Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

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Length 461 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 DCW1YKL046C 1350 nt12.01□□□□□ -0.49
VHS1Q03785 PTP1YDL230W 1008 nt11.93□□□□□ -0.5
VHS1Q03785 PUS2YGL063W 1113 nt11.89□□□□□ -0.51
VHS1Q03785 YLR281CYLR281C 468 nt11.89□□□□□ -0.51
VHS1Q03785 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt11.88□□□□□ -0.51
VHS1Q03785 CAC2YML102W 1407 nt11.87□□□□□ -0.51
VHS1Q03785 EMI2YDR516C 1503 nt11.87□□□□□ -0.51
VHS1Q03785 YJL152WYJL152W 360 nt11.87□□□□□ -0.51
VHS1Q03785 WHI5YOR083W 888 nt11.86□□□□□ -0.51
VHS1Q03785 ART5YGR068C 1761 nt11.85□□□□□ -0.51
VHS1Q03785 YMR090WYMR090W 684 nt11.85□□□□□ -0.51
VHS1Q03785 PAC11YDR488C 1602 nt11.82□□□□□ -0.52
VHS1Q03785 BDF1YLR399C 2061 nt11.82□□□□□ -0.52
VHS1Q03785 MOT3YMR070W 1473 nt11.81□□□□□ -0.52
VHS1Q03785 TIR4YOR009W 1464 nt11.79□□□□□ -0.52
VHS1Q03785 PET9YBL030C 957 nt11.78□□□□□ -0.52
VHS1Q03785 YDL221WYDL221W 552 nt11.77□□□□□ -0.53
VHS1Q03785 GFD2YCL036W 1701 nt11.77□□□□□ -0.53
VHS1Q03785 YCH1YGR203W 447 nt11.76□□□□□ -0.53
VHS1Q03785 YMR057CYMR057C 372 nt11.73□□□□□ -0.53
VHS1Q03785 NVJ2YPR091C 2313 nt11.7□□□□□ -0.54
VHS1Q03785 RTS2YOR077W 699 nt11.69□□□□□ -0.54
VHS1Q03785 IRC15YPL017C 1500 nt11.67□□□□□ -0.54
VHS1Q03785 TAT1YBR069C 1860 nt11.66□□□□□ -0.54
VHS1Q03785 SDH1YKL148C 1923 nt11.62□□□□□ -0.55
VHS1Q03785 YBR220CYBR220C 1683 nt11.62□□□□□ -0.55
VHS1Q03785 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.62□□□□□ -0.55
VHS1Q03785 GIS3YLR094C 1509 nt11.61□□□□□ -0.55
VHS1Q03785 DSK2YMR276W 1122 nt11.6□□□□□ -0.55
VHS1Q03785 YPR011CYPR011C 981 nt11.6□□□□□ -0.55
VHS1Q03785 IMP2'YIL154C 1041 nt11.59□□□□□ -0.55
VHS1Q03785 IDH1YNL037C 1083 nt11.59□□□□□ -0.55
VHS1Q03785 SCC4YER147C 1875 nt11.57□□□□□ -0.56
VHS1Q03785 FMP45YDL222C 930 nt11.57□□□□□ -0.56
VHS1Q03785 CUE1YMR264W 612 nt11.54□□□□□ -0.56
VHS1Q03785 MRPL8YJL063C 717 nt11.52□□□□□ -0.57
VHS1Q03785 YLR236CYLR236C 324 nt11.52□□□□□ -0.57
VHS1Q03785 GBP2YCL011C 1284 nt11.52□□□□□ -0.57
VHS1Q03785 FPS1YLL043W 2010 nt11.5□□□□□ -0.57
VHS1Q03785 YIL100WYIL100W 354 nt11.47□□□□□ -0.57
VHS1Q03785 YDR433WYDR433W 441 nt11.45□□□□□ -0.58
VHS1Q03785 TCD2YKL027W 1344 nt11.38□□□□□ -0.59
VHS1Q03785 YNL195CYNL195C 786 nt11.35□□□□□ -0.59
VHS1Q03785 LPX1YOR084W 1164 nt11.35□□□□□ -0.59
VHS1Q03785 MXR2YCL033C 507 nt11.33□□□□□ -0.6
VHS1Q03785 ADO1YJR105W 1023 nt11.31□□□□□ -0.6
VHS1Q03785 ERV46YAL042W 1248 nt11.31□□□□□ -0.6
VHS1Q03785 RRD1YIL153W 1182 nt11.3□□□□□ -0.6
VHS1Q03785 YSC84YHR016C 1407 nt11.29□□□□□ -0.6
VHS1Q03785 YKR040CYKR040C 504 nt11.29□□□□□ -0.6
VHS1Q03785 RRT12YCR045C 1476 nt11.27□□□□□ -0.6
VHS1Q03785 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.27□□□□□ -0.61
VHS1Q03785 YEL076CYEL076C 651 nt11.27□□□□□ -0.61
VHS1Q03785 YLR464WYLR464W 651 nt11.27□□□□□ -0.61
VHS1Q03785 DED1YOR204W 1815 nt11.25□□□□□ -0.61
VHS1Q03785 SPP1YPL138C 1062 nt11.25□□□□□ -0.61
VHS1Q03785 SEC11YIR022W 504 nt11.23□□□□□ -0.61
VHS1Q03785 RTG1YOL067C 534 nt11.23□□□□□ -0.61
VHS1Q03785 UBX6YJL048C 1191 nt11.2□□□□□ -0.62
VHS1Q03785 YHL050CYHL050C 2094 nt11.2□□□□□ -0.62
VHS1Q03785 YCL042WYCL042W 360 nt11.18□□□□□ -0.62
VHS1Q03785 FMP52YER004W 696 nt11.17□□□□□ -0.62
VHS1Q03785 FMT1YBL013W 1206 nt11.17□□□□□ -0.62
VHS1Q03785 PCH2YBR186W 1695 nt11.15□□□□□ -0.62
VHS1Q03785 CWP1YKL096W 720 nt11.15□□□□□ -0.62
VHS1Q03785 FRD1YEL047C 1413 nt11.09□□□□□ -0.63
VHS1Q03785 ADH2YMR303C 1047 nt11.09□□□□□ -0.63
VHS1Q03785 PCM1YEL058W 1674 nt11.08□□□□□ -0.64
VHS1Q03785 GUT2YIL155C 1950 nt11.07□□□□□ -0.64
VHS1Q03785 SOR2YDL246C 1074 nt11.06□□□□□ -0.64
VHS1Q03785 SOR1YJR159W 1074 nt11.06□□□□□ -0.64
VHS1Q03785 SNF6YHL025W 999 nt11.04□□□□□ -0.64
VHS1Q03785 YJL225CYJL225C 5277 nt11.04□□□□□ -0.64
VHS1Q03785 HUA1YGR268C 597 nt10.98□□□□□ -0.65
VHS1Q03785 SIM1YIL123W 1431 nt10.97□□□□□ -0.65
VHS1Q03785 PTH1YHR189W 573 nt10.96□□□□□ -0.65
VHS1Q03785 YDR094WYDR094W 336 nt10.95□□□□□ -0.66
VHS1Q03785 RTF1YGL244W 1677 nt10.93□□□□□ -0.66
VHS1Q03785 BOP3YNL042W 1191 nt10.93□□□□□ -0.66
VHS1Q03785 LCB1YMR296C 1677 nt10.92□□□□□ -0.66
VHS1Q03785 YLR235CYLR235C 399 nt10.89□□□□□ -0.67
VHS1Q03785 BIO4YNR057C 714 nt10.88□□□□□ -0.67
VHS1Q03785 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.87□□□□□ -0.67
VHS1Q03785 RNQ1YCL028W 1218 nt10.87□□□□□ -0.67
VHS1Q03785 YIH1YCR059C 777 nt10.86□□□□□ -0.67
VHS1Q03785 DIC1YLR348C 897 nt10.86□□□□□ -0.67
VHS1Q03785 PIB2YGL023C 1908 nt10.85□□□□□ -0.67
VHS1Q03785 NCP1YHR042W 2076 nt10.84□□□□□ -0.67
VHS1Q03785 YLL053CYLL053C 459 nt10.83□□□□□ -0.68
VHS1Q03785 UME6YDR207C 2511 nt10.83□□□□□ -0.68
VHS1Q03785 YKL030WYKL030W 606 nt10.82□□□□□ -0.68
VHS1Q03785 TIM23YNR017W 669 nt10.78□□□□□ -0.68
VHS1Q03785 YLR179CYLR179C 606 nt10.75□□□□□ -0.69
VHS1Q03785 ERF2YLR246W 1080 nt10.73□□□□□ -0.69
VHS1Q03785 PTK1YKL198C 1989 nt10.72□□□□□ -0.69
VHS1Q03785 FTR1YER145C 1215 nt10.72□□□□□ -0.69
VHS1Q03785 RDN37-1RDN37-1 5354 nt10.7□□□□□ -0.7
VHS1Q03785 RDN37-2RDN37-2 5354 nt10.7□□□□□ -0.7
VHS1Q03785 GAL1YBR020W 1587 nt10.69□□□□□ -0.7
VHS1Q03785 TRM5YHR070W 1500 nt10.69□□□□□ -0.7
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