Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 ATP1YBL099W 1638 nt4.97□□□□□ -1.61
USB1Q12208 PPR1YLR014C 2715 nt4.97□□□□□ -1.61
USB1Q12208 YDL057WYDL057W 987 nt4.97□□□□□ -1.61
USB1Q12208 YER010CYER010C 705 nt4.97□□□□□ -1.61
USB1Q12208 SNZ3YFL059W 897 nt4.97□□□□□ -1.61
USB1Q12208 SNZ2YNL333W 897 nt4.97□□□□□ -1.61
USB1Q12208 RAD53YPL153C 2466 nt4.97□□□□□ -1.61
USB1Q12208 UGX2YDL169C 672 nt4.96□□□□□ -1.62
USB1Q12208 RMA1YKL132C 1293 nt4.96□□□□□ -1.62
USB1Q12208 SNN1YNL086W 309 nt4.96□□□□□ -1.62
USB1Q12208 YOL131WYOL131W 327 nt4.96□□□□□ -1.62
USB1Q12208 AMD1YML035C 2433 nt4.96□□□□□ -1.62
USB1Q12208 MRC1YCL061C 3291 nt4.95□□□□□ -1.62
USB1Q12208 COR1YBL045C 1374 nt4.95□□□□□ -1.62
USB1Q12208 PRS2YER099C 957 nt4.95□□□□□ -1.62
USB1Q12208 ECM19YLR390W 339 nt4.95□□□□□ -1.62
USB1Q12208 CPA1YOR303W 1236 nt4.95□□□□□ -1.62
USB1Q12208 MLC2YPR188C 492 nt4.95□□□□□ -1.62
USB1Q12208 HAS1YMR290C 1518 nt4.95□□□□□ -1.62
USB1Q12208 MNS1YJR131W 1650 nt4.95□□□□□ -1.62
USB1Q12208 KEL1YHR158C 3495 nt4.95□□□□□ -1.62
USB1Q12208 YEH1YLL012W 1722 nt4.94□□□□□ -1.62
USB1Q12208 MET7YOR241W 1647 nt4.94□□□□□ -1.62
USB1Q12208 MRK1YDL079C 1506 nt4.94□□□□□ -1.62
USB1Q12208 ARO10YDR380W 1908 nt4.94□□□□□ -1.62
USB1Q12208 DUR1,2YBR208C 5508 nt4.94□□□□□ -1.62
USB1Q12208 CHO1YER026C 831 nt4.94□□□□□ -1.62
USB1Q12208 YLR126CYLR126C 756 nt4.94□□□□□ -1.62
USB1Q12208 RPS9AYPL081W 594 nt4.94□□□□□ -1.62
USB1Q12208 ATG12YBR217W 561 nt4.94□□□□□ -1.62
USB1Q12208 ABZ1YNR033W 2364 nt4.94□□□□□ -1.62
USB1Q12208 PIF1YML061C 2580 nt4.94□□□□□ -1.62
USB1Q12208 CTS2YDR371W 1536 nt4.93□□□□□ -1.62
USB1Q12208 SMF2YHR050W 1650 nt4.93□□□□□ -1.62
USB1Q12208 TUL1YKL034W 2277 nt4.93□□□□□ -1.62
USB1Q12208 YDR401WYDR401W 564 nt4.93□□□□□ -1.62
USB1Q12208 DFM1YDR411C 1026 nt4.93□□□□□ -1.62
USB1Q12208 ASK1YKL052C 879 nt4.93□□□□□ -1.62
USB1Q12208 DRS1YLL008W 2259 nt4.93□□□□□ -1.62
USB1Q12208 YML082WYML082W 1950 nt4.93□□□□□ -1.62
USB1Q12208 NSI1YDR026C 1713 nt4.92□□□□□ -1.62
USB1Q12208 YDL114WYDL114W 927 nt4.92□□□□□ -1.62
USB1Q12208 YKR073CYKR073C 321 nt4.92□□□□□ -1.62
USB1Q12208 PDR16YNL231C 1056 nt4.92□□□□□ -1.62
USB1Q12208 ODC2YOR222W 924 nt4.92□□□□□ -1.62
USB1Q12208 YFL042CYFL042C 2025 nt4.92□□□□□ -1.62
USB1Q12208 ROG3YFR022W 2202 nt4.92□□□□□ -1.62
USB1Q12208 ISN1YOR155C 1353 nt4.91□□□□□ -1.62
USB1Q12208 GUA1YMR217W 1578 nt4.91□□□□□ -1.62
USB1Q12208 PKC1YBL105C 3456 nt4.91□□□□□ -1.62
USB1Q12208 CLB1YGR108W 1416 nt4.91□□□□□ -1.62
USB1Q12208 YDL022C-AYDL022C-A 249 nt4.91□□□□□ -1.62
USB1Q12208 CTR2YHR175W 570 nt4.91□□□□□ -1.62
USB1Q12208 APS3YJL024C 585 nt4.91□□□□□ -1.62
USB1Q12208 YLR317WYLR317W 435 nt4.91□□□□□ -1.62
USB1Q12208 YIR007WYIR007W 2295 nt4.91□□□□□ -1.62
USB1Q12208 GPA2YER020W 1350 nt4.91□□□□□ -1.62
USB1Q12208 MCM6YGL201C 3054 nt4.91□□□□□ -1.62
USB1Q12208 YCL065WYCL065W 369 nt4.9□□□□□ -1.63
USB1Q12208 SHP1YBL058W 1272 nt4.9□□□□□ -1.63
USB1Q12208 PFA3YNL326C 1011 nt4.9□□□□□ -1.63
USB1Q12208 MKC7YDR144C 1791 nt4.9□□□□□ -1.63
USB1Q12208 OXP1YKL215C 3861 nt4.9□□□□□ -1.63
USB1Q12208 KEX2YNL238W 2445 nt4.89□□□□□ -1.63
USB1Q12208 PUF3YLL013C 2640 nt4.89□□□□□ -1.63
USB1Q12208 YEA6YEL006W 1008 nt4.89□□□□□ -1.63
USB1Q12208 RRP4YHR069C 1080 nt4.89□□□□□ -1.63
USB1Q12208 EGD2YHR193C 525 nt4.89□□□□□ -1.63
USB1Q12208 FAF1YIL019W 1041 nt4.89□□□□□ -1.63
USB1Q12208 GFD1YMR255W 567 nt4.89□□□□□ -1.63
USB1Q12208 DOM34YNL001W 1161 nt4.89□□□□□ -1.63
USB1Q12208 IES1YFL013C 2079 nt4.88□□□□□ -1.63
USB1Q12208 MTC5YDR128W 3447 nt4.88□□□□□ -1.63
USB1Q12208 YRA1YDR381W 681 nt4.88□□□□□ -1.63
USB1Q12208 SEC20YDR498C 1152 nt4.88□□□□□ -1.63
USB1Q12208 IRC7YFR055W 1023 nt4.88□□□□□ -1.63
USB1Q12208 PAN6YIL145C 930 nt4.88□□□□□ -1.63
USB1Q12208 SPO7YAL009W 780 nt4.88□□□□□ -1.63
USB1Q12208 NRM1YNR009W 750 nt4.88□□□□□ -1.63
USB1Q12208 YOR200WYOR200W 399 nt4.88□□□□□ -1.63
USB1Q12208 CSG2YBR036C 1233 nt4.88□□□□□ -1.63
USB1Q12208 HIR1YBL008W 2523 nt4.88□□□□□ -1.63
USB1Q12208 SNT2YGL131C 4212 nt4.88□□□□□ -1.63
USB1Q12208 BUD14YAR014C 2130 nt4.87□□□□□ -1.63
USB1Q12208 MDH3YDL078C 1032 nt4.87□□□□□ -1.63
USB1Q12208 PHM8YER037W 966 nt4.87□□□□□ -1.63
USB1Q12208 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt4.87□□□□□ -1.63
USB1Q12208 PRP46YPL151C 1356 nt4.87□□□□□ -1.63
USB1Q12208 QDR3YBR043C 2070 nt4.87□□□□□ -1.63
USB1Q12208 HSF1YGL073W 2502 nt4.86□□□□□ -1.63
USB1Q12208 ATO3YDR384C 828 nt4.86□□□□□ -1.63
USB1Q12208 ERP5YHR110W 639 nt4.86□□□□□ -1.63
USB1Q12208 HCR1YLR192C 798 nt4.86□□□□□ -1.63
USB1Q12208 SNO4YMR322C 714 nt4.86□□□□□ -1.63
USB1Q12208 HSP33YOR391C 714 nt4.86□□□□□ -1.63
USB1Q12208 HSP32YPL280W 714 nt4.86□□□□□ -1.63
USB1Q12208 YDL172CYDL172C 480 nt4.85□□□□□ -1.63
USB1Q12208 SIP2YGL208W 1248 nt4.85□□□□□ -1.63
USB1Q12208 RPR2YIR015W 435 nt4.85□□□□□ -1.63
USB1Q12208 RPS15YOL040C 429 nt4.85□□□□□ -1.63
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