Protein–RNA interactions for Protein: Q03406

SLD5, DNA replication complex GINS protein SLD5, yeastyeast

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Length 294 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLD5Q03406 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.69□□□□□ -0.22
SLD5Q03406 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.69□□□□□ -0.22
SLD5Q03406 MRPL8YJL063C 717 nt13.66□□□□□ -0.22
SLD5Q03406 ALF1YNL148C 765 nt13.66□□□□□ -0.22
SLD5Q03406 YPS1YLR120C 1710 nt13.57□□□□□ -0.24
SLD5Q03406 YDR095CYDR095C 411 nt13.56□□□□□ -0.24
SLD5Q03406 YJL152WYJL152W 360 nt13.56□□□□□ -0.24
SLD5Q03406 LPX1YOR084W 1164 nt13.55□□□□□ -0.24
SLD5Q03406 ERV46YAL042W 1248 nt13.54□□□□□ -0.24
SLD5Q03406 SIS1YNL007C 1059 nt13.5□□□□□ -0.25
SLD5Q03406 IDH1YNL037C 1083 nt13.48□□□□□ -0.25
SLD5Q03406 SPP1YPL138C 1062 nt13.48□□□□□ -0.25
SLD5Q03406 ADO1YJR105W 1023 nt13.44□□□□□ -0.26
SLD5Q03406 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.41□□□□□ -0.26
SLD5Q03406 YEL076CYEL076C 651 nt13.41□□□□□ -0.26
SLD5Q03406 YLR464WYLR464W 651 nt13.41□□□□□ -0.26
SLD5Q03406 TIR4YOR009W 1464 nt13.4□□□□□ -0.26
SLD5Q03406 YDR433WYDR433W 441 nt13.39□□□□□ -0.27
SLD5Q03406 YKR040CYKR040C 504 nt13.39□□□□□ -0.27
SLD5Q03406 RTG1YOL067C 534 nt13.39□□□□□ -0.27
SLD5Q03406 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.37□□□□□ -0.27
SLD5Q03406 GBP2YCL011C 1284 nt13.32□□□□□ -0.28
SLD5Q03406 RPP2AYOL039W 321 nt13.3□□□□□ -0.28
SLD5Q03406 UBX6YJL048C 1191 nt13.29□□□□□ -0.28
SLD5Q03406 MXR2YCL033C 507 nt13.27□□□□□ -0.29
SLD5Q03406 CAC2YML102W 1407 nt13.24□□□□□ -0.29
SLD5Q03406 PTP1YDL230W 1008 nt13.24□□□□□ -0.29
SLD5Q03406 ART5YGR068C 1761 nt13.23□□□□□ -0.29
SLD5Q03406 PET9YBL030C 957 nt13.21□□□□□ -0.29
SLD5Q03406 YMR057CYMR057C 372 nt13.2□□□□□ -0.3
SLD5Q03406 SPT5YML010W 3192 nt13.15□□□□□ -0.3
SLD5Q03406 MEP2YNL142W 1500 nt13.15□□□□□ -0.3
SLD5Q03406 GFD2YCL036W 1701 nt13.14□□□□□ -0.31
SLD5Q03406 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.14□□□□□ -0.31
SLD5Q03406 TCD2YKL027W 1344 nt13.11□□□□□ -0.31
SLD5Q03406 HUA1YGR268C 597 nt13.09□□□□□ -0.31
SLD5Q03406 DED1YOR204W 1815 nt13.04□□□□□ -0.32
SLD5Q03406 FRD1YEL047C 1413 nt13.03□□□□□ -0.32
SLD5Q03406 YDR094WYDR094W 336 nt13.02□□□□□ -0.33
SLD5Q03406 RRD1YIL153W 1182 nt13□□□□□ -0.33
SLD5Q03406 FPS1YLL043W 2010 nt12.98□□□□□ -0.33
SLD5Q03406 DCW1YKL046C 1350 nt12.96□□□□□ -0.33
SLD5Q03406 FMT1YBL013W 1206 nt12.9□□□□□ -0.34
SLD5Q03406 RTS2YOR077W 699 nt12.9□□□□□ -0.34
SLD5Q03406 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.89□□□□□ -0.35
SLD5Q03406 PTH1YHR189W 573 nt12.88□□□□□ -0.35
SLD5Q03406 SOR2YDL246C 1074 nt12.87□□□□□ -0.35
SLD5Q03406 SOR1YJR159W 1074 nt12.87□□□□□ -0.35
SLD5Q03406 YKL030WYKL030W 606 nt12.86□□□□□ -0.35
SLD5Q03406 YCL042WYCL042W 360 nt12.85□□□□□ -0.35
SLD5Q03406 IRC15YPL017C 1500 nt12.84□□□□□ -0.35
SLD5Q03406 YLR235CYLR235C 399 nt12.84□□□□□ -0.35
SLD5Q03406 EMI2YDR516C 1503 nt12.82□□□□□ -0.36
SLD5Q03406 CUE1YMR264W 612 nt12.81□□□□□ -0.36
SLD5Q03406 YDL221WYDL221W 552 nt12.77□□□□□ -0.37
SLD5Q03406 LCB1YMR296C 1677 nt12.77□□□□□ -0.37
SLD5Q03406 SSA4YER103W 1929 nt12.76□□□□□ -0.37
SLD5Q03406 FMP52YER004W 696 nt12.73□□□□□ -0.37
SLD5Q03406 GIS3YLR094C 1509 nt12.72□□□□□ -0.37
SLD5Q03406 CWP1YKL096W 720 nt12.67□□□□□ -0.38
SLD5Q03406 YMR090WYMR090W 684 nt12.66□□□□□ -0.38
SLD5Q03406 ADH2YMR303C 1047 nt12.65□□□□□ -0.38
SLD5Q03406 YIL100WYIL100W 354 nt12.61□□□□□ -0.39
SLD5Q03406 TIM23YNR017W 669 nt12.59□□□□□ -0.39
SLD5Q03406 YFR018CYFR018C 1092 nt12.58□□□□□ -0.4
SLD5Q03406 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.56□□□□□ -0.4
SLD5Q03406 PAU16YKL224C 372 nt12.56□□□□□ -0.4
SLD5Q03406 DIC1YLR348C 897 nt12.54□□□□□ -0.4
SLD5Q03406 SCC4YER147C 1875 nt12.52□□□□□ -0.41
SLD5Q03406 PCM1YEL058W 1674 nt12.51□□□□□ -0.41
SLD5Q03406 SDH1YKL148C 1923 nt12.51□□□□□ -0.41
SLD5Q03406 PRE6YOL038W 765 nt12.49□□□□□ -0.41
SLD5Q03406 SBA1YKL117W 651 nt12.48□□□□□ -0.41
SLD5Q03406 YLR179CYLR179C 606 nt12.48□□□□□ -0.41
SLD5Q03406 RRT5YFR032C 870 nt12.47□□□□□ -0.41
SLD5Q03406 SNF6YHL025W 999 nt12.47□□□□□ -0.41
SLD5Q03406 YPR064WYPR064W 420 nt12.45□□□□□ -0.42
SLD5Q03406 RNQ1YCL028W 1218 nt12.45□□□□□ -0.42
SLD5Q03406 YBR220CYBR220C 1683 nt12.43□□□□□ -0.42
SLD5Q03406 YIH1YCR059C 777 nt12.42□□□□□ -0.42
SLD5Q03406 TAD3YLR316C 969 nt12.41□□□□□ -0.42
SLD5Q03406 WSC2YNL283C 1512 nt12.41□□□□□ -0.42
SLD5Q03406 AHT1YHR093W 549 nt12.39□□□□□ -0.43
SLD5Q03406 YFL066CYFL066C 1179 nt12.29□□□□□ -0.44
SLD5Q03406 YLL053CYLL053C 459 nt12.27□□□□□ -0.45
SLD5Q03406 YNL195CYNL195C 786 nt12.27□□□□□ -0.45
SLD5Q03406 BDF1YLR399C 2061 nt12.26□□□□□ -0.45
SLD5Q03406 PEX25YPL112C 1185 nt12.25□□□□□ -0.45
SLD5Q03406 RRT12YCR045C 1476 nt12.23□□□□□ -0.45
SLD5Q03406 AQY1YPR192W 918 nt12.23□□□□□ -0.45
SLD5Q03406 YSP3YOR003W 1437 nt12.22□□□□□ -0.45
SLD5Q03406 FTR1YER145C 1215 nt12.22□□□□□ -0.45
SLD5Q03406 BDH1YAL060W 1149 nt12.22□□□□□ -0.45
SLD5Q03406 BIO4YNR057C 714 nt12.22□□□□□ -0.45
SLD5Q03406 YSC84YHR016C 1407 nt12.2□□□□□ -0.46
SLD5Q03406 GAL1YBR020W 1587 nt12.18□□□□□ -0.46
SLD5Q03406 SIM1YIL123W 1431 nt12.15□□□□□ -0.46
SLD5Q03406 YNL115CYNL115C 1935 nt12.15□□□□□ -0.46
SLD5Q03406 NAT4YMR069W 858 nt12.14□□□□□ -0.47
SLD5Q03406 TRM5YHR070W 1500 nt12.12□□□□□ -0.47
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