Protein–RNA interactions for Protein: P27614

CPS1, Carboxypeptidase S, yeastyeast

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CPS1P27614 IMP2'YIL154C 1041 nt16.55■□□□□ 0.24
CPS1P27614 YJL152WYJL152W 360 nt16.46■□□□□ 0.23
CPS1P27614 ALF1YNL148C 765 nt16.44■□□□□ 0.22
CPS1P27614 SUF2tP(AGG)C 72 nt16.41■□□□□ 0.22
CPS1P27614 SUF10tP(AGG)N 72 nt16.41■□□□□ 0.22
CPS1P27614 LPX1YOR084W 1164 nt16.41■□□□□ 0.22
CPS1P27614 MRPL8YJL063C 717 nt16.4■□□□□ 0.22
CPS1P27614 SPP1YPL138C 1062 nt16.36■□□□□ 0.21
CPS1P27614 ERV46YAL042W 1248 nt16.27■□□□□ 0.2
CPS1P27614 YPS1YLR120C 1710 nt16.26■□□□□ 0.19
CPS1P27614 IDH1YNL037C 1083 nt16.26■□□□□ 0.19
CPS1P27614 YDR095CYDR095C 411 nt16.23■□□□□ 0.19
CPS1P27614 YDR433WYDR433W 441 nt16.23■□□□□ 0.19
CPS1P27614 ADO1YJR105W 1023 nt16.2■□□□□ 0.18
CPS1P27614 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt16.19■□□□□ 0.18
CPS1P27614 YEL076CYEL076C 651 nt16.19■□□□□ 0.18
CPS1P27614 YLR464WYLR464W 651 nt16.19■□□□□ 0.18
CPS1P27614 SIS1YNL007C 1059 nt16.17■□□□□ 0.18
CPS1P27614 UBX6YJL048C 1191 nt16.15■□□□□ 0.18
CPS1P27614 TIR4YOR009W 1464 nt16.15■□□□□ 0.18
CPS1P27614 RTG1YOL067C 534 nt16.14■□□□□ 0.17
CPS1P27614 YKR040CYKR040C 504 nt16.1■□□□□ 0.17
CPS1P27614 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt16.09■□□□□ 0.17
CPS1P27614 GBP2YCL011C 1284 nt16.09■□□□□ 0.17
CPS1P27614 MXR2YCL033C 507 nt16.09■□□□□ 0.17
CPS1P27614 ART5YGR068C 1761 nt15.94■□□□□ 0.14
CPS1P27614 YMR057CYMR057C 372 nt15.93■□□□□ 0.14
CPS1P27614 RPP2AYOL039W 321 nt15.93■□□□□ 0.14
CPS1P27614 CAC2YML102W 1407 nt15.9■□□□□ 0.14
CPS1P27614 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt15.87■□□□□ 0.13
CPS1P27614 PTP1YDL230W 1008 nt15.84■□□□□ 0.13
CPS1P27614 HUA1YGR268C 597 nt15.81■□□□□ 0.12
CPS1P27614 PET9YBL030C 957 nt15.8■□□□□ 0.12
CPS1P27614 TCD2YKL027W 1344 nt15.79■□□□□ 0.12
CPS1P27614 GFD2YCL036W 1701 nt15.79■□□□□ 0.12
CPS1P27614 MEP2YNL142W 1500 nt15.73■□□□□ 0.11
CPS1P27614 YDR094WYDR094W 336 nt15.7■□□□□ 0.1
CPS1P27614 DED1YOR204W 1815 nt15.69■□□□□ 0.1
CPS1P27614 FRD1YEL047C 1413 nt15.68■□□□□ 0.1
CPS1P27614 PTH1YHR189W 573 nt15.65■□□□□ 0.1
CPS1P27614 RRD1YIL153W 1182 nt15.61■□□□□ 0.09
CPS1P27614 RTS2YOR077W 699 nt15.6■□□□□ 0.09
CPS1P27614 SPT5YML010W 3192 nt15.58■□□□□ 0.08
CPS1P27614 FPS1YLL043W 2010 nt15.58■□□□□ 0.08
CPS1P27614 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt15.57■□□□□ 0.08
CPS1P27614 DCW1YKL046C 1350 nt15.57■□□□□ 0.08
CPS1P27614 YCL042WYCL042W 360 nt15.52■□□□□ 0.08
CPS1P27614 FMT1YBL013W 1206 nt15.5■□□□□ 0.07
