Protein–RNA interactions for Protein: Q04006

UPS3, Protein UPS3, mitochondrial, yeastyeast

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UPS3Q04006 WWM1YFL010C 636 nt9.61□□□□□ -0.87
UPS3Q04006 CAC2YML102W 1407 nt9.6□□□□□ -0.87
UPS3Q04006 BOR1YNL275W 1731 nt9.59□□□□□ -0.87
UPS3Q04006 SIS1YNL007C 1059 nt9.59□□□□□ -0.87
UPS3Q04006 SCC4YER147C 1875 nt9.57□□□□□ -0.88
UPS3Q04006 YGR021WYGR021W 873 nt9.57□□□□□ -0.88
UPS3Q04006 YFL021C-AYFL021C-A 855 nt9.54□□□□□ -0.88
UPS3Q04006 MCH5YOR306C 1566 nt9.53□□□□□ -0.88
UPS3Q04006 IRC15YPL017C 1500 nt9.47□□□□□ -0.89
UPS3Q04006 RTF1YGL244W 1677 nt9.47□□□□□ -0.89
UPS3Q04006 GIS3YLR094C 1509 nt9.44□□□□□ -0.9
UPS3Q04006 YCH1YGR203W 447 nt9.43□□□□□ -0.9
UPS3Q04006 ART5YGR068C 1761 nt9.42□□□□□ -0.9
UPS3Q04006 PET9YBL030C 957 nt9.42□□□□□ -0.9
UPS3Q04006 GFD2YCL036W 1701 nt9.42□□□□□ -0.9
UPS3Q04006 YSC84YHR016C 1407 nt9.41□□□□□ -0.9
UPS3Q04006 HOM6YJR139C 1080 nt9.4□□□□□ -0.9
UPS3Q04006 RDN37-1RDN37-1 5354 nt9.39□□□□□ -0.91
UPS3Q04006 RDN37-2RDN37-2 5354 nt9.39□□□□□ -0.91
UPS3Q04006 PTK1YKL198C 1989 nt9.38□□□□□ -0.91
UPS3Q04006 SHU1YHL006C 453 nt9.36□□□□□ -0.91
UPS3Q04006 RTS2YOR077W 699 nt9.35□□□□□ -0.91
UPS3Q04006 YNL195CYNL195C 786 nt9.33□□□□□ -0.92
UPS3Q04006 YAL037C-BYAL037C-B 975 nt9.31□□□□□ -0.92
UPS3Q04006 CUE1YMR264W 612 nt9.31□□□□□ -0.92
UPS3Q04006 BOP3YNL042W 1191 nt9.31□□□□□ -0.92
UPS3Q04006 YHL050CYHL050C 2094 nt9.3□□□□□ -0.92
UPS3Q04006 ALG12YNR030W 1656 nt9.29□□□□□ -0.92
UPS3Q04006 YIL100WYIL100W 354 nt9.28□□□□□ -0.92
UPS3Q04006 RKM5YLR137W 1104 nt9.28□□□□□ -0.92
UPS3Q04006 MNP1YGL068W 585 nt9.26□□□□□ -0.93
UPS3Q04006 TIR4YOR009W 1464 nt9.25□□□□□ -0.93
UPS3Q04006 YMR057CYMR057C 372 nt9.23□□□□□ -0.93
UPS3Q04006 YLR236CYLR236C 324 nt9.22□□□□□ -0.93
UPS3Q04006 RRT12YCR045C 1476 nt9.21□□□□□ -0.93
UPS3Q04006 YKL097CYKL097C 411 nt9.17□□□□□ -0.94
UPS3Q04006 YJL152WYJL152W 360 nt9.15□□□□□ -0.94
UPS3Q04006 HSP60YLR259C 1719 nt9.14□□□□□ -0.95
UPS3Q04006 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt9.13□□□□□ -0.95
UPS3Q04006 SPT8YLR055C 1809 nt9.11□□□□□ -0.95
UPS3Q04006 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt9.11□□□□□ -0.95
UPS3Q04006 NPL3YDR432W 1245 nt9.1□□□□□ -0.95
UPS3Q04006 YOL037CYOL037C 354 nt9.08□□□□□ -0.96
UPS3Q04006 YFL054CYFL054C 1941 nt9.07□□□□□ -0.96
UPS3Q04006 NCP1YHR042W 2076 nt9.01□□□□□ -0.97
UPS3Q04006 NAR1YNL240C 1476 nt8.98□□□□□ -0.97
UPS3Q04006 HSL7YBR133C 2484 nt8.94□□□□□ -0.98
UPS3Q04006 GLK1YCL040W 1503 nt8.9□□□□□ -0.98
