Protein–RNA interactions for Protein: P40105

YRF1-2, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 2, yeastyeast

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Length 1,681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-2P40105 LPX1YOR084W 1164 nt16.44■□□□□ 0.22
YRF1-2P40105 DAL1YIR027C 1383 nt16.42■□□□□ 0.22
YRF1-2P40105 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt16.4■□□□□ 0.22
YRF1-2P40105 LSM3YLR438C-A 270 nt16.39■□□□□ 0.21
YRF1-2P40105 INM2YDR287W 879 nt16.33■□□□□ 0.2
YRF1-2P40105 SPP1YPL138C 1062 nt16.28■□□□□ 0.2
YRF1-2P40105 ERV46YAL042W 1248 nt16.27■□□□□ 0.19
YRF1-2P40105 FUN26YAL022C 1554 nt16.26■□□□□ 0.19
YRF1-2P40105 TRM9YML014W 840 nt16.22■□□□□ 0.19
YRF1-2P40105 YDR094WYDR094W 336 nt16.16■□□□□ 0.18
YRF1-2P40105 CCT6YDR188W 1641 nt16.11■□□□□ 0.17
YRF1-2P40105 YJL152WYJL152W 360 nt16.05■□□□□ 0.16
YRF1-2P40105 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt16.03■□□□□ 0.16
YRF1-2P40105 IDH1YNL037C 1083 nt16■□□□□ 0.15
YRF1-2P40105 ALF1YNL148C 765 nt15.99■□□□□ 0.15
YRF1-2P40105 SIS1YNL007C 1059 nt15.97■□□□□ 0.15
YRF1-2P40105 YDR095CYDR095C 411 nt15.94■□□□□ 0.14
YRF1-2P40105 SUF2tP(AGG)C 72 nt15.92■□□□□ 0.14
YRF1-2P40105 SUF10tP(AGG)N 72 nt15.92■□□□□ 0.14
YRF1-2P40105 YPS1YLR120C 1710 nt15.89■□□□□ 0.13
YRF1-2P40105 MXR2YCL033C 507 nt15.89■□□□□ 0.13
YRF1-2P40105 YDR433WYDR433W 441 nt15.85■□□□□ 0.13
YRF1-2P40105 TIR4YOR009W 1464 nt15.83■□□□□ 0.12
YRF1-2P40105 HUA1YGR268C 597 nt15.82■□□□□ 0.12
YRF1-2P40105 YKR040CYKR040C 504 nt15.75■□□□□ 0.11
YRF1-2P40105 GBP2YCL011C 1284 nt15.73■□□□□ 0.11
YRF1-2P40105 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt15.73■□□□□ 0.11
YRF1-2P40105 SBA1YKL117W 651 nt15.67■□□□□ 0.1
YRF1-2P40105 PTH1YHR189W 573 nt15.62■□□□□ 0.09
YRF1-2P40105 PAU16YKL224C 372 nt15.59■□□□□ 0.09
YRF1-2P40105 RPP2AYOL039W 321 nt15.51■□□□□ 0.07
YRF1-2P40105 ART5YGR068C 1761 nt15.5■□□□□ 0.07
YRF1-2P40105 GFD2YCL036W 1701 nt15.5■□□□□ 0.07
YRF1-2P40105 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.5■□□□□ 0.07
YRF1-2P40105 PTP1YDL230W 1008 nt15.46■□□□□ 0.07
YRF1-2P40105 TCD2YKL027W 1344 nt15.44■□□□□ 0.06
YRF1-2P40105 YMR057CYMR057C 372 nt15.44■□□□□ 0.06
YRF1-2P40105 RTS2YOR077W 699 nt15.42■□□□□ 0.06
YRF1-2P40105 FRD1YEL047C 1413 nt15.41■□□□□ 0.06
YRF1-2P40105 CAC2YML102W 1407 nt15.41■□□□□ 0.06
YRF1-2P40105 MEP2YNL142W 1500 nt15.37■□□□□ 0.05
YRF1-2P40105 PRE6YOL038W 765 nt15.35■□□□□ 0.05
YRF1-2P40105 SOR2YDL246C 1074 nt15.35■□□□□ 0.05
YRF1-2P40105 SOR1YJR159W 1074 nt15.35■□□□□ 0.05
YRF1-2P40105 DCW1YKL046C 1350 nt15.33■□□□□ 0.04
YRF1-2P40105 YLR235CYLR235C 399 nt15.32■□□□□ 0.04
YRF1-2P40105 YFR018CYFR018C 1092 nt15.32■□□□□ 0.04
