Protein–RNA interactions for Protein: P22007

RAM1, Protein farnesyltransferase subunit beta, yeastyeast

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RAM1P22007 BUD23YCR047C 828 nt12.8□□□□□ -0.36
RAM1P22007 DAL1YIR027C 1383 nt12.79□□□□□ -0.36
RAM1P22007 TRM9YML014W 840 nt12.78□□□□□ -0.36
RAM1P22007 IMP2'YIL154C 1041 nt12.77□□□□□ -0.37
RAM1P22007 YCH1YGR203W 447 nt12.76□□□□□ -0.37
RAM1P22007 YLR236CYLR236C 324 nt12.74□□□□□ -0.37
RAM1P22007 FPR4YLR449W 1179 nt12.73□□□□□ -0.37
RAM1P22007 FIS1YIL065C 468 nt12.72□□□□□ -0.37
RAM1P22007 FUN26YAL022C 1554 nt12.71□□□□□ -0.37
RAM1P22007 YLR154C-GYLR154C-G 150 nt12.69□□□□□ -0.38
RAM1P22007 BUR6YER159C 429 nt12.67□□□□□ -0.38
RAM1P22007 PHO4YFR034C 939 nt12.65□□□□□ -0.38
RAM1P22007 CCT6YDR188W 1641 nt12.64□□□□□ -0.39
RAM1P22007 BMT5YIL096C 1011 nt12.63□□□□□ -0.39
RAM1P22007 ADO1YJR105W 1023 nt12.6□□□□□ -0.39
RAM1P22007 Q0144Q0144 330 nt12.56□□□□□ -0.4
RAM1P22007 YEL076C-AYEL076C-A 651 nt12.53□□□□□ -0.4
RAM1P22007 YEL076CYEL076C 651 nt12.53□□□□□ -0.4
RAM1P22007 YLR464WYLR464W 651 nt12.53□□□□□ -0.4
RAM1P22007 Q0010Q0010 387 nt12.52□□□□□ -0.41
RAM1P22007 UBX6YJL048C 1191 nt12.5□□□□□ -0.41
RAM1P22007 ERV46YAL042W 1248 nt12.49□□□□□ -0.41
RAM1P22007 LPX1YOR084W 1164 nt12.49□□□□□ -0.41
RAM1P22007 SUF2tP(AGG)C 72 nt12.48□□□□□ -0.41
RAM1P22007 SUF10tP(AGG)N 72 nt12.48□□□□□ -0.41
RAM1P22007 SPP1YPL138C 1062 nt12.45□□□□□ -0.42
RAM1P22007 SEM1YDR363W-A 270 nt12.44□□□□□ -0.42
RAM1P22007 RTG1YOL067C 534 nt12.44□□□□□ -0.42
RAM1P22007 YJL152WYJL152W 360 nt12.42□□□□□ -0.42
RAM1P22007 SIS1YNL007C 1059 nt12.42□□□□□ -0.42
RAM1P22007 IDH1YNL037C 1083 nt12.4□□□□□ -0.42
RAM1P22007 ALF1YNL148C 765 nt12.4□□□□□ -0.42
RAM1P22007 YIR018C-AYIR018C-A 138 nt12.38□□□□□ -0.43
RAM1P22007 SSA4YER103W 1929 nt12.36□□□□□ -0.43
RAM1P22007 YKR040CYKR040C 504 nt12.34□□□□□ -0.43
RAM1P22007 YDR433WYDR433W 441 nt12.33□□□□□ -0.44
RAM1P22007 SRN2YLR119W 642 nt12.33□□□□□ -0.44
RAM1P22007 SPT5YML010W 3192 nt12.3□□□□□ -0.44
RAM1P22007 YPS1YLR120C 1710 nt12.25□□□□□ -0.45
RAM1P22007 YDR095CYDR095C 411 nt12.24□□□□□ -0.45
RAM1P22007 GBP2YCL011C 1284 nt12.23□□□□□ -0.45
RAM1P22007 HUA1YGR268C 597 nt12.21□□□□□ -0.45
RAM1P22007 ARA2YMR041C 1008 nt12.2□□□□□ -0.46
RAM1P22007 YDR094WYDR094W 336 nt12.19□□□□□ -0.46
RAM1P22007 MXR2YCL033C 507 nt12.18□□□□□ -0.46
RAM1P22007 TIR4YOR009W 1464 nt12.18□□□□□ -0.46
RAM1P22007 Q0142Q0142 177 nt12.17□□□□□ -0.46
RAM1P22007 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt12.11□□□□□ -0.47
RAM1P22007 CAC2YML102W 1407 nt12.08□□□□□ -0.48