UPS3Q04006 IDH1YNL037C 1083 nt8.89□□□□□ -0.99
UPS3Q04006 FMP52YER004W 696 nt8.87□□□□□ -0.99
UPS3Q04006 WHI5YOR083W 888 nt8.87□□□□□ -0.99
UPS3Q04006 SWE1YJL187C 2460 nt8.86□□□□□ -0.99
UPS3Q04006 YLR281CYLR281C 468 nt8.83□□□□□ -1
UPS3Q04006 GBP2YCL011C 1284 nt8.83□□□□□ -1
UPS3Q04006 LCB1YMR296C 1677 nt8.83□□□□□ -1
UPS3Q04006 DSK2YMR276W 1122 nt8.82□□□□□ -1
UPS3Q04006 TCD2YKL027W 1344 nt8.81□□□□□ -1
UPS3Q04006 RDN25-1RDN25-1 3396 nt8.81□□□□□ -1
UPS3Q04006 RDN25-2RDN25-2 3396 nt8.81□□□□□ -1
UPS3Q04006 DED1YOR204W 1815 nt8.8□□□□□ -1
UPS3Q04006 SIM1YIL123W 1431 nt8.8□□□□□ -1
UPS3Q04006 RRD1YIL153W 1182 nt8.79□□□□□ -1
UPS3Q04006 IMP2'YIL154C 1041 nt8.79□□□□□ -1
UPS3Q04006 CMP2YML057W 1815 nt8.78□□□□□ -1
UPS3Q04006 PCM1YEL058W 1674 nt8.76□□□□□ -1.01
UPS3Q04006 YOR139CYOR139C 393 nt8.76□□□□□ -1.01
UPS3Q04006 PBP1YGR178C 2169 nt8.75□□□□□ -1.01
UPS3Q04006 AAC1YMR056C 930 nt8.73□□□□□ -1.01
UPS3Q04006 SNF6YHL025W 999 nt8.71□□□□□ -1.02
UPS3Q04006 CYT2YKL087C 675 nt8.7□□□□□ -1.02
UPS3Q04006 HEL2YDR266C 1920 nt8.69□□□□□ -1.02
UPS3Q04006 BIO5YNR056C 1686 nt8.68□□□□□ -1.02
UPS3Q04006 CWP1YKL096W 720 nt8.67□□□□□ -1.02
UPS3Q04006 FUR4YBR021W 1902 nt8.66□□□□□ -1.02
UPS3Q04006 YDR433WYDR433W 441 nt8.65□□□□□ -1.02
UPS3Q04006 BIO4YNR057C 714 nt8.65□□□□□ -1.02
UPS3Q04006 YCL042WYCL042W 360 nt8.65□□□□□ -1.02
UPS3Q04006 ERF2YLR246W 1080 nt8.64□□□□□ -1.03
UPS3Q04006 ADH2YMR303C 1047 nt8.64□□□□□ -1.03
UPS3Q04006 LYS4YDR234W 2082 nt8.64□□□□□ -1.03
UPS3Q04006 PRP4YPR178W 1398 nt8.63□□□□□ -1.03
UPS3Q04006 PUS2YGL063W 1113 nt8.63□□□□□ -1.03
UPS3Q04006 FMT1YBL013W 1206 nt8.62□□□□□ -1.03
UPS3Q04006 DPS1YLL018C 1674 nt8.6□□□□□ -1.03
UPS3Q04006 SOR2YDL246C 1074 nt8.59□□□□□ -1.03
UPS3Q04006 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt8.59□□□□□ -1.03
UPS3Q04006 YEL076CYEL076C 651 nt8.59□□□□□ -1.03
UPS3Q04006 SOR1YJR159W 1074 nt8.59□□□□□ -1.03
UPS3Q04006 YLR464WYLR464W 651 nt8.59□□□□□ -1.03
UPS3Q04006 RPM1RPM1 483 nt8.56□□□□□ -1.04
UPS3Q04006 SNF1YDR477W 1902 nt8.55□□□□□ -1.04
UPS3Q04006 FMP45YDL222C 930 nt8.55□□□□□ -1.04
UPS3Q04006 CRR1YLR213C 1269 nt8.55□□□□□ -1.04
UPS3Q04006 YIH1YCR059C 777 nt8.54□□□□□ -1.04
UPS3Q04006 RNQ1YCL028W 1218 nt8.53□□□□□ -1.04
UPS3Q04006 MXR2YCL033C 507 nt8.53□□□□□ -1.04
UPS3Q04006 HEM12YDR047W 1089 nt8.52□□□□□ -1.05
UPS3Q04006 YFL067WYFL067W 528 nt8.51□□□□□ -1.05
UPS3Q04006 YHR056W-AYHR056W-A 435 nt8.51□□□□□ -1.05
UPS3Q04006 YKR040CYKR040C 504 nt8.51□□□□□ -1.05
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