Protein–RNA interactions for Protein: P47024

TY4B-J, Transposon Ty4-J Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,803 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY4B-JP47024 YCH1YGR203W 447 nt16.36■□□□□ 0.21
TY4B-JP47024 CCT6YDR188W 1641 nt16.34■□□□□ 0.21
TY4B-JP47024 MRPL8YJL063C 717 nt16.32■□□□□ 0.2
TY4B-JP47024 SPP1YPL138C 1062 nt16.32■□□□□ 0.2
TY4B-JP47024 ERV46YAL042W 1248 nt16.31■□□□□ 0.2
TY4B-JP47024 YJL152WYJL152W 360 nt16.22■□□□□ 0.19
TY4B-JP47024 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt16.2■□□□□ 0.18
TY4B-JP47024 YEL076CYEL076C 651 nt16.2■□□□□ 0.18
TY4B-JP47024 YLR464WYLR464W 651 nt16.2■□□□□ 0.18
TY4B-JP47024 UBX6YJL048C 1191 nt16.17■□□□□ 0.18
TY4B-JP47024 ADO1YJR105W 1023 nt16.13■□□□□ 0.17
TY4B-JP47024 YDR095CYDR095C 411 nt16.1■□□□□ 0.17
TY4B-JP47024 SUF2tP(AGG)C 72 nt16.1■□□□□ 0.17
TY4B-JP47024 SUF10tP(AGG)N 72 nt16.1■□□□□ 0.17
TY4B-JP47024 MXR2YCL033C 507 nt16.09■□□□□ 0.17
TY4B-JP47024 SIS1YNL007C 1059 nt16.08■□□□□ 0.16
TY4B-JP47024 ALF1YNL148C 765 nt16.08■□□□□ 0.16
TY4B-JP47024 IDH1YNL037C 1083 nt16.06■□□□□ 0.16
TY4B-JP47024 TIR4YOR009W 1464 nt16.06■□□□□ 0.16
TY4B-JP47024 YPS1YLR120C 1710 nt16.03■□□□□ 0.16
TY4B-JP47024 YDR433WYDR433W 441 nt15.9■□□□□ 0.14
TY4B-JP47024 GBP2YCL011C 1284 nt15.9■□□□□ 0.14
TY4B-JP47024 YDR094WYDR094W 336 nt15.87■□□□□ 0.13
TY4B-JP47024 YKR040CYKR040C 504 nt15.83■□□□□ 0.12
TY4B-JP47024 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.74■□□□□ 0.11
TY4B-JP47024 PTH1YHR189W 573 nt15.73■□□□□ 0.11
TY4B-JP47024 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.71■□□□□ 0.1
TY4B-JP47024 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.7■□□□□ 0.1
TY4B-JP47024 GFD2YCL036W 1701 nt15.7■□□□□ 0.1
TY4B-JP47024 ART5YGR068C 1761 nt15.67■□□□□ 0.1
TY4B-JP47024 CAC2YML102W 1407 nt15.63■□□□□ 0.09
TY4B-JP47024 PTP1YDL230W 1008 nt15.62■□□□□ 0.09
TY4B-JP47024 HUA1YGR268C 597 nt15.61■□□□□ 0.09
TY4B-JP47024 TCD2YKL027W 1344 nt15.6■□□□□ 0.09
TY4B-JP47024 FRD1YEL047C 1413 nt15.6■□□□□ 0.09
TY4B-JP47024 RPP2AYOL039W 321 nt15.59■□□□□ 0.09
TY4B-JP47024 YMR057CYMR057C 372 nt15.59■□□□□ 0.09
TY4B-JP47024 DED1YOR204W 1815 nt15.55■□□□□ 0.08
TY4B-JP47024 SOR2YDL246C 1074 nt15.53■□□□□ 0.08
TY4B-JP47024 SOR1YJR159W 1074 nt15.53■□□□□ 0.08
TY4B-JP47024 RTS2YOR077W 699 nt15.53■□□□□ 0.08
TY4B-JP47024 RRD1YIL153W 1182 nt15.46■□□□□ 0.07
TY4B-JP47024 PET9YBL030C 957 nt15.43■□□□□ 0.06
TY4B-JP47024 PAU16YKL224C 372 nt15.4■□□□□ 0.06
TY4B-JP47024 DCW1YKL046C 1350 nt15.39■□□□□ 0.05
TY4B-JP47024 MEP2YNL142W 1500 nt15.35■□□□□ 0.05
TY4B-JP47024 FMT1YBL013W 1206 nt15.35■□□□□ 0.05
TY4B-JP47024 PRE6YOL038W 765 nt15.35■□□□□ 0.05
