Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Zic3Q62521 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Zic3Q62521 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Zic3Q62521 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms