Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Q6

Speer4f1, MCG6381, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Speer4f1Q9D5Q6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Speer4f1Q9D5Q6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Speer4f1Q9D5Q6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Speer4f1Q9D5Q6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms