Protein–RNA interactions for Protein: Q06629

HDA2, HDA1 complex subunit 2, yeastyeast

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HDA2Q06629 SIS1YNL007C 1059 nt11.22□□□□□ -0.61
HDA2Q06629 EMI2YDR516C 1503 nt11.21□□□□□ -0.61
HDA2Q06629 BDF1YLR399C 2061 nt11.21□□□□□ -0.62
HDA2Q06629 PTP1YDL230W 1008 nt11.2□□□□□ -0.62
HDA2Q06629 YJL225CYJL225C 5277 nt11.19□□□□□ -0.62
HDA2Q06629 YMR090WYMR090W 684 nt11.18□□□□□ -0.62
HDA2Q06629 CAC2YML102W 1407 nt11.15□□□□□ -0.62
HDA2Q06629 NVJ2YPR091C 2313 nt11.12□□□□□ -0.63
HDA2Q06629 YLR281CYLR281C 468 nt11.12□□□□□ -0.63
HDA2Q06629 YDL221WYDL221W 552 nt11.1□□□□□ -0.63
HDA2Q06629 tM(CAU)CtM(CAU)C 72 nt11.1□□□□□ -0.63
HDA2Q06629 IMT4tM(CAU)E 72 nt11.1□□□□□ -0.63
HDA2Q06629 IMT3tM(CAU)J3 72 nt11.1□□□□□ -0.63
HDA2Q06629 IMT1tM(CAU)O1 72 nt11.1□□□□□ -0.63
HDA2Q06629 IMT2tM(CAU)P 72 nt11.1□□□□□ -0.63
HDA2Q06629 WHI5YOR083W 888 nt11.07□□□□□ -0.64
HDA2Q06629 TAT1YBR069C 1860 nt11.06□□□□□ -0.64
HDA2Q06629 ART5YGR068C 1761 nt11.05□□□□□ -0.64
HDA2Q06629 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.03□□□□□ -0.64
HDA2Q06629 GFD2YCL036W 1701 nt11.02□□□□□ -0.65
HDA2Q06629 YBR220CYBR220C 1683 nt11.01□□□□□ -0.65
HDA2Q06629 PET9YBL030C 957 nt11□□□□□ -0.65
HDA2Q06629 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.99□□□□□ -0.65
HDA2Q06629 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.99□□□□□ -0.65
HDA2Q06629 TIR4YOR009W 1464 nt10.99□□□□□ -0.65
HDA2Q06629 SDH1YKL148C 1923 nt10.98□□□□□ -0.65
HDA2Q06629 PUS2YGL063W 1113 nt10.98□□□□□ -0.65
HDA2Q06629 YCH1YGR203W 447 nt10.98□□□□□ -0.65
HDA2Q06629 IRC15YPL017C 1500 nt10.98□□□□□ -0.65
HDA2Q06629 FPS1YLL043W 2010 nt10.97□□□□□ -0.65
HDA2Q06629 YJL152WYJL152W 360 nt10.95□□□□□ -0.66
HDA2Q06629 RTS2YOR077W 699 nt10.94□□□□□ -0.66
HDA2Q06629 SCC4YER147C 1875 nt10.91□□□□□ -0.66
HDA2Q06629 GIS3YLR094C 1509 nt10.9□□□□□ -0.66
HDA2Q06629 YMR057CYMR057C 372 nt10.89□□□□□ -0.67
HDA2Q06629 YPR011CYPR011C 981 nt10.85□□□□□ -0.67
HDA2Q06629 YLR236CYLR236C 324 nt10.84□□□□□ -0.67
HDA2Q06629 DSK2YMR276W 1122 nt10.84□□□□□ -0.67
HDA2Q06629 CUE1YMR264W 612 nt10.83□□□□□ -0.68
HDA2Q06629 IMP2'YIL154C 1041 nt10.81□□□□□ -0.68
HDA2Q06629 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt10.79□□□□□ -0.68
HDA2Q06629 YIL100WYIL100W 354 nt10.74□□□□□ -0.69
HDA2Q06629 IDH1YNL037C 1083 nt10.72□□□□□ -0.69
HDA2Q06629 FMP45YDL222C 930 nt10.71□□□□□ -0.69
HDA2Q06629 SEC11YIR022W 504 nt10.67□□□□□ -0.7
HDA2Q06629 YNL195CYNL195C 786 nt10.66□□□□□ -0.7
HDA2Q06629 YSC84YHR016C 1407 nt10.66□□□□□ -0.7
HDA2Q06629 ERV46YAL042W 1248 nt10.65□□□□□ -0.7
HDA2Q06629 GBP2YCL011C 1284 nt10.64□□□□□ -0.71
HDA2Q06629 LPX1YOR084W 1164 nt10.63□□□□□ -0.71
HDA2Q06629 PCH2YBR186W 1695 nt10.6□□□□□ -0.71
HDA2Q06629 RRT12YCR045C 1476 nt10.59□□□□□ -0.71
HDA2Q06629 YDR433WYDR433W 441 nt10.57□□□□□ -0.72
HDA2Q06629 CSM2YIL132C 642 nt10.56□□□□□ -0.72
HDA2Q06629 YHL050CYHL050C 2094 nt10.55□□□□□ -0.72
HDA2Q06629 RRD1YIL153W 1182 nt10.55□□□□□ -0.72
HDA2Q06629 DED1YOR204W 1815 nt10.54□□□□□ -0.72
HDA2Q06629 MXR2YCL033C 507 nt10.54□□□□□ -0.72
HDA2Q06629 GUT2YIL155C 1950 nt10.53□□□□□ -0.72
HDA2Q06629 TCD2YKL027W 1344 nt10.53□□□□□ -0.72
HDA2Q06629 YKR040CYKR040C 504 nt10.52□□□□□ -0.73
HDA2Q06629 MRPL8YJL063C 717 nt10.45□□□□□ -0.74
HDA2Q06629 SPP1YPL138C 1062 nt10.45□□□□□ -0.74
HDA2Q06629 FMP52YER004W 696 nt10.43□□□□□ -0.74
HDA2Q06629 FMT1YBL013W 1206 nt10.43□□□□□ -0.74
HDA2Q06629 MET8YBR213W 825 nt10.43□□□□□ -0.74
HDA2Q06629 FRD1YEL047C 1413 nt10.39□□□□□ -0.75
HDA2Q06629 SOR2YDL246C 1074 nt10.38□□□□□ -0.75
HDA2Q06629 SOR1YJR159W 1074 nt10.38□□□□□ -0.75
HDA2Q06629 CLB6YGR109C 1143 nt10.37□□□□□ -0.75
HDA2Q06629 RTF1YGL244W 1677 nt10.37□□□□□ -0.75
HDA2Q06629 BOP3YNL042W 1191 nt10.36□□□□□ -0.75
HDA2Q06629 CWP1YKL096W 720 nt10.33□□□□□ -0.76
HDA2Q06629 YCL042WYCL042W 360 nt10.32□□□□□ -0.76
HDA2Q06629 PCM1YEL058W 1674 nt10.31□□□□□ -0.76
HDA2Q06629 ADO1YJR105W 1023 nt10.31□□□□□ -0.76
HDA2Q06629 PIB2YGL023C 1908 nt10.3□□□□□ -0.76
HDA2Q06629 ADH2YMR303C 1047 nt10.29□□□□□ -0.76
HDA2Q06629 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt10.28□□□□□ -0.76
HDA2Q06629 YEL076CYEL076C 651 nt10.28□□□□□ -0.76
HDA2Q06629 YLR464WYLR464W 651 nt10.28□□□□□ -0.76
HDA2Q06629 RTG1YOL067C 534 nt10.28□□□□□ -0.76
HDA2Q06629 SNF6YHL025W 999 nt10.27□□□□□ -0.77
HDA2Q06629 UME6YDR207C 2511 nt10.27□□□□□ -0.77
HDA2Q06629 LCB1YMR296C 1677 nt10.25□□□□□ -0.77
HDA2Q06629 SIM1YIL123W 1431 nt10.24□□□□□ -0.77
HDA2Q06629 NCP1YHR042W 2076 nt10.21□□□□□ -0.78
HDA2Q06629 UBX6YJL048C 1191 nt10.18□□□□□ -0.78
HDA2Q06629 PAU21YOR394W 495 nt10.18□□□□□ -0.78
HDA2Q06629 PAU22YPL282C 495 nt10.18□□□□□ -0.78
HDA2Q06629 PTH1YHR189W 573 nt10.17□□□□□ -0.78
HDA2Q06629 BIO4YNR057C 714 nt10.17□□□□□ -0.78
HDA2Q06629 PTK1YKL198C 1989 nt10.15□□□□□ -0.78
HDA2Q06629 YIH1YCR059C 777 nt10.13□□□□□ -0.79
HDA2Q06629 YLR235CYLR235C 399 nt10.13□□□□□ -0.79
HDA2Q06629 RNQ1YCL028W 1218 nt10.11□□□□□ -0.79
HDA2Q06629 BOR1YNL275W 1731 nt10.1□□□□□ -0.79
HDA2Q06629 DIC1YLR348C 897 nt10.09□□□□□ -0.79
HDA2Q06629 YKL030WYKL030W 606 nt10.08□□□□□ -0.8
HDA2Q06629 YLL053CYLL053C 459 nt10.07□□□□□ -0.8
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