CPS1P27614 YKL030WYKL030W 606 nt15.49■□□□□ 0.07
CPS1P27614 YLR235CYLR235C 399 nt15.45■□□□□ 0.06
CPS1P27614 LCB1YMR296C 1677 nt15.42■□□□□ 0.06
CPS1P27614 SOR2YDL246C 1074 nt15.41■□□□□ 0.06
CPS1P27614 SOR1YJR159W 1074 nt15.41■□□□□ 0.06
CPS1P27614 IRC15YPL017C 1500 nt15.38■□□□□ 0.05
CPS1P27614 EMI2YDR516C 1503 nt15.35■□□□□ 0.05
CPS1P27614 CUE1YMR264W 612 nt15.34■□□□□ 0.05
CPS1P27614 CWP1YKL096W 720 nt15.3■□□□□ 0.04
CPS1P27614 YDL221WYDL221W 552 nt15.27■□□□□ 0.04
CPS1P27614 GIS3YLR094C 1509 nt15.26■□□□□ 0.03
CPS1P27614 ADH2YMR303C 1047 nt15.25■□□□□ 0.03
CPS1P27614 PAU16YKL224C 372 nt15.22■□□□□ 0.03
CPS1P27614 FMP52YER004W 696 nt15.21■□□□□ 0.03
CPS1P27614 SBA1YKL117W 651 nt15.18■□□□□ 0.02
CPS1P27614 TIM23YNR017W 669 nt15.17■□□□□ 0.02
CPS1P27614 YIL100WYIL100W 354 nt15.16■□□□□ 0.02
CPS1P27614 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt15.13■□□□□ 0.01
CPS1P27614 DIC1YLR348C 897 nt15.13■□□□□ 0.01
CPS1P27614 YMR090WYMR090W 684 nt15.13■□□□□ 0.01
CPS1P27614 PRE6YOL038W 765 nt15.13■□□□□ 0.01
CPS1P27614 YFR018CYFR018C 1092 nt15.11■□□□□ 0.01
CPS1P27614 YLR179CYLR179C 606 nt15.08■□□□□ 0
CPS1P27614 RRT5YFR032C 870 nt15.07■□□□□ 0
CPS1P27614 SNF6YHL025W 999 nt15.04■□□□□ -0
CPS1P27614 PCM1YEL058W 1674 nt15.03■□□□□ -0
CPS1P27614 SCC4YER147C 1875 nt15□□□□□ -0.01
CPS1P27614 YPR064WYPR064W 420 nt14.99□□□□□ -0.01
CPS1P27614 SDH1YKL148C 1923 nt14.97□□□□□ -0.01
CPS1P27614 TAD3YLR316C 969 nt14.92□□□□□ -0.02
CPS1P27614 RNQ1YCL028W 1218 nt14.91□□□□□ -0.02
CPS1P27614 WSC2YNL283C 1512 nt14.91□□□□□ -0.02
CPS1P27614 YFL066CYFL066C 1179 nt14.89□□□□□ -0.03
CPS1P27614 YIH1YCR059C 777 nt14.87□□□□□ -0.03
CPS1P27614 AHT1YHR093W 549 nt14.85□□□□□ -0.03
CPS1P27614 YBR220CYBR220C 1683 nt14.84□□□□□ -0.03
CPS1P27614 PEX25YPL112C 1185 nt14.76□□□□□ -0.05
CPS1P27614 YLL053CYLL053C 459 nt14.75□□□□□ -0.05
CPS1P27614 YNL195CYNL195C 786 nt14.75□□□□□ -0.05
CPS1P27614 SSA4YER103W 1929 nt14.74□□□□□ -0.05
CPS1P27614 NAT4YMR069W 858 nt14.71□□□□□ -0.05
CPS1P27614 RRT12YCR045C 1476 nt14.7□□□□□ -0.06
CPS1P27614 YSC84YHR016C 1407 nt14.7□□□□□ -0.06
CPS1P27614 BIO4YNR057C 714 nt14.69□□□□□ -0.06
CPS1P27614 YNL115CYNL115C 1935 nt14.67□□□□□ -0.06
CPS1P27614 FTR1YER145C 1215 nt14.67□□□□□ -0.06
CPS1P27614 BDH1YAL060W 1149 nt14.67□□□□□ -0.06
CPS1P27614 YSP3YOR003W 1437 nt14.66□□□□□ -0.06
CPS1P27614 GAL1YBR020W 1587 nt14.64□□□□□ -0.07
CPS1P27614 SIM1YIL123W 1431 nt14.64□□□□□ -0.07
CPS1P27614 GLK1YCL040W 1503 nt14.61□□□□□ -0.07
CPS1P27614 AQY1YPR192W 918 nt14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12 ms