TY4B-JP47024 YLR235CYLR235C 399 nt15.33■□□□□ 0.05
TY4B-JP47024 FPS1YLL043W 2010 nt15.33■□□□□ 0.05
TY4B-JP47024 SBA1YKL117W 651 nt15.31■□□□□ 0.04
TY4B-JP47024 YCL042WYCL042W 360 nt15.31■□□□□ 0.04
TY4B-JP47024 LCB1YMR296C 1677 nt15.29■□□□□ 0.04
TY4B-JP47024 YKL030WYKL030W 606 nt15.24■□□□□ 0.03
TY4B-JP47024 YFR018CYFR018C 1092 nt15.22■□□□□ 0.03
TY4B-JP47024 CUE1YMR264W 612 nt15.18■□□□□ 0.02
TY4B-JP47024 IRC15YPL017C 1500 nt15.18■□□□□ 0.02
TY4B-JP47024 TIM23YNR017W 669 nt15.15■□□□□ 0.02
TY4B-JP47024 SPT5YML010W 3192 nt15.12■□□□□ 0.01
TY4B-JP47024 EMI2YDR516C 1503 nt15.09■□□□□ 0.01
TY4B-JP47024 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt15.07■□□□□ 0
TY4B-JP47024 FMP52YER004W 696 nt15.06■□□□□ 0
TY4B-JP47024 CWP1YKL096W 720 nt15.03■□□□□ -0
TY4B-JP47024 DIC1YLR348C 897 nt15.03■□□□□ -0
TY4B-JP47024 ADH2YMR303C 1047 nt14.98□□□□□ -0.01
TY4B-JP47024 YLR179CYLR179C 606 nt14.97□□□□□ -0.01
TY4B-JP47024 YDL221WYDL221W 552 nt14.92□□□□□ -0.02
TY4B-JP47024 RRT5YFR032C 870 nt14.85□□□□□ -0.03
TY4B-JP47024 WSC2YNL283C 1512 nt14.84□□□□□ -0.03
TY4B-JP47024 YPR064WYPR064W 420 nt14.83□□□□□ -0.04
TY4B-JP47024 SNF6YHL025W 999 nt14.82□□□□□ -0.04
TY4B-JP47024 YIL100WYIL100W 354 nt14.82□□□□□ -0.04
TY4B-JP47024 GIS3YLR094C 1509 nt14.82□□□□□ -0.04
TY4B-JP47024 PEX25YPL112C 1185 nt14.8□□□□□ -0.04
TY4B-JP47024 YIH1YCR059C 777 nt14.78□□□□□ -0.04
TY4B-JP47024 YFL066CYFL066C 1179 nt14.74□□□□□ -0.05
TY4B-JP47024 SDH1YKL148C 1923 nt14.71□□□□□ -0.05
TY4B-JP47024 TAD3YLR316C 969 nt14.69□□□□□ -0.06
TY4B-JP47024 PCM1YEL058W 1674 nt14.66□□□□□ -0.06
TY4B-JP47024 SCC4YER147C 1875 nt14.65□□□□□ -0.06
TY4B-JP47024 YLL053CYLL053C 459 nt14.6□□□□□ -0.07
TY4B-JP47024 YSC84YHR016C 1407 nt14.59□□□□□ -0.07
TY4B-JP47024 AHT1YHR093W 549 nt14.59□□□□□ -0.07
TY4B-JP47024 YSP3YOR003W 1437 nt14.58□□□□□ -0.08
TY4B-JP47024 FTR1YER145C 1215 nt14.57□□□□□ -0.08
TY4B-JP47024 BIO4YNR057C 714 nt14.57□□□□□ -0.08
TY4B-JP47024 YMR090WYMR090W 684 nt14.56□□□□□ -0.08
TY4B-JP47024 RNQ1YCL028W 1218 nt14.55□□□□□ -0.08
TY4B-JP47024 YNL115CYNL115C 1935 nt14.54□□□□□ -0.08
TY4B-JP47024 MIR1YJR077C 936 nt14.52□□□□□ -0.08
TY4B-JP47024 YBR220CYBR220C 1683 nt14.5□□□□□ -0.09
TY4B-JP47024 BDH1YAL060W 1149 nt14.49□□□□□ -0.09
TY4B-JP47024 NAT4YMR069W 858 nt14.49□□□□□ -0.09
TY4B-JP47024 GLK1YCL040W 1503 nt14.47□□□□□ -0.09
TY4B-JP47024 SSA4YER103W 1929 nt14.47□□□□□ -0.09
TY4B-JP47024 MSF1YPR047W 1410 nt14.45□□□□□ -0.1
TY4B-JP47024 RRT12YCR045C 1476 nt14.45□□□□□ -0.1
TY4B-JP47024 ATF2YGR177C 1608 nt14.44□□□□□ -0.1
TY4B-JP47024 YLR415CYLR415C 339 nt14.43□□□□□ -0.1
TY4B-JP47024 AQY1YPR192W 918 nt14.43□□□□□ -0.1
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