□□ -0.05
CTI6Q08923 TIR4YOR009W 1464 nt14.7□□□□□ -0.06
CTI6Q08923 GBP2YCL011C 1284 nt14.7□□□□□ -0.06
CTI6Q08923 MXR2YCL033C 507 nt14.7□□□□□ -0.06
CTI6Q08923 YDR094WYDR094W 336 nt14.67□□□□□ -0.06
CTI6Q08923 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt14.64□□□□□ -0.07
CTI6Q08923 HUA1YGR268C 597 nt14.63□□□□□ -0.07
CTI6Q08923 SSA4YER103W 1929 nt14.56□□□□□ -0.08
CTI6Q08923 CAC2YML102W 1407 nt14.54□□□□□ -0.08
CTI6Q08923 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.49□□□□□ -0.09
CTI6Q08923 RPP2AYOL039W 321 nt14.48□□□□□ -0.09
CTI6Q08923 ART5YGR068C 1761 nt14.47□□□□□ -0.09
CTI6Q08923 YMR057CYMR057C 372 nt14.46□□□□□ -0.09
CTI6Q08923 PTP1YDL230W 1008 nt14.44□□□□□ -0.1
CTI6Q08923 FRD1YEL047C 1413 nt14.43□□□□□ -0.1
CTI6Q08923 PET9YBL030C 957 nt14.43□□□□□ -0.1
CTI6Q08923 TCD2YKL027W 1344 nt14.42□□□□□ -0.1
CTI6Q08923 DED1YOR204W 1815 nt14.4□□□□□ -0.1
CTI6Q08923 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.39□□□□□ -0.11
CTI6Q08923 GFD2YCL036W 1701 nt14.35□□□□□ -0.11
CTI6Q08923 MEP2YNL142W 1500 nt14.34□□□□□ -0.11
CTI6Q08923 RRD1YIL153W 1182 nt14.32□□□□□ -0.12
CTI6Q08923 PTH1YHR189W 573 nt14.29□□□□□ -0.12
CTI6Q08923 YKL030WYKL030W 606 nt14.28□□□□□ -0.12
CTI6Q08923 FMT1YBL013W 1206 nt14.23□□□□□ -0.13
CTI6Q08923 FPS1YLL043W 2010 nt14.22□□□□□ -0.13
CTI6Q08923 SBA1YKL117W 651 nt14.21□□□□□ -0.13
CTI6Q08923 YLR235CYLR235C 399 nt14.21□□□□□ -0.13
CTI6Q08923 DCW1YKL046C 1350 nt14.21□□□□□ -0.14
CTI6Q08923 SOR2YDL246C 1074 nt14.18□□□□□ -0.14
CTI6Q08923 SOR1YJR159W 1074 nt14.18□□□□□ -0.14
CTI6Q08923 LCB1YMR296C 1677 nt14.17□□□□□ -0.14
CTI6Q08923 BDF1YLR399C 2061 nt14.17□□□□□ -0.14
CTI6Q08923 YCL042WYCL042W 360 nt14.14□□□□□ -0.15
CTI6Q08923 PAU16YKL224C 372 nt14.11□□□□□ -0.15
CTI6Q08923 YFR018CYFR018C 1092 nt14.07□□□□□ -0.16
CTI6Q08923 RTS2YOR077W 699 nt14.04□□□□□ -0.16
CTI6Q08923 PRE6YOL038W 765 nt14□□□□□ -0.17
CTI6Q08923 IRC15YPL017C 1500 nt13.97□□□□□ -0.17
CTI6Q08923 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.95□□□□□ -0.18
CTI6Q08923 CUE1YMR264W 612 nt13.95□□□□□ -0.18
CTI6Q08923 FMP52YER004W 696 nt13.94□□□□□ -0.18
CTI6Q08923 RRT5YFR032C 870 nt13.94□□□□□ -0.18
CTI6Q08923 CWP1YKL096W 720 nt13.92□□□□□ -0.18
CTI6Q08923 TAT1YBR069C 1860 nt13.91□□□□□ -0.18
CTI6Q08923 EMI2YDR516C 1503 nt13.9□□□□□ -0.18
CTI6Q08923 ADH2YMR303C 1047 nt13.9□□□□□ -0.18
CTI6Q08923 TIM23YNR017W 669 nt13.9□□□□□ -0.18
CTI6Q08923 YBR220CYBR220C 1683 nt13.87□□□□□ -0.19
CTI6Q08923 GIS3YLR094C 1509 nt13.82□□□□□ -0.2
CTI6Q08923 YDL221WYDL221W 552 nt13.82□□□□□ -0.2
CTI6Q08923 DIC1YLR348C 897 nt13.82□□□□□ -0.2
CTI6Q08923 YLR179CYLR179C 606 nt13.77□□□□□ -0.21
CTI6Q08923 SNF6YHL025W 999 nt13.76□□□□□ -0.21
CTI6Q08923 YPR064WYPR064W 420 nt13.75□□□□□ -0.21
CTI6Q08923 TAD3YLR316C 969 nt13.74□□□□□ -0.21
CTI6Q08923 WSC2YNL283C 1512 nt13.73□□□□□ -0.21
CTI6Q08923 YFL066CYFL066C 1179 nt13.72□□□□□ -0.21
CTI6Q08923 AHT1YHR093W 549 nt13.71□□□□□ -0.21
CTI6Q08923 PCM1YEL058W 1674 nt13.71□□□□□ -0.21
CTI6Q08923 SDH1YKL148C 1923 nt13.7□□□□□ -0.22
CTI6Q08923 YIL100WYIL100W 354 nt13.69□□□□□ -0.22
CTI6Q08923 RNQ1YCL028W 1218 nt13.68□□□□□ -0.22
CTI6Q08923 YIH1YCR059C 777 nt13.64□□□□□ -0.23
CTI6Q08923 YMR090WYMR090W 684 nt13.63□□□□□ -0.23
CTI6Q08923 PEX25YPL112C 1185 nt13.61□□□□□ -0.23
CTI6Q08923 NAT4YMR069W 858 nt13.57□□□□□ -0.24
CTI6Q08923 YSP3YOR003W 1437 nt13.56□□□□□ -0.24
CTI6Q08923 SCC4YER147C 1875 nt13.55□□□□□ -0.24
CTI6Q08923 BDH1YAL060W 1149 nt13.54□□□□□ -0.24
CTI6Q08923 YNL115CYNL115C 1935 nt13.49□□□□□ -0.25
CTI6Q08923 YLL053CYLL053C 459 nt13.45□□□□□ -0.26
CTI6Q08923 MSF1YPR047W 1410 nt13.45□□□□□ -0.26
CTI6Q08923 GLK1YCL040W 1503 nt13.44□□□□□ -0.26
CTI6Q08923 YSC84YHR016C 1407 nt13.43□□□□□ -0.26
CTI6Q08923 AQY1YPR192W 918 nt13.42□□□□□ -0.26
CTI6Q08923 FTR1YER145C 1215 nt13.41□□□□□ -0.26
CTI6Q08923 YMR244WYMR244W 1068 nt13.41□□□□□ -0.26
CTI6Q08923 MIR1YJR077C 936 nt13.4□□□□□ -0.26
CTI6Q08923 YLR415CYLR415C 339 nt13.38□□□□□ -0.27
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