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Protein–RNA interactions for Protein: P22148
MSN1, Protein MSN1, yeast
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382 aa
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
MSN1
P22148
YJL118W
YJL118W
660 nt
9.95
□□□□□ -0.82
MSN1
P22148
INM2
YDR287W
879 nt
9.94
□□□□□ -0.82
MSN1
P22148
RKM5
YLR137W
1104 nt
9.94
□□□□□ -0.82
MSN1
P22148
FRE6
YLL051C
2139 nt
9.92
□□□□□ -0.82
MSN1
P22148
SRN2
YLR119W
642 nt
9.91
□□□□□ -0.82
MSN1
P22148
BMT5
YIL096C
1011 nt
9.9
□□□□□ -0.82
MSN1
P22148
FPR4
YLR449W
1179 nt
9.9
□□□□□ -0.82
MSN1
P22148
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YIR018C-A
138 nt
9.89
□□□□□ -0.83
MSN1
P22148
LSM3
YLR438C-A
270 nt
9.89
□□□□□ -0.83
MSN1
P22148
DAL1
YIR027C
1383 nt
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□□□□□ -0.83
MSN1
P22148
YBL100C
YBL100C
315 nt
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□□□□□ -0.83
MSN1
P22148
SPT5
YML010W
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MSN1
P22148
BSC6
YOL137W
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□□□□□ -0.84
MSN1
P22148
TRM9
YML014W
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□□□□□ -0.84
MSN1
P22148
BDF1
YLR399C
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MSN1
P22148
COG1
YGL223C
1254 nt
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□□□□□ -0.84
MSN1
P22148
YMR057C
YMR057C
372 nt
9.78
□□□□□ -0.84
MSN1
P22148
YPL041C
YPL041C
624 nt
9.78
□□□□□ -0.84
MSN1
P22148
YNL067W-A
YNL067W-A
147 nt
9.77
□□□□□ -0.85
MSN1
P22148
PHO4
YFR034C
939 nt
9.76
□□□□□ -0.85
MSN1
P22148
FIS1
YIL065C
468 nt
9.76
□□□□□ -0.85
MSN1
P22148
tM(CAU)C
tM(CAU)C
72 nt
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□□□□□ -0.85
MSN1
P22148
IMT4
tM(CAU)E
72 nt
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□□□□□ -0.85
MSN1
P22148
IMT3
tM(CAU)J3
72 nt
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□□□□□ -0.85
MSN1
P22148
IMT1
tM(CAU)O1
72 nt
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□□□□□ -0.85
MSN1
P22148
IMT2
tM(CAU)P
72 nt
9.75
□□□□□ -0.85
MSN1
P22148
FTH1
YBR207W
1398 nt
9.73
□□□□□ -0.85
MSN1
P22148
FUN26
YAL022C
1554 nt
9.71
□□□□□ -0.85
MSN1
P22148
YHM2
YMR241W
945 nt
9.71
□□□□□ -0.86
MSN1
P22148
UME6
YDR207C
2511 nt
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□□□□□ -0.86
MSN1
P22148
PUS2
YGL063W
1113 nt
9.7
□□□□□ -0.86
MSN1
P22148
YLR281C
YLR281C
468 nt
9.7
□□□□□ -0.86
MSN1
P22148
HMT1
YBR034C
1047 nt
9.69
□□□□□ -0.86
MSN1
P22148
YJL225C
YJL225C
5277 nt
9.67
□□□□□ -0.86
MSN1
P22148
ALF1
YNL148C
765 nt
9.66
□□□□□ -0.86
MSN1
P22148
WHI5
YOR083W
888 nt
9.66
□□□□□ -0.86
MSN1
P22148
SUF2
tP(AGG)C
72 nt
9.65
□□□□□ -0.86
MSN1
P22148
SUF10
tP(AGG)N
72 nt
9.65
□□□□□ -0.86
MSN1
P22148
TAT1
YBR069C
1860 nt
9.64
□□□□□ -0.87
MSN1
P22148
CCT6
YDR188W
1641 nt
9.62
□□□□□ -0.87
MSN1
P22148
YTH1
YPR107C
627 nt
9.6
□□□□□ -0.87
MSN1
P22148
IMP2'
YIL154C
1041 nt
9.58
□□□□□ -0.88
MSN1
P22148
ARP10
YDR106W
855 nt
9.57
□□□□□ -0.88
MSN1
P22148
UTP6
YDR449C
1323 nt
9.56
□□□□□ -0.88
MSN1
P22148
YPL071C
YPL071C
471 nt
9.56
□□□□□ -0.88
MSN1
P22148
YLR154C-G
YLR154C-G
150 nt
9.54
□□□□□ -0.88
MSN1
P22148
DSK2
YMR276W
1122 nt
9.52
□□□□□ -0.89
MSN1
P22148
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YDR510C-A
117 nt
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□□□□□ -0.89
MSN1
P22148
BNS1
YGR230W
414 nt
9.5
□□□□□ -0.89
MSN1
P22148
RPM1
RPM1
483 nt
9.49
□□□□□ -0.89
MSN1
P22148
FMP45
YDL222C
930 nt
9.47
□□□□□ -0.89
MSN1
P22148
FAF1
YIL019W
1041 nt
9.47
□□□□□ -0.89
MSN1
P22148
YJL152W
YJL152W
360 nt
9.47
□□□□□ -0.89
MSN1
P22148
STB1
YNL309W
1263 nt
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MSN1
P22148
PUS5
YLR165C
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□□□□□ -0.9
MSN1
P22148
RDN37-1
RDN37-1
5354 nt
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□□□□□ -0.9
MSN1
P22148
RDN37-2
RDN37-2
5354 nt
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MSN1
P22148
YPS1
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MSN1
P22148
SEM1
YDR363W-A
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MSN1
P22148
RSC4
YKR008W
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MSN1
P22148
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YDR095C
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□□□□□ -0.9
MSN1
P22148
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YHR165W-A
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□□□□□ -0.9
MSN1
P22148
REC114
YMR133W
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MSN1
P22148
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YGR131W
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MSN1
P22148
YCH1
YGR203W
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MSN1
P22148
IDH1
YNL037C
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9.39
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MSN1
P22148
NAS6
YGR232W
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MSN1
P22148
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YLR236C
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□□□□□ -0.91
MSN1
P22148
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YLR423C
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MSN1
P22148
SIS1
YNL007C
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□□□□□ -0.91
MSN1
P22148
SKG1
YKR100C
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MSN1
P22148
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YOL039W
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MSN1
P22148
XDJ1
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□□□□□ -0.92
MSN1
P22148
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YDR509W
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□□□□□ -0.92
MSN1
P22148
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YPR011C
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P22148
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YDR433W
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P22148
Q0144
Q0144
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MSN1
P22148
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P22148
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P22148
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YCL048W-A
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MSN1
P22148
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MSN1
P22148
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MSN1
P22148
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P22148
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YJL107C
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P22148
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P22148
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MSN1
P22148
snR78
snR78
87 nt
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□□□□□ -0.94
MSN1
P22148
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P22148
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YNL142W
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P22148
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P22148
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MSN1
P22148
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YKR040C
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MSN1
P22148
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□□□□□ -0.94
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P22148
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□□□□□ -0.94
MSN1
P22148
SWP1
YMR149W
861 nt
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□□□□□ -0.94
MSN1
P22148
YNR068C
YNR068C
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□□□□□ -0.94
MSN1
P22148
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MSN1
P22148
THP3
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MSN1
P22148
TCD2
YKL027W
1344 nt
9.12
□□□□□ -0.95
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