Protein–RNA interactions for Protein: Q08387

DNL4, DNA ligase 4, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 944 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNL4Q08387 YDR095CYDR095C 411 nt13.1□□□□□ -0.31
DNL4Q08387 FMP45YDL222C 930 nt13.09□□□□□ -0.31
DNL4Q08387 YLR236CYLR236C 324 nt13.07□□□□□ -0.32
DNL4Q08387 YPR011CYPR011C 981 nt13.04□□□□□ -0.32
DNL4Q08387 YJL152WYJL152W 360 nt13.02□□□□□ -0.33
DNL4Q08387 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13□□□□□ -0.33
DNL4Q08387 YCH1YGR203W 447 nt12.96□□□□□ -0.33
DNL4Q08387 SIS1YNL007C 1059 nt12.96□□□□□ -0.33
DNL4Q08387 IDH1YNL037C 1083 nt12.9□□□□□ -0.34
DNL4Q08387 PAC11YDR488C 1602 nt12.88□□□□□ -0.35
DNL4Q08387 RPP2AYOL039W 321 nt12.85□□□□□ -0.35
DNL4Q08387 TIR4YOR009W 1464 nt12.85□□□□□ -0.35
DNL4Q08387 LPX1YOR084W 1164 nt12.83□□□□□ -0.36
DNL4Q08387 SPT5YML010W 3192 nt12.83□□□□□ -0.36
DNL4Q08387 ERV46YAL042W 1248 nt12.81□□□□□ -0.36
DNL4Q08387 SSA4YER103W 1929 nt12.78□□□□□ -0.36
DNL4Q08387 MEP2YNL142W 1500 nt12.78□□□□□ -0.36
DNL4Q08387 YDR433WYDR433W 441 nt12.77□□□□□ -0.37
DNL4Q08387 MRPL8YJL063C 717 nt12.75□□□□□ -0.37
DNL4Q08387 ART5YGR068C 1761 nt12.74□□□□□ -0.37
DNL4Q08387 NVJ2YPR091C 2313 nt12.74□□□□□ -0.37
DNL4Q08387 PTP1YDL230W 1008 nt12.73□□□□□ -0.37
DNL4Q08387 GBP2YCL011C 1284 nt12.73□□□□□ -0.37
DNL4Q08387 PET9YBL030C 957 nt12.7□□□□□ -0.38
DNL4Q08387 CAC2YML102W 1407 nt12.69□□□□□ -0.38
DNL4Q08387 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12.68□□□□□ -0.38
DNL4Q08387 YKR040CYKR040C 504 nt12.67□□□□□ -0.38
DNL4Q08387 YMR057CYMR057C 372 nt12.66□□□□□ -0.38
DNL4Q08387 SPP1YPL138C 1062 nt12.66□□□□□ -0.38
DNL4Q08387 GFD2YCL036W 1701 nt12.65□□□□□ -0.38
DNL4Q08387 MXR2YCL033C 507 nt12.61□□□□□ -0.39
DNL4Q08387 ADO1YJR105W 1023 nt12.6□□□□□ -0.39
DNL4Q08387 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.58□□□□□ -0.4
DNL4Q08387 YEL076CYEL076C 651 nt12.58□□□□□ -0.4
DNL4Q08387 YLR464WYLR464W 651 nt12.58□□□□□ -0.4
DNL4Q08387 DCW1YKL046C 1350 nt12.57□□□□□ -0.4
DNL4Q08387 TCD2YKL027W 1344 nt12.56□□□□□ -0.4
DNL4Q08387 FPS1YLL043W 2010 nt12.53□□□□□ -0.4
DNL4Q08387 RTG1YOL067C 534 nt12.52□□□□□ -0.41
DNL4Q08387 RTS2YOR077W 699 nt12.48□□□□□ -0.41
DNL4Q08387 BDF1YLR399C 2061 nt12.46□□□□□ -0.42
DNL4Q08387 EMI2YDR516C 1503 nt12.45□□□□□ -0.42
DNL4Q08387 DED1YOR204W 1815 nt12.4□□□□□ -0.42
DNL4Q08387 YDL221WYDL221W 552 nt12.4□□□□□ -0.42
DNL4Q08387 RRD1YIL153W 1182 nt12.39□□□□□ -0.43
DNL4Q08387 IRC15YPL017C 1500 nt12.37□□□□□ -0.43
DNL4Q08387 YMR090WYMR090W 684 nt12.37□□□□□ -0.43
DNL4Q08387 CUE1YMR264W 612 nt12.37□□□□□ -0.43
DNL4Q08387 FRD1YEL047C 1413 nt12.37□□□□□ -0.43
DNL4Q08387 HUA1YGR268C 597 nt12.35□□□□□ -0.43
DNL4Q08387 YCL042WYCL042W 360 nt12.33□□□□□ -0.44
DNL4Q08387 UBX6YJL048C 1191 nt12.31□□□□□ -0.44
DNL4Q08387 GIS3YLR094C 1509 nt12.29□□□□□ -0.44
DNL4Q08387 SOR2YDL246C 1074 nt12.27□□□□□ -0.45
DNL4Q08387 SOR1YJR159W 1074 nt12.27□□□□□ -0.45
DNL4Q08387 PTH1YHR189W 573 nt12.25□□□□□ -0.45
DNL4Q08387 FMT1YBL013W 1206 nt12.25□□□□□ -0.45
DNL4Q08387 YIL100WYIL100W 354 nt12.24□□□□□ -0.45
DNL4Q08387 TAT1YBR069C 1860 nt12.24□□□□□ -0.45
DNL4Q08387 FMP52YER004W 696 nt12.22□□□□□ -0.45
DNL4Q08387 YLR235CYLR235C 399 nt12.22□□□□□ -0.45
DNL4Q08387 YKL030WYKL030W 606 nt12.19□□□□□ -0.46
DNL4Q08387 SDH1YKL148C 1923 nt12.17□□□□□ -0.46
DNL4Q08387 SCC4YER147C 1875 nt12.17□□□□□ -0.46
DNL4Q08387 CWP1YKL096W 720 nt12.15□□□□□ -0.46
DNL4Q08387 YDR094WYDR094W 336 nt12.14□□□□□ -0.47
DNL4Q08387 LCB1YMR296C 1677 nt12.1□□□□□ -0.47
DNL4Q08387 ADH2YMR303C 1047 nt12.09□□□□□ -0.47
DNL4Q08387 YBR220CYBR220C 1683 nt12.08□□□□□ -0.48
DNL4Q08387 SNF6YHL025W 999 nt12.01□□□□□ -0.49
DNL4Q08387 DIC1YLR348C 897 nt12.01□□□□□ -0.49
DNL4Q08387 PCM1YEL058W 1674 nt12□□□□□ -0.49
DNL4Q08387 TIM23YNR017W 669 nt11.99□□□□□ -0.49
DNL4Q08387 YNL195CYNL195C 786 nt11.98□□□□□ -0.49
DNL4Q08387 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.92□□□□□ -0.5
DNL4Q08387 YLR179CYLR179C 606 nt11.92□□□□□ -0.5
DNL4Q08387 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.91□□□□□ -0.5
DNL4Q08387 RNQ1YCL028W 1218 nt11.9□□□□□ -0.5
DNL4Q08387 YIH1YCR059C 777 nt11.88□□□□□ -0.51
DNL4Q08387 YPR064WYPR064W 420 nt11.87□□□□□ -0.51
DNL4Q08387 RRT12YCR045C 1476 nt11.83□□□□□ -0.52
DNL4Q08387 YFR018CYFR018C 1092 nt11.81□□□□□ -0.52
DNL4Q08387 YSC84YHR016C 1407 nt11.8□□□□□ -0.52
DNL4Q08387 TAD3YLR316C 969 nt11.79□□□□□ -0.52
DNL4Q08387 RRT5YFR032C 870 nt11.78□□□□□ -0.52
DNL4Q08387 PAU16YKL224C 372 nt11.78□□□□□ -0.52
DNL4Q08387 WSC2YNL283C 1512 nt11.77□□□□□ -0.52
DNL4Q08387 AHT1YHR093W 549 nt11.76□□□□□ -0.53
DNL4Q08387 UME6YDR207C 2511 nt11.76□□□□□ -0.53
DNL4Q08387 YLL053CYLL053C 459 nt11.75□□□□□ -0.53
DNL4Q08387 BIO4YNR057C 714 nt11.75□□□□□ -0.53
DNL4Q08387 SIM1YIL123W 1431 nt11.75□□□□□ -0.53
DNL4Q08387 YHL050CYHL050C 2094 nt11.74□□□□□ -0.53
DNL4Q08387 AQY1YPR192W 918 nt11.73□□□□□ -0.53
DNL4Q08387 PRE6YOL038W 765 nt11.71□□□□□ -0.53
DNL4Q08387 FTR1YER145C 1215 nt11.7□□□□□ -0.54
DNL4Q08387 GAL1YBR020W 1587 nt11.67□□□□□ -0.54
DNL4Q08387 SEC11YIR022W 504 nt11.63□□□□□ -0.55
DNL4Q08387 TRM5YHR070W 1500 nt11.62□□□□□ -0.55
DNL4Q08387 PEX25YPL112C 1185 nt11.61□□□□□ -0.55
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