Protein–RNA interactions for Protein: Q03219

YMR178W, Uncharacterized protein YMR178W, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR178WQ03219 SIS1YNL007C 1059 nt12.22□□□□□ -0.45
YMR178WQ03219 DSK2YMR276W 1122 nt12.2□□□□□ -0.46
YMR178WQ03219 SPT5YML010W 3192 nt12.15□□□□□ -0.46
YMR178WQ03219 YJL152WYJL152W 360 nt12.14□□□□□ -0.47
YMR178WQ03219 RPP2AYOL039W 321 nt12.12□□□□□ -0.47
YMR178WQ03219 MOT3YMR070W 1473 nt12.12□□□□□ -0.47
YMR178WQ03219 MEP2YNL142W 1500 nt12.11□□□□□ -0.47
YMR178WQ03219 YPR011CYPR011C 981 nt12.1□□□□□ -0.47
YMR178WQ03219 FMP45YDL222C 930 nt12.09□□□□□ -0.47
YMR178WQ03219 YLR236CYLR236C 324 nt12.08□□□□□ -0.48
YMR178WQ03219 YCH1YGR203W 447 nt12.02□□□□□ -0.49
YMR178WQ03219 TIR4YOR009W 1464 nt12.02□□□□□ -0.49
YMR178WQ03219 PTP1YDL230W 1008 nt12.01□□□□□ -0.49
YMR178WQ03219 IDH1YNL037C 1083 nt12.01□□□□□ -0.49
YMR178WQ03219 PET9YBL030C 957 nt11.97□□□□□ -0.49
YMR178WQ03219 ART5YGR068C 1761 nt11.97□□□□□ -0.49
YMR178WQ03219 ERV46YAL042W 1248 nt11.92□□□□□ -0.5
YMR178WQ03219 CAC2YML102W 1407 nt11.91□□□□□ -0.5
YMR178WQ03219 GFD2YCL036W 1701 nt11.89□□□□□ -0.51
YMR178WQ03219 DCW1YKL046C 1350 nt11.89□□□□□ -0.51
YMR178WQ03219 YMR057CYMR057C 372 nt11.88□□□□□ -0.51
YMR178WQ03219 LPX1YOR084W 1164 nt11.88□□□□□ -0.51
YMR178WQ03219 GBP2YCL011C 1284 nt11.87□□□□□ -0.51
YMR178WQ03219 YDR433WYDR433W 441 nt11.86□□□□□ -0.51
YMR178WQ03219 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt11.84□□□□□ -0.51
YMR178WQ03219 YKR040CYKR040C 504 nt11.82□□□□□ -0.52
YMR178WQ03219 EMI2YDR516C 1503 nt11.79□□□□□ -0.52
YMR178WQ03219 MRPL8YJL063C 717 nt11.77□□□□□ -0.53
YMR178WQ03219 YMR090WYMR090W 684 nt11.75□□□□□ -0.53
YMR178WQ03219 YDL221WYDL221W 552 nt11.73□□□□□ -0.53
YMR178WQ03219 TCD2YKL027W 1344 nt11.73□□□□□ -0.53
YMR178WQ03219 MXR2YCL033C 507 nt11.71□□□□□ -0.53
YMR178WQ03219 SPP1YPL138C 1062 nt11.7□□□□□ -0.54
YMR178WQ03219 FPS1YLL043W 2010 nt11.69□□□□□ -0.54
YMR178WQ03219 RTS2YOR077W 699 nt11.69□□□□□ -0.54
YMR178WQ03219 IRC15YPL017C 1500 nt11.69□□□□□ -0.54
YMR178WQ03219 CUE1YMR264W 612 nt11.64□□□□□ -0.55
YMR178WQ03219 ADO1YJR105W 1023 nt11.63□□□□□ -0.55
YMR178WQ03219 GIS3YLR094C 1509 nt11.6□□□□□ -0.55
YMR178WQ03219 DED1YOR204W 1815 nt11.6□□□□□ -0.55
YMR178WQ03219 SSA4YER103W 1929 nt11.6□□□□□ -0.55
YMR178WQ03219 RRD1YIL153W 1182 nt11.6□□□□□ -0.55
YMR178WQ03219 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt11.59□□□□□ -0.55
YMR178WQ03219 YEL076CYEL076C 651 nt11.59□□□□□ -0.55
YMR178WQ03219 YLR464WYLR464W 651 nt11.59□□□□□ -0.55
YMR178WQ03219 RTG1YOL067C 534 nt11.58□□□□□ -0.56
YMR178WQ03219 SDH1YKL148C 1923 nt11.54□□□□□ -0.56
YMR178WQ03219 FRD1YEL047C 1413 nt11.53□□□□□ -0.56
YMR178WQ03219 Q0182Q0182 405 nt11.52□□□□□ -0.57
YMR178WQ03219 YIL100WYIL100W 354 nt11.52□□□□□ -0.57
YMR178WQ03219 SCC4YER147C 1875 nt11.51□□□□□ -0.57
YMR178WQ03219 YCL042WYCL042W 360 nt11.51□□□□□ -0.57
YMR178WQ03219 YBR220CYBR220C 1683 nt11.49□□□□□ -0.57
YMR178WQ03219 FMP52YER004W 696 nt11.48□□□□□ -0.57
YMR178WQ03219 SOR2YDL246C 1074 nt11.47□□□□□ -0.57
YMR178WQ03219 SOR1YJR159W 1074 nt11.47□□□□□ -0.57
YMR178WQ03219 FMT1YBL013W 1206 nt11.47□□□□□ -0.57
YMR178WQ03219 HUA1YGR268C 597 nt11.42□□□□□ -0.58
YMR178WQ03219 YLR235CYLR235C 399 nt11.39□□□□□ -0.59
YMR178WQ03219 CWP1YKL096W 720 nt11.36□□□□□ -0.59
YMR178WQ03219 PTH1YHR189W 573 nt11.35□□□□□ -0.59
YMR178WQ03219 YKL030WYKL030W 606 nt11.34□□□□□ -0.59
YMR178WQ03219 YNL195CYNL195C 786 nt11.32□□□□□ -0.6
YMR178WQ03219 ADH2YMR303C 1047 nt11.31□□□□□ -0.6
YMR178WQ03219 PCM1YEL058W 1674 nt11.27□□□□□ -0.6
YMR178WQ03219 UBX6YJL048C 1191 nt11.26□□□□□ -0.61
YMR178WQ03219 LCB1YMR296C 1677 nt11.25□□□□□ -0.61
YMR178WQ03219 SNF6YHL025W 999 nt11.25□□□□□ -0.61
YMR178WQ03219 YDR094WYDR094W 336 nt11.2□□□□□ -0.62
YMR178WQ03219 DIC1YLR348C 897 nt11.19□□□□□ -0.62
YMR178WQ03219 RRT12YCR045C 1476 nt11.19□□□□□ -0.62
YMR178WQ03219 TIM23YNR017W 669 nt11.18□□□□□ -0.62
YMR178WQ03219 RNQ1YCL028W 1218 nt11.17□□□□□ -0.62
YMR178WQ03219 YSC84YHR016C 1407 nt11.17□□□□□ -0.62
YMR178WQ03219 YIH1YCR059C 777 nt11.15□□□□□ -0.62
YMR178WQ03219 YHL050CYHL050C 2094 nt11.12□□□□□ -0.63
YMR178WQ03219 BDF1YLR399C 2061 nt11.12□□□□□ -0.63
YMR178WQ03219 YLR179CYLR179C 606 nt11.11□□□□□ -0.63
YMR178WQ03219 SEC11YIR022W 504 nt11.1□□□□□ -0.63
YMR178WQ03219 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.07□□□□□ -0.64
YMR178WQ03219 YPR064WYPR064W 420 nt11.07□□□□□ -0.64
YMR178WQ03219 SIM1YIL123W 1431 nt11.04□□□□□ -0.64
YMR178WQ03219 YLL053CYLL053C 459 nt11.03□□□□□ -0.64
YMR178WQ03219 BIO4YNR057C 714 nt11.03□□□□□ -0.64
YMR178WQ03219 AHT1YHR093W 549 nt11.01□□□□□ -0.65
YMR178WQ03219 TAD3YLR316C 969 nt11□□□□□ -0.65
YMR178WQ03219 AQY1YPR192W 918 nt11□□□□□ -0.65
YMR178WQ03219 TAT1YBR069C 1860 nt10.99□□□□□ -0.65
YMR178WQ03219 WSC2YNL283C 1512 nt10.99□□□□□ -0.65
YMR178WQ03219 FTR1YER145C 1215 nt10.98□□□□□ -0.65
YMR178WQ03219 YFR018CYFR018C 1092 nt10.96□□□□□ -0.65
YMR178WQ03219 PCH2YBR186W 1695 nt10.95□□□□□ -0.66
YMR178WQ03219 GAL1YBR020W 1587 nt10.94□□□□□ -0.66
YMR178WQ03219 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt10.91□□□□□ -0.66
YMR178WQ03219 TRM5YHR070W 1500 nt10.89□□□□□ -0.67
YMR178WQ03219 RRT5YFR032C 870 nt10.88□□□□□ -0.67
YMR178WQ03219 ERF2YLR246W 1080 nt10.88□□□□□ -0.67
YMR178WQ03219 YFL067WYFL067W 528 nt10.86□□□□□ -0.67
YMR178WQ03219 GUT2YIL155C 1950 nt10.86□□□□□ -0.67
YMR178WQ03219 SPC25YER018C 666 nt10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 43.6 ms