Protein–RNA interactions for Protein: P25045

LCB1, Serine palmitoyltransferase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LCB1P25045 IMP2'YIL154C 1041 nt14.58□□□□□ -0.08
LCB1P25045 SUF2tP(AGG)C 72 nt14.57□□□□□ -0.08
LCB1P25045 SUF10tP(AGG)N 72 nt14.57□□□□□ -0.08
LCB1P25045 YJL152WYJL152W 360 nt14.55□□□□□ -0.08
LCB1P25045 YPS1YLR120C 1710 nt14.52□□□□□ -0.08
LCB1P25045 YDR095CYDR095C 411 nt14.48□□□□□ -0.09
LCB1P25045 LPX1YOR084W 1164 nt14.47□□□□□ -0.09
LCB1P25045 SPP1YPL138C 1062 nt14.42□□□□□ -0.1
LCB1P25045 SIS1YNL007C 1059 nt14.4□□□□□ -0.1
LCB1P25045 ERV46YAL042W 1248 nt14.36□□□□□ -0.11
LCB1P25045 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt14.35□□□□□ -0.11
LCB1P25045 MRPL8YJL063C 717 nt14.35□□□□□ -0.11
LCB1P25045 IDH1YNL037C 1083 nt14.35□□□□□ -0.11
LCB1P25045 TIR4YOR009W 1464 nt14.35□□□□□ -0.11
LCB1P25045 YDR433WYDR433W 441 nt14.32□□□□□ -0.12
LCB1P25045 RPP2AYOL039W 321 nt14.23□□□□□ -0.13
LCB1P25045 GBP2YCL011C 1284 nt14.23□□□□□ -0.13
LCB1P25045 MXR2YCL033C 507 nt14.23□□□□□ -0.13
LCB1P25045 YKR040CYKR040C 504 nt14.22□□□□□ -0.13
LCB1P25045 ART5YGR068C 1761 nt14.2□□□□□ -0.14
LCB1P25045 RTG1YOL067C 534 nt14.2□□□□□ -0.14
LCB1P25045 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt14.19□□□□□ -0.14
LCB1P25045 YEL076CYEL076C 651 nt14.19□□□□□ -0.14
LCB1P25045 YLR464WYLR464W 651 nt14.19□□□□□ -0.14
LCB1P25045 PTP1YDL230W 1008 nt14.18□□□□□ -0.14
LCB1P25045 YMR057CYMR057C 372 nt14.18□□□□□ -0.14
LCB1P25045 ADO1YJR105W 1023 nt14.16□□□□□ -0.14
LCB1P25045 CAC2YML102W 1407 nt14.13□□□□□ -0.15
LCB1P25045 UBX6YJL048C 1191 nt14.11□□□□□ -0.15
LCB1P25045 MEP2YNL142W 1500 nt14.1□□□□□ -0.15
LCB1P25045 PET9YBL030C 957 nt14.08□□□□□ -0.16
LCB1P25045 SPT5YML010W 3192 nt14.08□□□□□ -0.16
LCB1P25045 GFD2YCL036W 1701 nt14.07□□□□□ -0.16
LCB1P25045 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt14.05□□□□□ -0.16
LCB1P25045 DCW1YKL046C 1350 nt13.97□□□□□ -0.17
LCB1P25045 TCD2YKL027W 1344 nt13.97□□□□□ -0.17
LCB1P25045 DED1YOR204W 1815 nt13.94□□□□□ -0.18
LCB1P25045 RTS2YOR077W 699 nt13.9□□□□□ -0.18
LCB1P25045 FPS1YLL043W 2010 nt13.89□□□□□ -0.19
LCB1P25045 FRD1YEL047C 1413 nt13.89□□□□□ -0.19
LCB1P25045 RRD1YIL153W 1182 nt13.88□□□□□ -0.19
LCB1P25045 HUA1YGR268C 597 nt13.87□□□□□ -0.19
LCB1P25045 PTH1YHR189W 573 nt13.81□□□□□ -0.2
LCB1P25045 FMT1YBL013W 1206 nt13.79□□□□□ -0.2
LCB1P25045 IRC15YPL017C 1500 nt13.78□□□□□ -0.2
LCB1P25045 EMI2YDR516C 1503 nt13.77□□□□□ -0.21
LCB1P25045 YDR094WYDR094W 336 nt13.75□□□□□ -0.21
LCB1P25045 YCL042WYCL042W 360 nt13.71□□□□□ -0.21
LCB1P25045 YDL221WYDL221W 552 nt13.68□□□□□ -0.22
