Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Defb1P56386 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Defb1P56386 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb1P56386 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Defb1P56386 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb1P56386 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Defb1P56386 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Defb1P56386 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Defb1P56386 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb1P56386 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Defb1P56386 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Defb1P56386 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Defb1P56386 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Defb1P56386 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Defb1P56386 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defb1P56386 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Defb1P56386 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Defb1P56386 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defb1P56386 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Defb1P56386 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.43□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.43□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.42□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Defb1P56386 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Defb1P56386 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
Defb1P56386 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Defb1P56386 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Defb1P56386 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Defb1P56386 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Defb1P56386 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defb1P56386 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Defb1P56386 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms