Protein–RNA interactions for Protein: P49573

CTR1, Copper transport protein CTR1, yeastyeast

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CTR1P49573 ALF1YNL148C 765 nt13.64□□□□□ -0.23
CTR1P49573 YCH1YGR203W 447 nt13.63□□□□□ -0.23
CTR1P49573 SPT5YML010W 3192 nt13.61□□□□□ -0.23
CTR1P49573 SUF2tP(AGG)C 72 nt13.59□□□□□ -0.23
CTR1P49573 SUF10tP(AGG)N 72 nt13.59□□□□□ -0.23
CTR1P49573 SIS1YNL007C 1059 nt13.56□□□□□ -0.24
CTR1P49573 LPX1YOR084W 1164 nt13.56□□□□□ -0.24
CTR1P49573 YJL152WYJL152W 360 nt13.55□□□□□ -0.24
CTR1P49573 TIR4YOR009W 1464 nt13.55□□□□□ -0.24
CTR1P49573 IMP2'YIL154C 1041 nt13.53□□□□□ -0.24
CTR1P49573 SPP1YPL138C 1062 nt13.52□□□□□ -0.25
CTR1P49573 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt13.48□□□□□ -0.25
CTR1P49573 PTP1YDL230W 1008 nt13.46□□□□□ -0.25
CTR1P49573 ERV46YAL042W 1248 nt13.45□□□□□ -0.26
CTR1P49573 ART5YGR068C 1761 nt13.4□□□□□ -0.26
CTR1P49573 RPP2AYOL039W 321 nt13.38□□□□□ -0.27
CTR1P49573 MEP2YNL142W 1500 nt13.38□□□□□ -0.27
CTR1P49573 IDH1YNL037C 1083 nt13.37□□□□□ -0.27
CTR1P49573 MXR2YCL033C 507 nt13.36□□□□□ -0.27
CTR1P49573 YDR433WYDR433W 441 nt13.34□□□□□ -0.27
CTR1P49573 GFD2YCL036W 1701 nt13.32□□□□□ -0.28
CTR1P49573 YMR057CYMR057C 372 nt13.31□□□□□ -0.28
CTR1P49573 CAC2YML102W 1407 nt13.3□□□□□ -0.28
CTR1P49573 DCW1YKL046C 1350 nt13.3□□□□□ -0.28
CTR1P49573 MRPL8YJL063C 717 nt13.29□□□□□ -0.28
CTR1P49573 RTG1YOL067C 534 nt13.29□□□□□ -0.28
CTR1P49573 GBP2YCL011C 1284 nt13.28□□□□□ -0.28
CTR1P49573 YKR040CYKR040C 504 nt13.26□□□□□ -0.29
CTR1P49573 PET9YBL030C 957 nt13.23□□□□□ -0.29
CTR1P49573 SSA4YER103W 1929 nt13.21□□□□□ -0.3
CTR1P49573 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt13.2□□□□□ -0.3
CTR1P49573 YEL076CYEL076C 651 nt13.2□□□□□ -0.3
CTR1P49573 YLR464WYLR464W 651 nt13.2□□□□□ -0.3
CTR1P49573 DED1YOR204W 1815 nt13.17□□□□□ -0.3
CTR1P49573 FPS1YLL043W 2010 nt13.15□□□□□ -0.3
CTR1P49573 RTS2YOR077W 699 nt13.14□□□□□ -0.31
CTR1P49573 UBX6YJL048C 1191 nt13.12□□□□□ -0.31
CTR1P49573 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt13.11□□□□□ -0.31
CTR1P49573 RRD1YIL153W 1182 nt13.1□□□□□ -0.31
CTR1P49573 IRC15YPL017C 1500 nt13.08□□□□□ -0.31
CTR1P49573 ADO1YJR105W 1023 nt13.07□□□□□ -0.32
CTR1P49573 FRD1YEL047C 1413 nt13.06□□□□□ -0.32
CTR1P49573 TCD2YKL027W 1344 nt13.05□□□□□ -0.32
CTR1P49573 EMI2YDR516C 1503 nt13.03□□□□□ -0.32
CTR1P49573 FMT1YBL013W 1206 nt13.02□□□□□ -0.33
CTR1P49573 YDL221WYDL221W 552 nt12.97□□□□□ -0.33
CTR1P49573 GIS3YLR094C 1509 nt12.95□□□□□ -0.34
CTR1P49573 PTH1YHR189W 573 nt12.92□□□□□ -0.34
CTR1P49573 CUE1YMR264W 612 nt12.91□□□□□ -0.34
