Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
APOBEC4Q8WW27 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APOBEC4Q8WW27 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
APOBEC4Q8WW27 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms