Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.176e-7■□□□□ 8.8
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PRPF4O43172 ING5-209ENST00000489509 920 ntTSL 214.3□□□□□ -0.126e-7■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 ING5-211ENST00000493261 543 ntTSL 210.27□□□□□ -0.776e-7■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 ING5-204ENST00000445620 662 ntTSL 36.51□□□□□ -1.376e-7■□□□□ 8.8
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PRPF4O43172 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.88■□□□□ 0.291e-6■□□□□ 8.8
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PRPF4O43172 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.121e-6■□□□□ 8.8
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PRPF4O43172 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.211e-6■□□□□ 8.8
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PRPF4O43172 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.443e-6■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.343e-6■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 FAM3C-202ENST00000412653 561 ntTSL 415.73■□□□□ 0.113e-6■□□□□ 8.8
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PRPF4O43172 NRDC-205ENST00000468722 754 ntTSL 314.9□□□□□ -0.022e-9■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.053e-6■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 YWHAQ-202ENST00000381844 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.123e-6■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 NRDC-202ENST00000354831 3895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.172e-9■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 NRDC-214ENST00000544028 3819 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.262e-9■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 WDR83OS-202ENST00000596731 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.283e-6■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 HSPA8-203ENST00000524552 963 ntTSL 1 (best)12.18□□□□□ -0.463e-6■□□□□ 8.8
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PRPF4O43172 RPL4-201ENST00000307961 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.575e-22■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 RPL4-214ENST00000567229 2003 ntTSL 511.51□□□□□ -0.575e-22■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 RPL4-215ENST00000568588 1864 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.695e-22■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 WDR83OS-204ENST00000600694 567 ntTSL 410.67□□□□□ -0.73e-6■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 SF3B2-204ENST00000525207 493 ntTSL 28.99□□□□□ -0.973e-6■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 RPL4-209ENST00000565723 408 ntTSL 38.95□□□□□ -0.985e-22■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 CHD4-204ENST00000535810 607 ntTSL 28.39□□□□□ -1.073e-6■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 AKAP8L-206ENST00000595087 796 ntTSL 27.78□□□□□ -1.163e-6■□□□□ 8.8
PRPF4O43172 RPL4-203ENST00000561775 1396 ntTSL 57.55□□□□□ -1.25e-22■□□□□ 8.8
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