Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defb1P56386 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb1P56386 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb1P56386 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb1P56386 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb1P56386 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb1P56386 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb1P56386 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb1P56386 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb1P56386 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb1P56386 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defb1P56386 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defb1P56386 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb1P56386 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defb1P56386 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defb1P56386 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Defb1P56386 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defb1P56386 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defb1P56386 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defb1P56386 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
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