RAM1P22007 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt12.06□□□□□ -0.48
RAM1P22007 Q0017Q0017 162 nt12.06□□□□□ -0.48
RAM1P22007 YCR099CYCR099C 468 nt12.02□□□□□ -0.49
RAM1P22007 RPP2AYOL039W 321 nt12.02□□□□□ -0.49
RAM1P22007 TCD2YKL027W 1344 nt12.02□□□□□ -0.49
RAM1P22007 ARP10YDR106W 855 nt12.01□□□□□ -0.49
RAM1P22007 AI3Q0060 1248 nt12□□□□□ -0.49
RAM1P22007 YCL048W-AYCL048W-A 240 nt12□□□□□ -0.49
RAM1P22007 ART5YGR068C 1761 nt12□□□□□ -0.49
RAM1P22007 PET9YBL030C 957 nt11.99□□□□□ -0.49
RAM1P22007 YMR057CYMR057C 372 nt11.98□□□□□ -0.49
RAM1P22007 BDF1YLR399C 2061 nt11.96□□□□□ -0.49
RAM1P22007 FRD1YEL047C 1413 nt11.95□□□□□ -0.5
RAM1P22007 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt11.95□□□□□ -0.5
RAM1P22007 YLR122CYLR122C 378 nt11.94□□□□□ -0.5
RAM1P22007 PTP1YDL230W 1008 nt11.92□□□□□ -0.5
RAM1P22007 DED1YOR204W 1815 nt11.91□□□□□ -0.5
RAM1P22007 ABZ2YMR289W 1125 nt11.89□□□□□ -0.51
RAM1P22007 YKL030WYKL030W 606 nt11.88□□□□□ -0.51
RAM1P22007 GFD2YCL036W 1701 nt11.88□□□□□ -0.51
RAM1P22007 Q0255Q0255 1419 nt11.87□□□□□ -0.51
RAM1P22007 PAC11YDR488C 1602 nt11.86□□□□□ -0.51
RAM1P22007 PTH1YHR189W 573 nt11.85□□□□□ -0.51
RAM1P22007 RRD1YIL153W 1182 nt11.84□□□□□ -0.51
RAM1P22007 YLR235CYLR235C 399 nt11.84□□□□□ -0.51
RAM1P22007 PET20YPL159C 762 nt11.84□□□□□ -0.51
RAM1P22007 MET8YBR213W 825 nt11.84□□□□□ -0.51
RAM1P22007 AI5_BETAQ0075 1065 nt11.8□□□□□ -0.52
RAM1P22007 TAT1YBR069C 1860 nt11.79□□□□□ -0.52
RAM1P22007 YCL042WYCL042W 360 nt11.79□□□□□ -0.52
RAM1P22007 MEP2YNL142W 1500 nt11.77□□□□□ -0.52
RAM1P22007 FPS1YLL043W 2010 nt11.77□□□□□ -0.53
RAM1P22007 LCB1YMR296C 1677 nt11.76□□□□□ -0.53
RAM1P22007 SOR2YDL246C 1074 nt11.76□□□□□ -0.53
RAM1P22007 SOR1YJR159W 1074 nt11.76□□□□□ -0.53
RAM1P22007 SBA1YKL117W 651 nt11.76□□□□□ -0.53
RAM1P22007 FMT1YBL013W 1206 nt11.74□□□□□ -0.53
RAM1P22007 UTP6YDR449C 1323 nt11.73□□□□□ -0.53
RAM1P22007 CLB6YGR109C 1143 nt11.71□□□□□ -0.53
RAM1P22007 YOR169CYOR169C 465 nt11.71□□□□□ -0.53
RAM1P22007 TOM20YGR082W 552 nt11.7□□□□□ -0.54
RAM1P22007 PAU16YKL224C 372 nt11.7□□□□□ -0.54
RAM1P22007 YFR018CYFR018C 1092 nt11.68□□□□□ -0.54
RAM1P22007 YGL188CYGL188C 174 nt11.67□□□□□ -0.54
RAM1P22007 RRT5YFR032C 870 nt11.64□□□□□ -0.55
RAM1P22007 SKG1YKR100C 1068 nt11.64□□□□□ -0.55
RAM1P22007 snR78snR78 87 nt11.63□□□□□ -0.55
RAM1P22007 RTS2YOR077W 699 nt11.63□□□□□ -0.55
RAM1P22007 FMP52YER004W 696 nt11.61□□□□□ -0.55
RAM1P22007 tL(GAG)GtL(GAG)G 82 nt11.61□□□□□ -0.55
RAM1P22007 DCW1YKL046C 1350 nt11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms