Protein–RNA interactions for Protein: Q06593

OPT2, Oligopeptide transporter 2, yeastyeast

Predictions only

Length 877 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
OPT2Q06593 MEP2YNL142W 1500 nt11.99□□□□□ -0.49
OPT2Q06593 YLR236CYLR236C 324 nt11.98□□□□□ -0.49
OPT2Q06593 TRM9YML014W 840 nt11.98□□□□□ -0.49
OPT2Q06593 FIS1YIL065C 468 nt11.95□□□□□ -0.5
OPT2Q06593 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.92□□□□□ -0.5
OPT2Q06593 BDF1YLR399C 2061 nt11.9□□□□□ -0.5
OPT2Q06593 FUN26YAL022C 1554 nt11.88□□□□□ -0.51
OPT2Q06593 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.87□□□□□ -0.51
OPT2Q06593 YEL076CYEL076C 651 nt11.87□□□□□ -0.51
OPT2Q06593 PHO4YFR034C 939 nt11.87□□□□□ -0.51
OPT2Q06593 CSM2YIL132C 642 nt11.87□□□□□ -0.51
OPT2Q06593 UBX6YJL048C 1191 nt11.87□□□□□ -0.51
OPT2Q06593 YLR464WYLR464W 651 nt11.87□□□□□ -0.51
OPT2Q06593 CCT6YDR188W 1641 nt11.82□□□□□ -0.52
OPT2Q06593 YPS1YLR120C 1710 nt11.8□□□□□ -0.52
OPT2Q06593 ERV46YAL042W 1248 nt11.77□□□□□ -0.53
OPT2Q06593 TAT1YBR069C 1860 nt11.76□□□□□ -0.53
OPT2Q06593 LPX1YOR084W 1164 nt11.75□□□□□ -0.53
OPT2Q06593 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.74□□□□□ -0.53
OPT2Q06593 SIS1YNL007C 1059 nt11.74□□□□□ -0.53
OPT2Q06593 RTG1YOL067C 534 nt11.74□□□□□ -0.53
OPT2Q06593 DCW1YKL046C 1350 nt11.71□□□□□ -0.53
OPT2Q06593 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.71□□□□□ -0.53
OPT2Q06593 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.71□□□□□ -0.53
OPT2Q06593 YMR090WYMR090W 684 nt11.71□□□□□ -0.53
OPT2Q06593 SPP1YPL138C 1062 nt11.71□□□□□ -0.53
OPT2Q06593 PAU21YOR394W 495 nt11.7□□□□□ -0.54
OPT2Q06593 PAU22YPL282C 495 nt11.7□□□□□ -0.54
OPT2Q06593 YJL225CYJL225C 5277 nt11.68□□□□□ -0.54
OPT2Q06593 IDH1YNL037C 1083 nt11.68□□□□□ -0.54
OPT2Q06593 YJL152WYJL152W 360 nt11.67□□□□□ -0.54
OPT2Q06593 YDR095CYDR095C 411 nt11.65□□□□□ -0.54
OPT2Q06593 ALF1YNL148C 765 nt11.63□□□□□ -0.55
OPT2Q06593 YKR040CYKR040C 504 nt11.62□□□□□ -0.55
OPT2Q06593 EMI2YDR516C 1503 nt11.61□□□□□ -0.55
OPT2Q06593 YDR433WYDR433W 441 nt11.61□□□□□ -0.55
OPT2Q06593 VAR1Q0140 1197 nt11.59□□□□□ -0.55
OPT2Q06593 ARO7YPR060C 771 nt11.59□□□□□ -0.55
OPT2Q06593 YDR094WYDR094W 336 nt11.57□□□□□ -0.56
OPT2Q06593 HUA1YGR268C 597 nt11.57□□□□□ -0.56
OPT2Q06593 YBR220CYBR220C 1683 nt11.56□□□□□ -0.56
OPT2Q06593 PAM17YKR065C 594 nt11.52□□□□□ -0.57
OPT2Q06593 YDL221WYDL221W 552 nt11.5□□□□□ -0.57
OPT2Q06593 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt11.49□□□□□ -0.57
OPT2Q06593 GBP2YCL011C 1284 nt11.48□□□□□ -0.57
OPT2Q06593 SDH1YKL148C 1923 nt11.46□□□□□ -0.58
OPT2Q06593 RPP2AYOL039W 321 nt11.45□□□□□ -0.58
OPT2Q06593 MXR2YCL033C 507 nt11.42□□□□□ -0.58
OPT2Q06593 PAC11YDR488C 1602 nt11.39□□□□□ -0.59
OPT2Q06593 YDR509WYDR509W 348 nt11.39□□□□□ -0.59
OPT2Q06593 RDN37-1RDN37-1 5354 nt11.38□□□□□ -0.59
OPT2Q06593 RDN37-2RDN37-2 5354 nt11.38□□□□□ -0.59
OPT2Q06593 TIR4YOR009W 1464 nt11.37□□□□□ -0.59
OPT2Q06593 PTP1YDL230W 1008 nt11.36□□□□□ -0.59
OPT2Q06593 CAC2YML102W 1407 nt11.35□□□□□ -0.59
OPT2Q06593 SEC11YIR022W 504 nt11.35□□□□□ -0.59
OPT2Q06593 REG2YBR050C 1017 nt11.33□□□□□ -0.6
OPT2Q06593 SCC4YER147C 1875 nt11.31□□□□□ -0.6
OPT2Q06593 PCH2YBR186W 1695 nt11.3□□□□□ -0.6
OPT2Q06593 TCD2YKL027W 1344 nt11.29□□□□□ -0.6
OPT2Q06593 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.26□□□□□ -0.61
OPT2Q06593 GUT2YIL155C 1950 nt11.23□□□□□ -0.61
OPT2Q06593 NVJ2YPR091C 2313 nt11.22□□□□□ -0.61
OPT2Q06593 IRC15YPL017C 1500 nt11.2□□□□□ -0.62
OPT2Q06593 FRD1YEL047C 1413 nt11.2□□□□□ -0.62
OPT2Q06593 YKL030WYKL030W 606 nt11.2□□□□□ -0.62
OPT2Q06593 PET9YBL030C 957 nt11.19□□□□□ -0.62
OPT2Q06593 BUR6YER159C 429 nt11.18□□□□□ -0.62
OPT2Q06593 YMR057CYMR057C 372 nt11.18□□□□□ -0.62
OPT2Q06593 SBA1YKL117W 651 nt11.17□□□□□ -0.62
OPT2Q06593 YLR235CYLR235C 399 nt11.17□□□□□ -0.62
OPT2Q06593 GIS3YLR094C 1509 nt11.16□□□□□ -0.62
OPT2Q06593 ART5YGR068C 1761 nt11.16□□□□□ -0.62
OPT2Q06593 PTH1YHR189W 573 nt11.14□□□□□ -0.63
OPT2Q06593 BMT5YIL096C 1011 nt11.14□□□□□ -0.63
OPT2Q06593 GFD2YCL036W 1701 nt11.11□□□□□ -0.63
OPT2Q06593 DED1YOR204W 1815 nt11.11□□□□□ -0.63
OPT2Q06593 YCL042WYCL042W 360 nt11.09□□□□□ -0.63
OPT2Q06593 FPS1YLL043W 2010 nt11.09□□□□□ -0.63
OPT2Q06593 PAU16YKL224C 372 nt11.08□□□□□ -0.64
OPT2Q06593 YSC84YHR016C 1407 nt11.08□□□□□ -0.64
OPT2Q06593 RRD1YIL153W 1182 nt11.06□□□□□ -0.64
OPT2Q06593 LCB1YMR296C 1677 nt11.05□□□□□ -0.64
OPT2Q06593 Q0144Q0144 330 nt11.05□□□□□ -0.64
OPT2Q06593 YFR018CYFR018C 1092 nt11.04□□□□□ -0.64
OPT2Q06593 RRT5YFR032C 870 nt11.04□□□□□ -0.64
OPT2Q06593 SOR2YDL246C 1074 nt11.03□□□□□ -0.64
OPT2Q06593 SOR1YJR159W 1074 nt11.03□□□□□ -0.64
OPT2Q06593 RTS2YOR077W 699 nt11.01□□□□□ -0.65
OPT2Q06593 Q0010Q0010 387 nt11□□□□□ -0.65
OPT2Q06593 RTF1YGL244W 1677 nt10.99□□□□□ -0.65
OPT2Q06593 YNL195CYNL195C 786 nt10.98□□□□□ -0.65
OPT2Q06593 PIB2YGL023C 1908 nt10.97□□□□□ -0.65
OPT2Q06593 YHL050CYHL050C 2094 nt10.97□□□□□ -0.65
OPT2Q06593 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt10.97□□□□□ -0.65
OPT2Q06593 CUE1YMR264W 612 nt10.96□□□□□ -0.65
OPT2Q06593 FMT1YBL013W 1206 nt10.95□□□□□ -0.66
OPT2Q06593 SEM1YDR363W-A 270 nt10.93□□□□□ -0.66
OPT2Q06593 BOP3YNL042W 1191 nt10.93□□□□□ -0.66
OPT2Q06593 YIL100WYIL100W 354 nt10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.7 ms