CTR1P49573 SOR2YDL246C 1074 nt12.86□□□□□ -0.35
CTR1P49573 SOR1YJR159W 1074 nt12.86□□□□□ -0.35
CTR1P49573 HUA1YGR268C 597 nt12.84□□□□□ -0.35
CTR1P49573 YCL042WYCL042W 360 nt12.77□□□□□ -0.37
CTR1P49573 YDR094WYDR094W 336 nt12.76□□□□□ -0.37
CTR1P49573 SDH1YKL148C 1923 nt12.76□□□□□ -0.37
CTR1P49573 ADH2YMR303C 1047 nt12.75□□□□□ -0.37
CTR1P49573 LCB1YMR296C 1677 nt12.74□□□□□ -0.37
CTR1P49573 BDF1YLR399C 2061 nt12.73□□□□□ -0.37
CTR1P49573 CWP1YKL096W 720 nt12.73□□□□□ -0.37
CTR1P49573 SCC4YER147C 1875 nt12.72□□□□□ -0.37
CTR1P49573 YKL030WYKL030W 606 nt12.72□□□□□ -0.37
CTR1P49573 YBR220CYBR220C 1683 nt12.72□□□□□ -0.37
CTR1P49573 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.71□□□□□ -0.37
CTR1P49573 YMR090WYMR090W 684 nt12.7□□□□□ -0.38
CTR1P49573 YLR235CYLR235C 399 nt12.68□□□□□ -0.38
CTR1P49573 FMP52YER004W 696 nt12.67□□□□□ -0.38
CTR1P49573 YIL100WYIL100W 354 nt12.65□□□□□ -0.38
CTR1P49573 PCM1YEL058W 1674 nt12.6□□□□□ -0.39
CTR1P49573 DIC1YLR348C 897 nt12.57□□□□□ -0.4
CTR1P49573 TAT1YBR069C 1860 nt12.54□□□□□ -0.4
CTR1P49573 TIM23YNR017W 669 nt12.53□□□□□ -0.4
CTR1P49573 PRE6YOL038W 765 nt12.51□□□□□ -0.41
CTR1P49573 RRT12YCR045C 1476 nt12.51□□□□□ -0.41
CTR1P49573 SNF6YHL025W 999 nt12.5□□□□□ -0.41
CTR1P49573 WSC2YNL283C 1512 nt12.46□□□□□ -0.42
CTR1P49573 YIH1YCR059C 777 nt12.45□□□□□ -0.42
CTR1P49573 PAU16YKL224C 372 nt12.45□□□□□ -0.42
CTR1P49573 YLR179CYLR179C 606 nt12.44□□□□□ -0.42
CTR1P49573 RNQ1YCL028W 1218 nt12.44□□□□□ -0.42
CTR1P49573 YHL050CYHL050C 2094 nt12.43□□□□□ -0.42
CTR1P49573 YFR018CYFR018C 1092 nt12.41□□□□□ -0.42
CTR1P49573 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt12.41□□□□□ -0.42
CTR1P49573 YSC84YHR016C 1407 nt12.4□□□□□ -0.42
CTR1P49573 AHT1YHR093W 549 nt12.36□□□□□ -0.43
CTR1P49573 BIO4YNR057C 714 nt12.35□□□□□ -0.43
CTR1P49573 SBA1YKL117W 651 nt12.34□□□□□ -0.43
CTR1P49573 YLL053CYLL053C 459 nt12.34□□□□□ -0.43
CTR1P49573 YPR064WYPR064W 420 nt12.32□□□□□ -0.44
CTR1P49573 TAD3YLR316C 969 nt12.31□□□□□ -0.44
CTR1P49573 YFL066CYFL066C 1179 nt12.3□□□□□ -0.44
CTR1P49573 YNL195CYNL195C 786 nt12.3□□□□□ -0.44
CTR1P49573 FTR1YER145C 1215 nt12.25□□□□□ -0.45
CTR1P49573 SIM1YIL123W 1431 nt12.25□□□□□ -0.45
CTR1P49573 GAL1YBR020W 1587 nt12.25□□□□□ -0.45
CTR1P49573 RRT5YFR032C 870 nt12.22□□□□□ -0.45
CTR1P49573 BDH1YAL060W 1149 nt12.22□□□□□ -0.45
CTR1P49573 TRM5YHR070W 1500 nt12.21□□□□□ -0.46
CTR1P49573 Q0182Q0182 405 nt12.19□□□□□ -0.46
CTR1P49573 YSP3YOR003W 1437 nt12.19□□□□□ -0.46
CTR1P49573 PCH2YBR186W 1695 nt12.18□□□□□ -0.46
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