YRF1-2P40105 DED1YOR204W 1815 nt15.31■□□□□ 0.04
YRF1-2P40105 PET9YBL030C 957 nt15.28■□□□□ 0.04
YRF1-2P40105 YKL030WYKL030W 606 nt15.24■□□□□ 0.03
YRF1-2P40105 RRD1YIL153W 1182 nt15.23■□□□□ 0.03
YRF1-2P40105 LCB1YMR296C 1677 nt15.22■□□□□ 0.03
YRF1-2P40105 YCL042WYCL042W 360 nt15.19■□□□□ 0.02
YRF1-2P40105 SPT5YML010W 3192 nt15.15■□□□□ 0.02
YRF1-2P40105 FPS1YLL043W 2010 nt15.14■□□□□ 0.01
YRF1-2P40105 FMT1YBL013W 1206 nt15.12■□□□□ 0.01
YRF1-2P40105 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt15.12■□□□□ 0.01
YRF1-2P40105 IRC15YPL017C 1500 nt15.07■□□□□ 0
YRF1-2P40105 RRT5YFR032C 870 nt15.06■□□□□ 0
YRF1-2P40105 EMI2YDR516C 1503 nt15.06■□□□□ 0
YRF1-2P40105 CUE1YMR264W 612 nt15.03■□□□□ -0
YRF1-2P40105 TIM23YNR017W 669 nt15.03■□□□□ -0
YRF1-2P40105 SNF6YHL025W 999 nt15.02□□□□□ -0.01
YRF1-2P40105 DIC1YLR348C 897 nt14.96□□□□□ -0.01
YRF1-2P40105 YDL221WYDL221W 552 nt14.95□□□□□ -0.02
YRF1-2P40105 CWP1YKL096W 720 nt14.89□□□□□ -0.03
YRF1-2P40105 YLR179CYLR179C 606 nt14.84□□□□□ -0.03
YRF1-2P40105 PEX25YPL112C 1185 nt14.83□□□□□ -0.04
YRF1-2P40105 ADH2YMR303C 1047 nt14.82□□□□□ -0.04
YRF1-2P40105 FMP52YER004W 696 nt14.81□□□□□ -0.04
YRF1-2P40105 GIS3YLR094C 1509 nt14.81□□□□□ -0.04
YRF1-2P40105 YIL100WYIL100W 354 nt14.79□□□□□ -0.04
YRF1-2P40105 YPR064WYPR064W 420 nt14.76□□□□□ -0.05
YRF1-2P40105 NAT4YMR069W 858 nt14.71□□□□□ -0.05
YRF1-2P40105 SDH1YKL148C 1923 nt14.69□□□□□ -0.06
YRF1-2P40105 YMR090WYMR090W 684 nt14.68□□□□□ -0.06
YRF1-2P40105 SSA4YER103W 1929 nt14.66□□□□□ -0.06
YRF1-2P40105 WSC2YNL283C 1512 nt14.65□□□□□ -0.06
YRF1-2P40105 SCC4YER147C 1875 nt14.64□□□□□ -0.07
YRF1-2P40105 GLK1YCL040W 1503 nt14.64□□□□□ -0.07
YRF1-2P40105 YFL066CYFL066C 1179 nt14.62□□□□□ -0.07
YRF1-2P40105 TAD3YLR316C 969 nt14.61□□□□□ -0.07
YRF1-2P40105 MSF1YPR047W 1410 nt14.59□□□□□ -0.07
YRF1-2P40105 MIR1YJR077C 936 nt14.54□□□□□ -0.08
YRF1-2P40105 YBR220CYBR220C 1683 nt14.54□□□□□ -0.08
YRF1-2P40105 PCM1YEL058W 1674 nt14.52□□□□□ -0.08
YRF1-2P40105 YMR244WYMR244W 1068 nt14.51□□□□□ -0.09
YRF1-2P40105 YIH1YCR059C 777 nt14.5□□□□□ -0.09
YRF1-2P40105 YNL115CYNL115C 1935 nt14.46□□□□□ -0.09
YRF1-2P40105 YSP3YOR003W 1437 nt14.45□□□□□ -0.1
YRF1-2P40105 GLR1YPL091W 1452 nt14.44□□□□□ -0.1
YRF1-2P40105 YSC84YHR016C 1407 nt14.42□□□□□ -0.1
YRF1-2P40105 AHT1YHR093W 549 nt14.42□□□□□ -0.1
YRF1-2P40105 RBG2YGR173W 1107 nt14.41□□□□□ -0.1
YRF1-2P40105 RNQ1YCL028W 1218 nt14.4□□□□□ -0.1
YRF1-2P40105 BIO4YNR057C 714 nt14.38□□□□□ -0.11
YRF1-2P40105 YLL053CYLL053C 459 nt14.37□□□□□ -0.11
YRF1-2P40105 YNL195CYNL195C 786 nt14.37□□□□□ -0.11
YRF1-2P40105 RRT12YCR045C 1476 nt14.36□□□□□ -0.11
YRF1-2P40105 THI74YDR438W 1113 nt14.35□□□□□ -0.11
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