LCB1P25045 CUE1YMR264W 612 nt13.68□□□□□ -0.22
LCB1P25045 SOR2YDL246C 1074 nt13.66□□□□□ -0.22
LCB1P25045 SOR1YJR159W 1074 nt13.66□□□□□ -0.22
LCB1P25045 YKL030WYKL030W 606 nt13.66□□□□□ -0.22
LCB1P25045 GIS3YLR094C 1509 nt13.65□□□□□ -0.22
LCB1P25045 YLR235CYLR235C 399 nt13.63□□□□□ -0.23
LCB1P25045 LCB1YMR296C 1677 nt13.62□□□□□ -0.23
LCB1P25045 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt13.61□□□□□ -0.23
LCB1P25045 CWP1YKL096W 720 nt13.58□□□□□ -0.24
LCB1P25045 ADH2YMR303C 1047 nt13.55□□□□□ -0.24
LCB1P25045 YMR090WYMR090W 684 nt13.54□□□□□ -0.24
LCB1P25045 FMP52YER004W 696 nt13.51□□□□□ -0.25
LCB1P25045 YIL100WYIL100W 354 nt13.5□□□□□ -0.25
LCB1P25045 SCC4YER147C 1875 nt13.44□□□□□ -0.26
LCB1P25045 SDH1YKL148C 1923 nt13.43□□□□□ -0.26
LCB1P25045 TIM23YNR017W 669 nt13.41□□□□□ -0.26
LCB1P25045 DIC1YLR348C 897 nt13.39□□□□□ -0.27
LCB1P25045 PCM1YEL058W 1674 nt13.38□□□□□ -0.27
LCB1P25045 YBR220CYBR220C 1683 nt13.35□□□□□ -0.27
LCB1P25045 SNF6YHL025W 999 nt13.34□□□□□ -0.27
LCB1P25045 PAU16YKL224C 372 nt13.34□□□□□ -0.27
LCB1P25045 SSA4YER103W 1929 nt13.33□□□□□ -0.28
LCB1P25045 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt13.32□□□□□ -0.28
LCB1P25045 YLR179CYLR179C 606 nt13.32□□□□□ -0.28
LCB1P25045 PRE6YOL038W 765 nt13.32□□□□□ -0.28
LCB1P25045 YFR018CYFR018C 1092 nt13.3□□□□□ -0.28
LCB1P25045 RNQ1YCL028W 1218 nt13.26□□□□□ -0.29
LCB1P25045 SBA1YKL117W 651 nt13.25□□□□□ -0.29
LCB1P25045 YPR064WYPR064W 420 nt13.24□□□□□ -0.29
LCB1P25045 YIH1YCR059C 777 nt13.22□□□□□ -0.29
LCB1P25045 WSC2YNL283C 1512 nt13.22□□□□□ -0.29
LCB1P25045 RRT5YFR032C 870 nt13.21□□□□□ -0.29
LCB1P25045 TAD3YLR316C 969 nt13.2□□□□□ -0.3
LCB1P25045 RRT12YCR045C 1476 nt13.2□□□□□ -0.3
LCB1P25045 AHT1YHR093W 549 nt13.17□□□□□ -0.3
LCB1P25045 YNL195CYNL195C 786 nt13.16□□□□□ -0.3
LCB1P25045 YFL066CYFL066C 1179 nt13.15□□□□□ -0.3
LCB1P25045 YLL053CYLL053C 459 nt13.13□□□□□ -0.31
LCB1P25045 BIO4YNR057C 714 nt13.08□□□□□ -0.32
LCB1P25045 YSC84YHR016C 1407 nt13.06□□□□□ -0.32
LCB1P25045 SIM1YIL123W 1431 nt13.04□□□□□ -0.32
LCB1P25045 YHL050CYHL050C 2094 nt13.03□□□□□ -0.32
LCB1P25045 FTR1YER145C 1215 nt13.03□□□□□ -0.32
LCB1P25045 GAL1YBR020W 1587 nt13.02□□□□□ -0.33
LCB1P25045 BDH1YAL060W 1149 nt13.01□□□□□ -0.33
LCB1P25045 PEX25YPL112C 1185 nt13□□□□□ -0.33
LCB1P25045 TRM5YHR070W 1500 nt12.98□□□□□ -0.33
LCB1P25045 YSP3YOR003W 1437 nt12.98□□□□□ -0.33
LCB1P25045 AQY1YPR192W 918 nt12.95□□□□□ -0.34
LCB1P25045 YNL115CYNL115C 1935 nt12.95□□□□□ -0.34
LCB1P25045 STB1YNL309W 1263 nt12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms